Isis-fish-community-commits
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Author: echatellier
Date: 2012-12-05 12:04:54 +0100 (Wed, 05 Dec 2012)
New Revision: 21
Url: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish-community/repository/revision…
Log:
Fix 0/0 when effort can't be transfered to another metier
Modified:
trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java
trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java
Modified: trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java
===================================================================
--- trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java 2012-10-23 13:40:08 UTC (rev 20)
+++ trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java 2012-12-05 11:04:54 UTC (rev 21)
@@ -1,464 +1,468 @@
-/*
- * #%L
- * IsisFish data
- * %%
- * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
- * %%
- * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
- * it under the terms of the GNU General Public License as
- * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
- * License, or (at your option) any later version.
- *
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
- * GNU General Public License for more details.
- *
- * You should have received a copy of the GNU General Public
- * License along with this program. If not, see
- * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
- * #L%
- */
-package rules;
-
-import static org.nuiton.i18n.I18n._;
-
-import java.util.HashSet;
-import java.util.Set;
-import java.util.List;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.Iterator;
-
-import org.apache.commons.logging.Log;
-import org.apache.commons.logging.LogFactory;
-import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
-import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
-
-import scripts.ResultName;
-import scripts.RuleUtil;
-import scripts.SiMatrix;
-import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfo;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
-import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
-import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
-
-/**
- * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
- * et/ou avec survie ou non.
- *
- * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
- * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
- * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
- * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
- *
- * Created: 7 septembre 2006
- *
- * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
- * @version $Revision: 1.3 $
- *
- * Last update: $Date: 30 aout 2012 $
- * by : $Author: Stephanie Mahevas$
- */
-public class TACpoids20012011OgiveTriMerlu extends AbstractRule {
-
- /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
- static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011OgiveTriMerlu.class);
-
- @Doc("Affected species")
- public Species param_species = null;
-
- @Doc("Proportion de survie")
- public double param_propSurvie = 0.45;
- @Doc(value = "param_Retention_L50")
- public double param_Retention_L50 = 29.4307;
-
- @Doc(value = "param_Retention_slope")
- public double param_Retention_slope = 2.02485;
-
- @Doc(value = "param_TailleMin")
- public double param_TailleMin = 27.0;
- /** TAC in tonnes */
- @Doc("TAC in tons 2001")
- public double param_tacInTons2001 =8452;
- @Doc("TAC in tons 2002")
- public double param_tacInTons2002 = 10098;
- @Doc("TAC in tons 2003")
- public double param_tacInTons2003 = 11220;
- @Doc("TAC in tons 2004")
- public double param_tacInTons2004 = 14623;
- @Doc("TAC in tons 2005")
- public double param_tacInTons2005 = 15932;
- @Doc("TAC in tons 2006")
- public double param_tacInTons2006 = 16412;
- @Doc("TAC in tons 2007")
- public double param_tacInTons2007 = 19701;
- @Doc("TAC in tons 2008")
- public double param_tacInTons2008 = 20196;
- @Doc("TAC in tons 2009")
- public double param_tacInTons2009 = 19261;
- @Doc("TAC in tons 2010")
- public double param_tacInTons2010 = 20609;
- @Doc("TAC in tons 2011")
- public double param_tacInTons2011 = 20609;
-
-
-
-
-
-
- boolean affectation = true; // pour ne passer qu'une seule fois dans afterSimulation (pour le premier metier)
- boolean tacAtteint = false; // pour ne passer dans beforeSimulation que si le tac est atteint
-
-
-
- protected String[] necessaryResult = {
- // put here all necessary result for this rule
- // example:
- // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
- // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
- };
-
- /**
- * @return the necessaryResult
- */
- @Override
- public String[] getNecessaryResult() {
- return this.necessaryResult;
- }
-
- /**
- * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
- *
- * @return L'aide ou la description de la regle
- */
- @Override
- public String getDescription() {
- return _("Combinaison de la regle tac poids sur 2001-2011 avec ogive de tri + prop de survie des rejets.");
- }
-
- /**
- * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
- * des valeurs
- *
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- @Override
- public void init(SimulationContext context) throws Exception {
-
- }
-
- /**
- * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
- *
- * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern
- * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
- */
- @Override
- public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
- log.info("test si TAC atteint");
- // read species in current session : plus necessaire bug resolu
- //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(
- // param_species.getTopiaId());
- TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
- .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
- boolean result = false;
- if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
- double param_tacInTons = 0;
-
- if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
- result = false;
- } else {
- result = true; // au moins ogive tri s'applique
- if (step.getYear()==0) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2001;
- } else if (step.getYear()==1) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2002;
- } else if (step.getYear()==2) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2003;
- } else if (step.getYear()==3) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2004;
- } else if (step.getYear()==4) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2005;
- } else if (step.getYear()==5) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2006;
- } else if (step.getYear()==6) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2007;
- } else if (step.getYear()==7) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2008;
- } else if (step.getYear()==8) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2009;
- } else if (step.getYear()==9) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2010;
- } else if (step.getYear()==10) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2011;
- }
- // test si Tac atteint
- double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
- param_species, step);
- log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
- + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
- if (catchTons >= param_tacInTons) {
- tacAtteint = true;
- }
- }
- }
- return result;
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
- * de temps de la simulation.
