- Coser-commits - mailman.cloud.codelutin.com

r733 - in trunk/src/site: en/rst/user resources/images/fr rst/user
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 10 Feb '11

10 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-10 10:18:00 +0000 (Thu, 10 Feb 2011) New Revision: 733 Log: Update doc Modified: trunk/src/site/en/rst/user/configuration.rst trunk/src/site/resources/images/fr/90-configurationpath.png trunk/src/site/resources/images/fr/91-configurationvalues.png trunk/src/site/rst/user/configuration.rst Modified: trunk/src/site/en/rst/user/configuration.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/configuration.rst 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) +++ trunk/src/site/en/rst/user/configuration.rst 2011-02-10 10:18:00 UTC (rev 733) @@ -38,8 +38,11 @@ In this wizard, you can define following options: coser.projects.directory - Coser projects location directory. + Coser projects directory location. +coser.validator.directory + Coser controls directory localtion. Used to store user custom validators. + coser.reference.species Taxonomy reference file location. Modified: trunk/src/site/resources/images/fr/90-configurationpath.png =================================================================== (Binary files differ) Modified: trunk/src/site/resources/images/fr/91-configurationvalues.png =================================================================== (Binary files differ) Modified: trunk/src/site/rst/user/configuration.rst =================================================================== --- trunk/src/site/rst/user/configuration.rst 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) +++ trunk/src/site/rst/user/configuration.rst 2011-02-10 10:18:00 UTC (rev 733) @@ -39,8 +39,12 @@ Dans cette fenêtre, il est possible de configurer les options: coser.projects.directory - Dossier où sont stocké les projets de Coser. + Dossier où sont stockés les projets de Coser. +coser.validator.directory + Dossier où sont stockés les fichiers de contrôle dans le cas où + l'utilisateur souhaite les personnaliser. + coser.reference.species Emplacement du fichier référentiel taxonomique.

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r732 - in trunk: . coser-business coser-ui coser-web
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 11:17:19 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 732 Log: [maven-release-plugin] prepare for next development iteration Modified: trunk/coser-business/pom.xml trunk/coser-ui/pom.xml trunk/coser-web/pom.xml trunk/pom.xml Modified: trunk/coser-business/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 11:17:14 UTC (rev 731) +++ trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0</version> + <version>1.0.1-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-ui/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 11:17:14 UTC (rev 731) +++ trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0</version> + <version>1.0.1-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-web/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 11:17:14 UTC (rev 731) +++ trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0</version> + <version>1.0.1-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-02-09 11:17:14 UTC (rev 731) +++ trunk/pom.xml 2011-02-09 11:17:19 UTC (rev 732) @@ -11,7 +11,7 @@ <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0</version> + <version>1.0.1-SNAPSHOT</version> <packaging>pom</packaging> <modules> @@ -319,9 +319,9 @@ </properties> <scm> - <connection>scm:svn:svn://anonymous at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/tags/coser-1.0</connection> - <developerConnection>scm:svn:svn+ssh://chatellier at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/tags/coser-1.0</developerConnection> - <url>http://labs.libre-entreprise.org/scm/viewvc.php/tags/coser-1.0?root=coser</url> + <connection>scm:svn:svn://anonymous at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/trunk</connection> + <developerConnection>scm:svn:svn+ssh://chatellier at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/trunk</developerConnection> + <url>http://labs.libre-entreprise.org/scm/viewvc.php/trunk/?root=coser</url> </scm> <build>

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r731 - tags
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 11:17:14 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 731 Log: [maven-release-plugin] copy for tag coser-1.0 Added: tags/coser-1.0/

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r730 - in trunk: . coser-business coser-ui coser-web
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 11:17:10 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 730 Log: [maven-release-plugin] prepare release coser-1.0 Modified: trunk/coser-business/pom.xml trunk/coser-ui/pom.xml trunk/coser-web/pom.xml trunk/pom.xml Modified: trunk/coser-business/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) +++ trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 11:17:10 UTC (rev 730) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-SNAPSHOT</version> + <version>1.0</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-ui/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) +++ trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 11:17:10 UTC (rev 730) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-SNAPSHOT</version> + <version>1.0</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-web/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) +++ trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 11:17:10 UTC (rev 730) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-SNAPSHOT</version> + <version>1.0</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) +++ trunk/pom.xml 2011-02-09 11:17:10 UTC (rev 730) @@ -11,7 +11,7 @@ <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-SNAPSHOT</version> + <version>1.0</version> <packaging>pom</packaging> <modules> @@ -319,9 +319,9 @@ </properties> <scm> - <connection>scm:svn:svn://anonymous at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/trunk</connection> - <developerConnection>scm:svn:svn+ssh://chatellier at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/trunk</developerConnection> - <url>http://labs.libre-entreprise.org/scm/viewvc.php/trunk/?root=coser</url> + <connection>scm:svn:svn://anonymous at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/tags/coser-1.0</connection> + <developerConnection>scm:svn:svn+ssh://chatellier at labs.libre-entreprise.org/svnroot/coser/tags/coser-1.0</developerConnection> + <url>http://labs.libre-entreprise.org/scm/viewvc.php/tags/coser-1.0?root=coser</url> </scm> <build>

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r729 - in trunk/src/site/en/rst: . user
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 11:08:34 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 729 Log: Fix doc Modified: trunk/src/site/en/rst/index.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst Modified: trunk/src/site/en/rst/index.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/index.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) +++ trunk/src/site/en/rst/index.rst 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) @@ -36,10 +36,10 @@ Features ======== - * managing the 4 data files (catches, stratas, lengthes, hauls) - * control errors on teh data format + * managing the 4 data files (catches, strata, lengthes, hauls) + * control errors on the data format * control links with the taxonomic referential (reftax) * modifications historisation * charts generation - * species lsit selection for RSufi (L1, L2, L3 and L4) + * species lists selection for RSufi (L1, L2, L3 and L4) * storing RSufi's results Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) @@ -34,7 +34,7 @@ To do so, display the project creation interface using the menu *File/New project*. The following interface displays : -.. image:: ../images/02-createproject.png +.. image:: ../../images/en/02-createproject.png This interface must contains: @@ -52,21 +52,21 @@ Validation ---------- -After having clicked on the ``Create the project``, the 4 tables and the +After having clicked on the ``Create project``, the 4 tables and the taxonomic referential are loaded into memory. The software checks then than the files are in the correct format (CSV, separator, headers names) then create the project and displays the project summary interface : -.. image:: ../images/04-projectsummary.png +.. image:: ../../images/en/04-projectsummary.png Project reopening ----------------- To reopen a project previously created, you just have to select it in the -*File/Open a project* then click on `Open`: +*File/Open project* then click on `Open`: -.. image:: ../images/03-openproject.png +.. image:: ../../images/en/03-openproject.png It is then possible to go to the control_ or selection_ step. Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) @@ -23,7 +23,7 @@ .. * #L% .. - RSufi Results -=============== +============= Once your selection data have been used in RSufi, it gives you the result that is possible to add in the result list of a selection. @@ -31,14 +31,14 @@ To do so, reopen the concerned selection using the *Data/Selection/<selectionname>* menu and Select the thirs tab ``RSufi``. -.. image:: ../images/25-selectionresults.png +.. image:: ../../images/en/25-selectionresults.png This time, this is the second part on the interface that interest us. It summarize the list of results stored in Coser. To add a new result, click on the button ``Add a result``. -.. image:: ../images/26-selectionaddresult.png +.. image:: ../../images/en/26-selectionaddresult.png A result is compounded of : Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst 2011-02-09 11:08:34 UTC (rev 729) @@ -40,22 +40,22 @@ To do so, use the menu ``Selection/New selection`` -.. image:: ../images/21-selectionmenu0.png +.. image:: ../../images/en/27-selectionmenu0.png **Note**: This menu is available only if the control step have been validated. -.. image:: ../images/20-selectiondetails.png +.. image:: ../../images/en/20-selectiondetail.png This name is mandatory and can contain only alphanumerical characters. You have then to select the years of the selection data. The 4 tables data will be restricted to those years. -.. image:: ../images/21-selectionyears.png +.. image:: ../../images/en/21-selectionyears.png You then need to select the stratas for which you want to select species. -.. image:: ../images/22-selectionstrata.png +.. image:: ../../images/en/22-selectionstrata.png In this step, it is also possible to display sampling effort data by clicking on the table-shape icon. @@ -64,9 +64,9 @@ summarize the list of all the species available after the choice of years and stratas. -.. image:: ../images/23-selectionspecies.png +.. image:: ../../images/en/23-selectionspecies.png -The list ``Filtered species`` correspond to the list of all the species. this +The list ``Filtered species`` correspond to the list of all the species. This list is filterable by the ``Filter by type`` list types. To adjust a species in the L1 list, you have to select it and click on the @@ -78,7 +78,7 @@ * generate catch/length comparison charts * etc… -.. image:: ../images/26-selectionmenu1.png +.. image:: ../../images/en/28-selectionmenu1.png Report @@ -94,7 +94,7 @@ Once the L1 list have been defined, you need to save the selection so that the ``Species list`` tab become active. -.. image:: ../images/24-selectionlists.png +.. image:: ../../images/en/24-selectionlists.png In this screen : @@ -121,7 +121,7 @@ Once the 4 lists are defined and the selection validated, the third tab "RSufi" become active. -.. image: ../images/25-selectionresults.png +.. image: ../../images/en/25-selectionresults.png In this screen, you can export the necessary files for RSufi's execution. Take care, Coser does not pilot RSufi, it only generates the files needed for its @@ -137,6 +137,6 @@ ------ Once RSufi have been executed with your selection, you can go to the -`results storing` step. +`results storing`_ step. .. _results storing: guide_results.html