- *
- * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern */
- @Override
- public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
- // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
- affectation = true;
-
- if (tacAtteint) {
-
- log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
- log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
- TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
- .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
- if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
- // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
- // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
-
- context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
-
- //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
- Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
- for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
- double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
- .getProportionMetier(metier);
- if (prop != 0) {
- strs.add(str);
- }
- }
-
- for (Strategy str : strs) {
- StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
- .getMonth());
-
- // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
- // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
- // et pechant avec le meme engin
- Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
- // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
- // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
- Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
- // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
- // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
- // proportion peut etre nulle
- Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
-
- for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
- .getPossibleMetiers()) {
- Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
- if (
- /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
- &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
- && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivie")
- && !metier.getName().equalsIgnoreCase(
- "non Activite")
- && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
- .contains(newMetier)) {
- possibleMetierCase3.add(newMetier);
-
- if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
- possibleMetierCase2.add(newMetier);
-
- if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
- possibleMetierCase1.add(newMetier);
- }
- }
- }
- }
-
- Set<Metier> possibleMetier = null;
- if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 1");
- possibleMetier = possibleMetierCase1;
- } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 2");
- possibleMetier = possibleMetierCase2;
- } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 3");
- possibleMetier = possibleMetierCase3;
- }
-
- if (possibleMetier != null) {
- // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
- // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
- // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
- // dans la strategie
-
- double somme = 0;
- for (Metier met : possibleMetier) {
- somme += smi.getProportionMetier(met);
- }
- for (Metier met : possibleMetier) {
- double newProportion = smi.getProportionMetier(met)
- + (smi.getProportionMetier(metier)
- * smi.getProportionMetier(met) / somme);
- smi.setProportionMetier(met, newProportion);
- }
- smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
- log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
- } else {
- log.info("[TAC] Use no activity");
-
- // sinon on met tout dans le metier nonActivite
- MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
- MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
- ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
- .getStrategies(step), siMatrix
- .getMetiers(step));
- mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
-
- smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
- }
- }
- }
-
-
- }
-
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est execute apres le pas
- * de temps de la simulation.
- *
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern */
- @Override
- public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
-
-
- if (affectation) {
- // Application des rejets si Tac atteint et tailleMin sinon sur les captures
- // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
- // les captures de tous les metiers sont connues
- // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
- // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
- // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
-
- if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
- log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
-
- PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
- log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
-
- log.info("pop : " + pop.getName());
- // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
- // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
- // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
- // TOUTES les captures dans les rejets
- MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
- //log.info("discard : " + discard);
- if (discard != null) {
- discard.mults(0);
- }
- log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
- MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
- // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
- discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
- popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
- log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
- + discardRegle);
- if (param_propSurvie > 0) {
- MatrixND eff = popMon.getN(pop);
- //on réajoute les survivants aux effectifs
- for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
- .next();) {
- Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
- eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
- coord[2], coord[3])
- + i.getValue() * param_propSurvie);
- }
- }
- }
-
- } else {
- log.info("deb de affecterCaptureRejetSelonOgive");
-
- PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
- MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
- MatrixND eff = popMon.getN(pop);
-
- for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
- Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
- PopulationGroup group = (PopulationGroup) coordonnees[2];
- Metier met = (Metier) coordonnees[1];
- if (met.getName().equals("metier lang simp Sud")||met.getName().equals("metier lang simp Nord")||met.getName().equals("metier lang simple")||met.getName().equals("metier lang jum Nord")||met.getName().equals("metier lang jum Sud")||met.getName().equals("metier lang jum")) {
-
- double propTrie = 1 / (1 + Math.exp(-(group.getLength() - param_Retention_L50)/ param_Retention_slope));
- double propRejet = 1 - propTrie;
- log.info("REJETS" + propRejet);
- double value = i.getValue() * propRejet;
- log.info("VALUE" + value);
- i.setValue(value);
- if (param_propSurvie >0) {
- //ajout de la survie aux effectifs
- eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
- eff.getValue(coordonnees[2],
- coordonnees[3]) + i.getValue() *
- param_propSurvie);
- }
-
- }else if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
- i.setValue(0); // initialise discard si pas de rejet (ie taille>=TailleMin et pas metierLangoustine)
-
- } else { //si group.getLength() < param_TailleMin
- if (param_propSurvie >0) {
- //ajout de la survie aux effectifs
- eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
- eff.getValue(coordonnees[2],
- coordonnees[3]) + i.getValue() *param_propSurvie);
- }
-
- }
- }
- discard.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
- popMon.addDiscard(step, pop, discard);
- }
-
- }
- // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
- // le refaire
- affectation = false;
- }
-
- }
-
-}
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2012 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.HashSet;
+import java.util.Set;
+import java.util.List;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Iterator;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
+
+import scripts.ResultName;
+import scripts.RuleUtil;
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
+ * et/ou avec survie ou non.