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r728 - in trunk/src/site/en/rst: . user
by jcouteau＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: jcouteau Date: 2011-02-09 10:51:42 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 728 Log: End of doc translation to english Modified: trunk/src/site/en/rst/index.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst Modified: trunk/src/site/en/rst/index.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/index.rst 2011-02-09 09:17:58 UTC (rev 727) +++ trunk/src/site/en/rst/index.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) @@ -25,5 +25,21 @@ Coser ===== -Contrôle et Sélection RSufi. +Coser (Control and Selection RSufi) is a data control (CSV export from +a database) and data selection before treatment by an external application +(RSufi) software. +The results from RSufi are then stored in the Coser software in order to be +selected and published on the website : +http://www.ifremer.fr/SIH-indices-campagnes. + +Features +======== + + * managing the 4 data files (catches, stratas, lengthes, hauls) + * control errors on teh data format + * control links with the taxonomic referential (reftax) + * modifications historisation + * charts generation + * species lsit selection for RSufi (L1, L2, L3 and L4) + * storing RSufi's results Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst 2011-02-09 09:17:58 UTC (rev 727) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_project.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) @@ -22,54 +22,53 @@ .. * <http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.html>. .. * #L% .. - -Projet -====== +Project +======= -La permière action a effectuer pour traiter les 4 tables de données est de -créer un projet en y renseignant ses paramètres (y compris les 4 tables). +The first thing to do to treat the 4 data tables is to create a project by +filling its parameters (and the 4 tables). Configuration ------------- -Pour se faire, il suffit d'afficher l'interface de création de projet depuis -le menu *Fichier/Nouveau projet*. L'interface suivante s'affiche: +To do so, display the project creation interface using the menu +*File/New project*. The following interface displays : .. image:: ../images/02-createproject.png -Cette interface doit contenir: +This interface must contains: - * le nom du projet (les caracteres autre que les lettres et chiffres - sont interdit) - * le nom de l'auteur (obligatoire) - * les fichiers csv correspondant aux 4 tables (obligatoire) - * les cartes aux format shapes (*.shp) utilisé dans l'étape de sélection - pour affiché la zone d'application sur la carte du monde - * un commentaire + * the project name (only alphanumerical characters are allowed). + * the name of the author (mandatory) + * The csv files correspond to the 4 tables (mandatory) + * the maps in shapes format (*.shp) used in the selection step to display the + application zone on the world map. + * a comment -Il est egalement possible d'utiliser pour ce projet seulement un autre -fichier de référence taxonomique que celui présent dans la configuration -par défaut du logiciel. Il sera utilisé uniquement par ce projet. +It is also possible to use, only for this project, an other taxonomic +referential file than the one present in the default configuration of the +software. It will be used only for this project. Validation ---------- -Après avoir cliqué sur le bouton ``Créer le projet``, les 4 tables et le -référentiel taxonomique sont chargés en mémoire. -Le logiciel vérifie ensuite que les fichiers sont dans le format attendu -(CSV, séparateur, nom des entetes) puis crée le projet et affiche l'interface -de résumé de projet : +After having clicked on the ``Create the project``, the 4 tables and the +taxonomic referential are loaded into memory. +The software checks then than the files are in the correct format (CSV, +separator, headers names) then create the project and displays the project +summary interface : .. image:: ../images/04-projectsummary.png -Réouverture de projet ---------------------- +Project reopening +----------------- -Pour réouvrir un projet précédamment créé, il suffit de le sélectionner -dans l'interface *Fichier/Ouvrir un projet* puis de cliquer sur `Ouvrir`: +To reopen a project previously created, you just have to select it in the +*File/Open a project* then click on `Open`: .. image:: ../images/03-openproject.png -Il est ensuite possible de passer aux étapes de controle_ ou de selection_. +It is then possible to go to the control_ or selection_ step. -.. _controle: guide_control.html -.. _selection: guide_selection.html +.. _control: guide_control.html +.. _selection: guide_selection.html \ No newline at end of file Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst 2011-02-09 09:17:58 UTC (rev 727) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_results.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) @@ -22,46 +22,44 @@ .. * <http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.html>. .. * #L% .. - -Résultats RSufi +RSufi Results =============== -Un fois que les données de votre sélection ont été utilisées pour faire -tourner RSufi, celui ci vous fournit des résultats qu'il est possible -d'ajouter dans la liste des résultats d'une selection. +Once your selection data have been used in RSufi, it gives you the result that +is possible to add in the result list of a selection. -Pour ce faire, réouvrez la sélection concernée via le menu *Données/Sélection/<nomdelaselection>* -et sélectionnez le troisième onglet ``RSufi``. +To do so, reopen the concerned selection using the +*Data/Selection/<selectionname>* menu and Select the thirs tab ``RSufi``. .. image:: ../images/25-selectionresults.png -Cette fois ci, c'est la seconde partie de l'interface qui nous interesse. Elle -récapitule la liste des résultats actuellement enregistré dans Coser. +This time, this is the second part on the interface that interest us. It +summarize the list of results stored in Coser. -Pour ajouter un nouveau résultat, cliquez sur le bouton ``Ajouter un résultat``. +To add a new result, click on the button ``Add a result``. .. image:: ../images/26-selectionaddresult.png -Un résultat est composé de : +A result is compounded of : - * un nom unique parmi les résultats de la sélection (obligatoire et composé - uniquement de caracteres alphanumériques) - * la version de rsufi avec laquelle le résultat a été obtenu (obligatoire) - * la date d'ajout du résultat (obligatoire) - * le fichier de données ``estcomind`̀ (obligatoire) - * le fichier de données ``estpopind`` (obligatoire) + * a name unique amongst the selection results (mandatory and compounded only + of alphanumerical characters) + * the RSufi version with which the result have been obtained (mandatory) + * the result addition date (mandatory) + * the ``estcomind`` data file (mandatory) + * the ``estpopind`` data file (mandatory) -À cela s'ajoute des options facultatives : +You got also optional informations : - * la zone d'application (utilisé lors de la publication de résultat sur - le site internet pour placé un résultat dans un zone définie) - * le répertoire de cartes (utilisé par le site internet pour afficher - les cartes de distribution) - * publiable (utilisé par les administrateurs pour différencier les résultats - publiable des autres résultats) - * autre fichier (fichier supplémentaire devant être concervé par Coser) + * the application zone (used when publishing result in the internet website + to place the results in a defined zone) + * the maps directory (used by the website to display the distribution maps) + * publishable (used by admins to differenciate publishable results from + others) + * other file (other file that needs to be stored by Coser) -Une fois le résultat paramètré sans erreur, cliquer sur ``Ajouter le résultat`` -pour valider l'action. Ce resultat pourra ensuite être sélectionné par les -administrateur de Coser en vue d'être publié sur le site internet : +Once the result is parmaterized with no error, click on ``Add the result`` to +validate the action. This result will be then available to the Coser admins so +that they can publish it on the internet website : http://www.ifremer.fr/SIH-indices-campagnes/ Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst 2011-02-09 09:17:58 UTC (rev 727) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_selection.rst 2011-02-09 10:51:42 UTC (rev 728) @@ -22,131 +22,121 @@ .. * <http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.html>. .. * #L% .. - -Séléction +Selection ========= -L'étape de sélection consiste a sélectionner les listes d'espèces suivante -en paramètres d'entrée de rsufi : +The selection step consist in selecting the following lists as RSufi +parameters : - * L1 : Liste des espèces sélectionnées - * L2 : Liste des espèces de L1 respectant un filtre d'occurrence/densité - * L3 : Liste des espèces de L2 avec des tailles pour toutes les années - * L4 : Liste des espèces de L3 avec des maturités + * L1 : List of the selected species + * L2 : List of species from L1 respecting an occurence/density filter + * L3 : List of species form L2 with lengthes for all the years + * L4 : List of species from L3 with maturity +Selection creation +------------------ -Création de la sélection ------------------------- +The first step consist in defining the selection parameters for Coser. -La première étape consiste a définir les paramètres de la sélection pour Coser. +To do so, use the menu ``Selection/New selection`` -Pour cela, utiliser le menu ``Selections/Nouvelle sélection`` - .. image:: ../images/21-selectionmenu0.png -**Note**: Ce menu n'est disponible que si l'étape de contrôle est été validée. +**Note**: This menu is available only if the control step have been validated. .. image:: ../images/20-selectiondetails.png -Le nom est obligatoire et ne doit contenir que des caratères alphanumériques. +This name is mandatory and can contain only alphanumerical characters. -Il faut ensuite selectionner les années sur lesquelles porterons les données -de la sélection. Les données des 4 tables seront restreinte aux années -sélectionnées. +You have then to select the years of the selection data. The 4 tables data will +be restricted to those years. .. image:: ../images/21-selectionyears.png -Il faut ensuite sélectionner les strates pour lesquelles on souhaite -sélectionner des espèces. +You then need to select the stratas for which you want to select species. .. image:: ../images/22-selectionstrata.png -Dans cette étape il est également possible d'afficher les données -de l'effort d'échantillonage est cliquant sur l'icone en forme de table. +In this step, it is also possible