+ *
+ * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
+ * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
+ * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
+ * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
+ *
+ * Created: 7 septembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.3 $
+ *
+ * Last update: $Date: 30 aout 2012 $
+ * by : $Author: Stephanie Mahevas$
+ */
+public class TACpoids20012011OgiveTriMerlu extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011OgiveTriMerlu.class);
+
+ @Doc("Affected species")
+ public Species param_species = null;
+
+ @Doc("Proportion de survie")
+ public double param_propSurvie = 0.45;
+ @Doc(value = "param_Retention_L50")
+ public double param_Retention_L50 = 29.4307;
+
+ @Doc(value = "param_Retention_slope")
+ public double param_Retention_slope = 2.02485;
+
+ @Doc(value = "param_TailleMin")
+ public double param_TailleMin = 27.0;
+ /** TAC in tonnes */
+ @Doc("TAC in tons 2001")
+ public double param_tacInTons2001 =8452;
+ @Doc("TAC in tons 2002")
+ public double param_tacInTons2002 = 10098;
+ @Doc("TAC in tons 2003")
+ public double param_tacInTons2003 = 11220;
+ @Doc("TAC in tons 2004")
+ public double param_tacInTons2004 = 14623;
+ @Doc("TAC in tons 2005")
+ public double param_tacInTons2005 = 15932;
+ @Doc("TAC in tons 2006")
+ public double param_tacInTons2006 = 16412;
+ @Doc("TAC in tons 2007")
+ public double param_tacInTons2007 = 19701;
+ @Doc("TAC in tons 2008")
+ public double param_tacInTons2008 = 20196;
+ @Doc("TAC in tons 2009")
+ public double param_tacInTons2009 = 19261;
+ @Doc("TAC in tons 2010")
+ public double param_tacInTons2010 = 20609;
+ @Doc("TAC in tons 2011")
+ public double param_tacInTons2011 = 20609;
+
+
+ boolean affectation = true; // pour ne passer qu'une seule fois dans afterSimulation (pour le premier metier)
+ boolean tacAtteint = false; // pour ne passer dans beforeSimulation que si le tac est atteint
+
+
+ protected String[] necessaryResult = {
+ // put here all necessary result for this rule
+ // example:
+ // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
+ };
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ *
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Combinaison de la regle tac poids sur 2001-2011 avec ogive de tri + prop de survie des rejets.");
+ }
+
+ /**
+ * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
+ * des valeurs
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ log.info("test si TAC atteint");
+ // read species in current session : plus necessaire bug resolu
+ //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(
+ // param_species.getTopiaId());
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ boolean result = false;
+ if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece captur
+ double param_tacInTons = 0;
+
+ if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
+ result = false;
+ } else {
+ result = true; // au moins ogive tri s'applique
+ if (step.getYear()==0) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2001;
+ } else if (step.getYear()==1) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2002;
+ } else if (step.getYear()==2) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2003;
+ } else if (step.getYear()==3) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2004;
+ } else if (step.getYear()==4) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2005;
+ } else if (step.getYear()==5) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2006;
+ } else if (step.getYear()==6) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2007;
+ } else if (step.getYear()==7) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2008;
+ } else if (step.getYear()==8) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2009;
+ } else if (step.getYear()==9) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2010;
+ } else if (step.getYear()==10) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2011;
+ }
+ // test si Tac atteint
+ double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
+ param_species, step);
+ log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
+ + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
+ if (catchTons >= param_tacInTons) {
+ tacAtteint = true;
+ }
+ }
+ }
+ return result;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+ affectation = true;
+
+ if (tacAtteint) {
+
+ log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
+ log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
+ // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
+ // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
+
+ context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
+
+ //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
+ for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
+ double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
+ .getProportionMetier(metier);
+ if (prop != 0) {
+ strs.add(str);
+ }
+ }
+
+ for (Strategy str : strs) {
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
+ .getMonth());
+
+ // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
+ // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
+ // et pechant avec le meme engin
+ Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
+ // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
+ // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
+ Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
+ // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
+ // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
+ // proportion peut etre nulle
+ Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
+
+ for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
+ .getPossibleMetiers()) {
+ Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
+ if (
+ /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
+ &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivite")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("non Activite")
+ && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
+ .contains(newMetier)) {
+ possibleMetierCase3.add(newMetier);
+
+ if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
+ possibleMetierCase2.add(newMetier);
+
+ if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
+ possibleMetierCase1.add(newMetier);
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+ Set<Metier> possibleMetier = null;
+ if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 1");
+ possibleMetier = possibleMetierCase1;
+ } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 2");
+ possibleMetier = possibleMetierCase2;
+ } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 3");