to display sampling effort data by clicking on +the table-shape icon. -Arrive enfin l'étape de sélection des espèces à inclure dans la liste L1. Cette -étape récapitule la liste de toutes les espèces disponible suite aux choix -des années et des strates. +Then comes the species selection step to include in the L1 list. This step +summarize the list of all the species available after the choice of years and +stratas. .. image:: ../images/23-selectionspecies.png -La liste ``Espèces filtrées`` correspond à la liste de toutes les espèces. Cette -liste est filtrable par les types de la liste ``Filtrer par type``. +The list ``Filtered species`` correspond to the list of all the species. this +list is filterable by the ``Filter by type`` list types. -Pour ajouter une espèce dans la liste L1, il faut la sélectionner et cliquer -sur le bouton ``flêche droite``. +To adjust a species in the L1 list, you have to select it and click on the +``right arrow`` button. -Les deux listes de cette étape comporte de menu contextuel permettant de : +The two lists of this step got contextual menus allowing to : - * fusionner des espèces - * générerer les graphiques de comparason captures/tailles - * etc... + * merge species + * generate catch/length comparison charts + * etc… .. image:: ../images/26-selectionmenu1.png -Rapport -------- +Report +------ -Il est possible de générer un rapport comportant toutes les informations de -la sélection est cliquant sur le bouton ``Rapport de sélection``. Ce rapport -est au format html et doit s'ouvrir dans votre navigateur pour être -visualisé et imprimé. +It is possible to generate a report that got all the selection information by +clicking on the ``Selection report`` button. This report is in html format and +should open in your browser to be visualised and printed. +Species list +------------ -Listes des espèces ------------------- +Once the L1 list have been defined, you need to save the selection so that +the ``Species list`` tab become active. -Une fois la liste L1 définie, il faut sauvegarder la sélection pour -que l'onglet ``Listes des espèces`` devienne actif. - .. image:: ../images/24-selectionlists.png -Dans cet écran : +In this screen : - * La liste L1 correspond à la liste défini lors de l'étape précédente - * La liste L2 correspond à la liste des especes filtrées par le filtre - du pourcentage minimum d'occurrence et du nombre d'individu minimum - au km2 - * La liste L3 récapitule parmi les espèces sélectionnées de la liste L2, - celles qui ont des tailles pour toutes les années - * enfin la liste L4 récapitule, parmi les espèces sélectionnées de la - liste L3, celles qui ont des maturités. + * The L1 list correspond to the list defined in the previous step + * The L2 list correspond to the list of filtered species using the minimum + occurence percentage and the minimum number of individuals per square + kilometers + * The L3 list summarize the species selected in L2 list that got lengthes for + every year + * The L4 list summarize, amongst the L3 species, the ones that got maturities. -À noter: +To be noted : - * seule les espèces **sélectionnée** (en surbrillance) sont prise en compte - * si vous modifier la sélection par defaut proposé par le logiciel, vous - devez justifier votre choix en renseignant un commentaire en dessous - de la liste concernée + * Only the **selected** species (highlighted) are taken into account + * If you modify the default selection, you will have to justify your choice by + filling in a comment bellow the concerned list -Une fois les 4 listes d'espèces définie, vous pouvez finaliser la selection -en la validant. Pour cela cliquer sur le bouton ``Valider la sélection``. +Once the 4 species list defined, you can finalize the selection by validating +it clicking on the `` Validate selection`` button. +Export the data for RSufi +------------------------- -Export des données en entrée de RSUfi -------------------------------------- +Once the 4 lists are defined and the selection validated, the third tab "RSufi" +become active. -Une fois les 4 listes définie et la sélection validée, le troisième onglet -"RSUfi" devient actif. - .. image: ../images/25-selectionresults.png -Dans cet écran, vous pouvez exporter les fichiers nécessaires à l'execution -de RSufi. Attention cependant, Coser ne pilote pas RSUfi, il ne fait que -générer les fichiers nécéssaire à son execution. +In this screen, you can export the necessary files for RSufi's execution. Take +care, Coser does not pilot RSufi, it only generates the files needed for its +execution. -Le dossier généré contient: +The generated file contains : - * les 4 tables de données (avec seulement les années selectionnées lors - de l'étape de sélection) - * un fichier détaillant les 4 listes d'especes (L1, L2, L3, l4) - * un fichier d'information relatif au projet + * the 4 data tables (with only the years selected) + * a file detailing the 4 species lists (L1, L2, L3 and L4) + * a project information file +Result +------ -Resultat --------- +Once RSufi have been executed with your selection, you can go to the +`results storing` step. -Une fois que RSufi a été executé avec les paramètres de votre sélection, -vous pouvez passer à l'étape d'`enregistrement des résultats`_. - -.. _enregistrement des résultats: guide_results.html +.. _results storing: guide_results.html