+ possibleMetier = possibleMetierCase3;
+ }
+
+ if (possibleMetier != null) {
+ // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
+ // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
+ // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
+ // dans la strategie
+
+ double somme = 0;
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ somme += smi.getProportionMetier(met);
+ }
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ double newProportion;
+ if (somme == 0) {
+ // cas ou aucun autre metier n'est pratique
+ // on répartit quand meme l'effort equitablement
+ // sur tous les autres metier
+ newProportion = smi.getProportionMetier(metier) / possibleMetier.size();
+ } else {
+ newProportion = smi.getProportionMetier(met)
+ + (smi.getProportionMetier(metier)
+ * smi.getProportionMetier(met) / somme);
+ }
+ smi.setProportionMetier(met, newProportion);
+
+ log.info("[TAC] set new proportion to " + newProportion + " for " + met.getName());
+ }
+ smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
+ log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
+ } else {
+ log.info("[TAC] Use no activity");
+
+ // sinon on met tout dans le metier nonActivite
+ MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
+ MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
+ ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
+ .getStrategies(step), siMatrix
+ .getMetiers(step));
+ mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
+
+ smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
+ }
+ }
+ }
+
+
+ }
+
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execute apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+
+
+ if (affectation) {
+ // Application des rejets si Tac atteint et tailleMin sinon sur les captures
+ // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
+ // les captures de tous les metiers sont connues
+ // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
+ // affectation est mis
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+
+ if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
+ log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+ log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+
+ log.info("pop : " + pop.getName());
+ // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
+ // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
+ // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
+ // TOUTES les captures dans les rejets
+ MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
+ //log.info("discard : " + discard);
+ if (discard != null) {
+ discard.mults(0);
+ }
+ log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
+ MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
+ // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
+ discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
+ log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
+ + discardRegle);
+ if (param_propSurvie > 0) {
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+ //on re
+ for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
+ .next();) {
+ Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
+ eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
+ coord[2], coord[3])
+ + i.getValue() * param_propSurvie);
+ }
+ }
+ }
+
+ } else {
+ log.info("deb de affecterCaptureRejetSelonOgive");
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+
+ for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
+ Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
+ PopulationGroup group = (PopulationGroup) coordonnees[2];
+ Metier met = (Metier) coordonnees[1];
+ if (met.getName().equals("metier lang simp Sud")||met.getName().equals("metier lang simp Nord")||met.getName().equals("metier lang simple")||met.getName().equals("metier lang jum Nord")||met.getName().equals("metier lang jum Sud")||met.getName().equals("metier lang jum")) {
+
+ double propTrie = 1 / (1 + Math.exp(-(group.getLength() - param_Retention_L50)/ param_Retention_slope));
+ double propRejet = 1 - propTrie;
+ //log.info("REJETS" + propRejet);
+ double value = i.getValue() * propRejet;
+ //log.info("VALUE" + value);
+ i.setValue(value);
+ if (param_propSurvie >0) {
+ //ajout de la survie aux effectifs
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
+
+ }else if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
+ i.setValue(0); // initialise discard si pas de rejet (ie taille>=TailleMin et pas metierLangoustine)
+
+ } else { //si group.getLength() < param_TailleMin
+ if (param_propSurvie >0) {
+ //ajout de la survie aux effectifs
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *param_propSurvie);
+ }
+
+ }
+ }
+ discard.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discard);
+ }
+
+ }
+ // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
+ // le refaire
+ affectation = false;
+ }
+
+ }
+
+}
Modified: trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java
===================================================================
--- trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java 2012-10-23 13:40:08 UTC (rev 20)
+++ trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java 2012-12-05 11:04:54 UTC (rev 21)
@@ -1,445 +1,452 @@
-/*
- * #%L
- * IsisFish data
- * %%
- * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
- * %%
- * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
- * it under the terms of the GNU General Public License as
- * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
- * License, or (at your option) any later version.
- *
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
- * GNU General Public License for more details.
- *
- * You should have received a copy of the GNU General Public
- * License along with this program. If not, see
- * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
- * #L%
- */
-package rules;
-
-import static org.nuiton.i18n.I18n._;
-
-import java.util.HashSet;
-import java.util.Set;
-import java.util.List;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.Iterator;
-
-import org.apache.commons.logging.Log;
-import org.apache.commons.logging.LogFactory;
-import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
-import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
-
-import scripts.ResultName;
-import scripts.RuleUtil;
-import scripts.SiMatrix;
-import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfo;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
-import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
-import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
-
-/**
- * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
- * et/ou avec survie ou non.
- *
- * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
- * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
- * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
- * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
- *
- * Created: 7 septembre 2006
- *
- * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
- * @version $Revision: 1.3 $
- *
- * Last update: $Date: 30 aout 2012 $
- * by : $Author: Stephanie Mahevas$
- */
-public class TACpoids20012011TailleMin extends AbstractRule {
-
- /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
- static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011TailleMin.class);
-
- @Doc("Affected species")
- public Species param_species = null;
-
- @Doc("Proportion de survie")
- public double param_propSurvie = 0.45;
-
-
- /** TAC in tonnes */
- @Doc("TAC in tons 2001")
- public double param_tacInTons2001 = 4000.0;
- @Doc("TAC in tons 2002")
- public double param_tacInTons2002 = 3200.0;
- @Doc("TAC in tons 2003")
- public double param_tacInTons2003 = 3000.0;
- @Doc("TAC in tons 2004")
- public double param_tacInTons2004 = 3150.0;
- @Doc("TAC in tons 2005")
- public double param_tacInTons2005 = 3100.0;
- @Doc("TAC in tons 2006")
- public double param_tacInTons2006 = 4000.0;
- @Doc("TAC in tons 2007")
- public double param_tacInTons2007 = 4320.0;
- @Doc("TAC in tons 2008")
- public double param_tacInTons2008 = 4320.0;
- @Doc("TAC in tons 2009")
- public double param_tacInTons2009 = 4100.0;
- @Doc("TAC in tons 2010")
- public double param_tacInTons2010 = 3900.0;
- @Doc("TAC in tons 2011")
- public double param_tacInTons2011 = 3900.0;
-
- @Doc(value = "param_TailleMin")
- public double param_TailleMin = 85.0;
-
-
-
- boolean affectation = true; // pour ne passer qu'une seule fois dans afterSimulation (pour le premier metier)
- boolean tacAtteint = false; // pour ne passer dans beforeSimulation que si le tac est atteint
-
-
-
- protected String[] necessaryResult = {
- // put here all necessary result for this rule
- // example:
- // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
- // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
- };
-
- /**
- * @return the necessaryResult
- */
- @Override
- public String[] getNecessaryResult() {
- return this.necessaryResult;
- }
-
- /**
- * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
- *
- * @return L'aide ou la description de la regle
- */
- @Override
- public String getDescription() {
- return _("Combinaison de la regle tac poids sur 2001-2011 avec tailleMin + prop de survie des rejets.");
- }
-
- /**
- * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
- * des valeurs
- *
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- @Override
- public void init(SimulationContext context) throws Exception {
-
- }
-
- /**
- * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
- *
- * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern
- * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
- */
- @Override
- public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
- log.info("test si TAC atteint");
- // read species in current session : plus necessaire bug resolu
- //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(
- // param_species.getTopiaId());
- TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
- .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
- boolean result = false;
- if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
- double param_tacInTons = 0;
-
- if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
- result = false;
- } else {
- result = true; // au moins tailleMin s'applique
- if (step.getYear()==0) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2001;
- } else if (step.getYear()==1) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2002;
- } else if (step.getYear()==2) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2003;
- } else if (step.getYear()==3) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2004;
- } else if (step.getYear()==4) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2005;
- } else if (step.getYear()==5) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2006;
- } else if (step.getYear()==6) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2007;
- } else if (step.getYear()==7) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2008;
- } else if (step.getYear()==8) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2009;
- } else if (step.getYear()==9) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2010;
- } else if (step.getYear()==10) {
- param_tacInTons = param_tacInTons2011;
- }
- // test si Tac atteint
- double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
- param_species, step);
- log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
- + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
- if (catchTons >= param_tacInTons) {
- tacAtteint = true;
- }
- }
- }
- return result;
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
- * de temps de la simulation.