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r727 - trunk
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 09:17:58 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 727 Log: Prepare 1.0 release Modified: trunk/changelog.txt Modified: trunk/changelog.txt =================================================================== --- trunk/changelog.txt 2011-02-09 09:05:49 UTC (rev 726) +++ trunk/changelog.txt 2011-02-09 09:17:58 UTC (rev 727) @@ -1,8 +1,8 @@ Coser release notes =================== -1.0-rc1 -------- +1.0 +--- * Add control view default split pane size * Display only filename when a create project error is detected

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r726 - in trunk: . coser-business coser-ui coser-web
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: chatellier Date: 2011-02-09 09:05:49 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 726 Log: Prepare 1.0 release Modified: trunk/coser-business/pom.xml trunk/coser-ui/pom.xml trunk/coser-web/pom.xml trunk/pom.xml Modified: trunk/coser-business/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 08:23:29 UTC (rev 725) +++ trunk/coser-business/pom.xml 2011-02-09 09:05:49 UTC (rev 726) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-rc1-SNAPSHOT</version> + <version>1.0-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-ui/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 08:23:29 UTC (rev 725) +++ trunk/coser-ui/pom.xml 2011-02-09 09:05:49 UTC (rev 726) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-rc1-SNAPSHOT</version> + <version>1.0-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/coser-web/pom.xml =================================================================== --- trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 08:23:29 UTC (rev 725) +++ trunk/coser-web/pom.xml 2011-02-09 09:05:49 UTC (rev 726) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-rc1-SNAPSHOT</version> + <version>1.0-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.coser</groupId> Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-02-09 08:23:29 UTC (rev 725) +++ trunk/pom.xml 2011-02-09 09:05:49 UTC (rev 726) @@ -11,7 +11,7 @@ <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>coser</artifactId> - <version>1.0-rc1-SNAPSHOT</version> + <version>1.0-SNAPSHOT</version> <packaging>pom</packaging> <modules>