- *
- * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern */
- @Override
- public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
- // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
- affectation = true;
-
- if (tacAtteint) {
-
- log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
- log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
- TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
- .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
- if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
- // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
- // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
-
- context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
-
- //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
- Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
- for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
- double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
- .getProportionMetier(metier);
- if (prop != 0) {
- strs.add(str);
- }
- }
-
- for (Strategy str : strs) {
- StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
- .getMonth());
-
- // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
- // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
- // et pechant avec le meme engin
- Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
- // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
- // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
- Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
- // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
- // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
- // proportion peut etre nulle
- Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
-
- for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
- .getPossibleMetiers()) {
- Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
- if (
- /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
- &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
- && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivie")
- && !metier.getName().equalsIgnoreCase(
- "non Activite")
- && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
- .contains(newMetier)) {
- possibleMetierCase3.add(newMetier);
-
- if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
- possibleMetierCase2.add(newMetier);
-
- if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
- possibleMetierCase1.add(newMetier);
- }
- }
- }
- }
-
- Set<Metier> possibleMetier = null;
- if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 1");
- possibleMetier = possibleMetierCase1;
- } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 2");
- possibleMetier = possibleMetierCase2;
- } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
- log.info("[TAC] Use case 3");
- possibleMetier = possibleMetierCase3;
- }
-
- if (possibleMetier != null) {
- // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
- // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
- // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
- // dans la strategie
-
- double somme = 0;
- for (Metier met : possibleMetier) {
- somme += smi.getProportionMetier(met);
- }
- for (Metier met : possibleMetier) {
- double newProportion = smi.getProportionMetier(met)
- + (smi.getProportionMetier(metier)
- * smi.getProportionMetier(met) / somme);
- smi.setProportionMetier(met, newProportion);
- }
- smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
- log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
- } else {
- log.info("[TAC] Use no activity");
-
- // sinon on met tout dans le metier nonActivite
- MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
- MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
- ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
- .getStrategies(step), siMatrix
- .getMetiers(step));
- mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
-
- smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
- }
- }
- }
-
-
- }
-
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est execute apres le pas
- * de temps de la simulation.
- *
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @param step le pas de temps courant
- * @param metier le metier concern */
- @Override
- public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
- throws Exception {
-
-
-
- if (affectation) {
- // Application des rejets si Tac atteint et tailleMin sinon sur les captures
- // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
- // les captures de tous les metiers sont connues
- // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
- // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
- // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
-
- if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
- log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
-
- PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
- log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
-
- log.info("pop : " + pop.getName());
- // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
- // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
- // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
- // TOUTES les captures dans les rejets
- MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
- //log.info("discard : " + discard);
- if (discard != null) {
- discard.mults(0);
- }
- log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
- MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
- // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
- discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
- popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
- log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
- + discardRegle);
- if (param_propSurvie > 0) {
- MatrixND eff = popMon.getN(pop);
- //on réajoute les survivants aux effectifs
- for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
- .next();) {
- Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
- eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
- coord[2], coord[3])
- + i.getValue() * param_propSurvie);
- }
- }
- }
-
- } else {
- //on applique TailleMin uniquement si tac pas atteint
- log.info(" TailleMin.actionApres:" + step + " metapop:" +
- param_species + " metier:" + metier);
- log.info("deb de affecterCaptureREJETTailleMin");
-
- PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
-
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
- //if (popMon.getDiscard(step, pop) == null) {
- MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
- MatrixND eff = popMon.getN(pop);
-
- for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
- Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
- PopulationGroup group =
- (PopulationGroup) coordonnees[2];
- if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
- i.setValue(0);
- } else if (param_propSurvie > 0) {
- eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
- eff.getValue(coordonnees[2],
- coordonnees[3]) + i.getValue() *
- param_propSurvie);
- }
- }
- discard.setName(
- ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
- popMon.addDiscard(step, pop, discard);
- //}
- }
-
- }
- // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
- // le refaire
- affectation = false;
- }
-
- }
-
-}
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.HashSet;
+import java.util.Set;
+import java.util.List;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Iterator;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
+
+import scripts.ResultName;
+import scripts.RuleUtil;
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
+ * et/ou avec survie ou non.