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r725 - trunk
by tchemit＠users.labs.libre-entreprise.org 09 Feb '11

09 Feb '11

Author: tchemit Date: 2011-02-09 08:23:29 +0000 (Wed, 09 Feb 2011) New Revision: 725 Log: Update mavenpom4labs to 2.4.4. Modified: trunk/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2011-02-08 17:49:49 UTC (rev 724) +++ trunk/pom.xml 2011-02-09 08:23:29 UTC (rev 725) @@ -6,7 +6,7 @@ <parent> <groupId>org.nuiton</groupId> <artifactId>mavenpom4labs</artifactId> - <version>2.4.3</version> + <version>2.4.4</version> </parent> <groupId>fr.ifremer</groupId>

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r724 - trunk/src/site/en/rst/user
by chatellier＠users.labs.libre-entreprise.org 08 Feb '11

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Author: chatellier Date: 2011-02-08 17:49:49 +0000 (Tue, 08 Feb 2011) New Revision: 724 Log: Fix doc Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_listcontrols.rst Modified: trunk/src/site/en/rst/user/guide_listcontrols.rst =================================================================== --- trunk/src/site/en/rst/user/guide_listcontrols.rst 2011-02-08 17:48:42 UTC (rev 723) +++ trunk/src/site/en/rst/user/guide_listcontrols.rst 2011-02-08 17:49:49 UTC (rev 724) @@ -88,8 +88,8 @@ +============+================================================================+==========+ | Survey | Mandatory field | Error | +------------+----------------------------------------------------------------+----------+ -| Year | Field with 4 mandatory numbers and 2 optional numbers | | -| | separated by a point (trimester) ex : 2002.25 | Error | +| | Field with 4 mandatory numbers and 2 optional numbers | | +| Year | separated by a point (trimester) ex : 2002.25 | Error | +------------+----------------------------------------------------------------+----------+ | Haul | Made up of letters and numbers | Error | +------------+----------------------------------------------------------------+----------+ @@ -111,14 +111,14 @@ +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ | Other Checks | Level | +=============================================================================+==========+ -| If the Weight is a number different from 0, the Number must be also | Error | -| different from 0 | | +| If the Weight is a number different from 0, the Number must be also | | +| different from 0 | Error | +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ -| Check duplicate lines on keys "Survey", "Year", "Haul", | Error | -| "Species", "Sex", "Maturity", "Length" | | +| Check duplicate lines on keys "Survey", "Year", "Haul", | | +| "Species", "Sex", "Maturity", "Length" | Error | +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ -| Check the minimal number of observations in the table LENGTH$Number by | Error | -| species by stratum by year | | +| Check the minimal number of observations in the table LENGTH$Number by | | +| species by stratum by year | Error | +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ Hauls @@ -181,7 +181,7 @@ | is not true) | | +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ | Check that for each haul present in a year (noted Year/Haul) in the | | -| length files and catches, there is a data in the haul file | Fatal | +| length files and catches, there is a data in the haul file | Fatal | +-----------------------------------------------------------------------------+----------+ Cross checking with the taxonomic referential

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