+ *
+ * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
+ * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
+ * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
+ * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
+ *
+ * Created: 7 septembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.3 $
+ *
+ * Last update: $Date: 30 aout 2012 $
+ * by : $Author: Stephanie Mahevas$
+ */
+public class TACpoids20012011TailleMin extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011TailleMin.class);
+
+ @Doc("Affected species")
+ public Species param_species = null;
+
+ @Doc("Proportion de survie")
+ public double param_propSurvie = 0.45;
+
+
+ /** TAC in tonnes */
+ @Doc("TAC in tons 2001")
+ public double param_tacInTons2001 = 4000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2002")
+ public double param_tacInTons2002 = 3200.0;
+ @Doc("TAC in tons 2003")
+ public double param_tacInTons2003 = 3000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2004")
+ public double param_tacInTons2004 = 3150.0;
+ @Doc("TAC in tons 2005")
+ public double param_tacInTons2005 = 3100.0;
+ @Doc("TAC in tons 2006")
+ public double param_tacInTons2006 = 4000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2007")
+ public double param_tacInTons2007 = 4320.0;
+ @Doc("TAC in tons 2008")
+ public double param_tacInTons2008 = 4320.0;
+ @Doc("TAC in tons 2009")
+ public double param_tacInTons2009 = 4100.0;
+ @Doc("TAC in tons 2010")
+ public double param_tacInTons2010 = 3900.0;
+ @Doc("TAC in tons 2011")
+ public double param_tacInTons2011 = 3900.0;
+
+ @Doc(value = "param_TailleMin")
+ public double param_TailleMin = 85.0;
+
+
+
+ boolean affectation = true; // pour ne passer qu'une seule fois dans afterSimulation (pour le premier metier)
+ boolean tacAtteint = false; // pour ne passer dans beforeSimulation que si le tac est atteint
+
+
+
+ protected String[] necessaryResult = {
+ // put here all necessary result for this rule
+ // example:
+ // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
+ };
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ *
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Combinaison de la regle tac poids sur 2001-2011 avec tailleMin + prop de survie des rejets.");
+ }
+
+ /**
+ * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
+ * des valeurs
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ log.info("test si TAC atteint");
+ // read species in current session : plus necessaire bug resolu
+ //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(
+ // param_species.getTopiaId());
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ boolean result = false;
+ if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
+ double param_tacInTons = 0;
+
+ if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
+ result = false;
+ } else {
+ result = true; // au moins tailleMin s'applique
+ if (step.getYear()==0) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2001;
+ } else if (step.getYear()==1) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2002;
+ } else if (step.getYear()==2) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2003;
+ } else if (step.getYear()==3) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2004;
+ } else if (step.getYear()==4) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2005;
+ } else if (step.getYear()==5) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2006;
+ } else if (step.getYear()==6) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2007;
+ } else if (step.getYear()==7) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2008;
+ } else if (step.getYear()==8) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2009;
+ } else if (step.getYear()==9) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2010;
+ } else if (step.getYear()==10) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2011;
+ }
+ // test si Tac atteint
+ double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
+ param_species, step);
+ log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
+ + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
+ if (catchTons >= param_tacInTons) {
+ tacAtteint = true;
+ }
+ }
+ }
+ return result;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+ affectation = true;
+
+ if (tacAtteint) {
+
+ log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
+ log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
+ // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
+ // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
+
+ context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
+
+ //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
+ for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
+ double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
+ .getProportionMetier(metier);
+ if (prop != 0) {
+ strs.add(str);
+ }
+ }
+
+ for (Strategy str : strs) {
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
+ .getMonth());
+
+ // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
+ // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
+ // et pechant avec le meme engin
+ Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
+ // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
+ // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
+ Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
+ // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
+ // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
+ // proportion peut etre nulle
+ Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
+
+ for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
+ .getPossibleMetiers()) {
+ Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
+ if (
+ /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
+ &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivite")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("non Activite")
+ && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
+ .contains(newMetier)) {
+ possibleMetierCase3.add(newMetier);
+
+ if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
+ possibleMetierCase2.add(newMetier);
+
+ if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
+ possibleMetierCase1.add(newMetier);
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+ Set<Metier> possibleMetier = null;
+ if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 1");
+ possibleMetier = possibleMetierCase1;
+ } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 2");
+ possibleMetier = possibleMetierCase2;
+ } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 3");
+ possibleMetier = possibleMetierCase3;
+ }
+
+ if (possibleMetier != null) {
+ // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
+ // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
+ // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
+ // dans la strategie
+
+ double somme = 0;
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ somme += smi.getProportionMetier(met);
+ }
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ double newProportion;
+ if (somme == 0) {
+ // cas ou aucun autre metier n'est pratique
+ // on répartit quand meme l'effort equitablement
+ // sur tous les autres metier
+ newProportion = smi.getProportionMetier(metier) / possibleMetier.size();
+ } else {
+ newProportion = smi.getProportionMetier(met)
+ + (smi.getProportionMetier(metier)
+ * smi.getProportionMetier(met) / somme);
+ }
+ smi.setProportionMetier(met, newProportion);
+ }
+ smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
+ log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
+ } else {
+ log.info("[TAC] Use no activity");
+
+ // sinon on met tout dans le metier nonActivite
+ MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
+ MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
+ ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
+ .getStrategies(step), siMatrix
+ .getMetiers(step));
+ mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
+
+ smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
+ }
+ }
+ }
+
+
+ }
+
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execute apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+
+
+ if (affectation) {
+ // Application des rejets si Tac atteint et tailleMin sinon sur les captures
+ // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
+ // les captures de tous les metiers sont connues
+ // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
+ // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+
+ if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
+ log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+ log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+
+ log.info("pop : " + pop.getName());
+ // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
+ // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
+ // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
+ // TOUTES les captures dans les rejets
+ MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
+ //log.info("discard : " + discard);
+ if (discard != null) {
+ discard.mults(0);
+ }
+ log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
+ MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
+ // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
+ discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
+ log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
+ + discardRegle);
+ if (param_propSurvie > 0) {
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+ //on réajoute les survivants aux effectifs
+ for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
+ .next();) {
+ Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
+ eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
+ coord[2], coord[3])
+ + i.getValue() * param_propSurvie);
+ }
+ }
+ }
+
+ } else {
+ //on applique TailleMin uniquement si tac pas atteint
+ log.info(" TailleMin.actionApres:" + step + " metapop:" +
+ param_species + " metier:" + metier);
+ log.info("deb de affecterCaptureREJETTailleMin");
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ //if (popMon.getDiscard(step, pop) == null) {
+ MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+
+ for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
+ Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
+ PopulationGroup group =
+ (PopulationGroup) coordonnees[2];
+ if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
+ i.setValue(0);
+ } else if (param_propSurvie > 0) {
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
+ }
+ discard.setName(
+ ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discard);
+ //}
+ }
+
+ }
+ // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
+ // le refaire
+ affectation = false;
+ }
+
+ }
+
+}
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-23 15:40:08 +0200 (Tue, 23 Oct 2012)
New Revision: 20
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/20
Log:
necessary results ajout des matrices
Modified:
trunk/exports/MortalitePecheTotale.java
Modified: trunk/exports/MortalitePecheTotale.java
===================================================================
--- trunk/exports/MortalitePecheTotale.java 2012-10-23 13:39:55 UTC (rev 19)
+++ trunk/exports/MortalitePecheTotale.java 2012-10-23 13:40:08 UTC (rev 20)
@@ -51,7 +51,10 @@
/** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
static private Log log = LogFactory.getLog(MortalitePecheTotale.class);
- protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_TOTAL_FISHING_MORTALITY };
+ protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_TOTAL_FISHING_MORTALITY,
+ ResultName.MATRIX_FISHING_MORTALITY_PER_GROUP,
+ ResultName.MATRIX_CATCH_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP,
+ ResultName.MATRIX_ABUNDANCE };
@Override
public String[] getNecessaryResult() {
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-23 15:39:55 +0200 (Tue, 23 Oct 2012)
New Revision: 19
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/19
Log:
necessary results ajout des matrices
Modified:
trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java
Modified: trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java
===================================================================
--- trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java 2012-10-19 15:05:57 UTC (rev 18)
+++ trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java 2012-10-23 13:39:55 UTC (rev 19)
@@ -51,7 +51,10 @@
/** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
static private Log log = LogFactory.getLog(MortalitePecheGroupe.class);
- protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_FISHING_MORTALITY_PER_GROUP };
+ protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_FISHING_MORTALITY_PER_GROUP,
+ ResultName.MATRIX_CATCH_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP,
+ ResultName.MATRIX_ABUNDANCE,
+ };
@Override
public String[] getNecessaryResult() {
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-19 17:05:57 +0200 (Fri, 19 Oct 2012)
New Revision: 18
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/18
Log:
nouveauscript
Added:
trunk/exports/MortalitePecheTotale.java
Added: trunk/exports/MortalitePecheTotale.java
===================================================================
--- trunk/exports/MortalitePecheTotale.java (rev 0)
+++ trunk/exports/MortalitePecheTotale.java 2012-10-19 15:05:57 UTC (rev 18)
@@ -0,0 +1,102 @@
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package exports;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+
+import java.io.Writer;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+
+import scripts.ResultName;
+
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.export.Export;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage;
+
+/**
+ * FishingMortality.java
+ *
+ * Created: 19 Avril 2012
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 0.1 $
+ *
+ * Last update: $Date: 0000-00-00 00:00:00 $ by : $Author: $
+ */
+public class MortalitePecheTotale implements Export {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(MortalitePecheTotale.class);
+
+ protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_TOTAL_FISHING_MORTALITY };
+
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ @Override
+ public String getExportFilename() {
+ return "MortalitePecheTotale";
+ }
+
+ @Override
+ public String getExtensionFilename() {
+ return ".csv";
+ }
+
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Exporte la mortalite par peche totale de la simulation par population (Fpop par an calcule en decembre)");
+ }
+
+ @Override
+ public void export(SimulationStorage simulation, Writer out)
+ throws Exception {
+ TimeStep lastStep = simulation.getResultStorage().getLastStep();
+
+ for (Population pop : simulation.getParameter().getPopulations()) {
+ for (TimeStep step = new TimeStep(0); !step.after(lastStep); step = step
+ .next()) {
+
+ MatrixND mat = simulation.getResultStorage().getMatrix(step,
+ pop, ResultName.MATRIX_TOTAL_FISHING_MORTALITY);
+
+ if (mat != null) { // can be null if simulation is stopped before last year simulation
+ for (MatrixIterator i = mat.iterator(); i.hasNext();) {
+ i.next();
+ Object[] sems = i.getSemanticsCoordinates();
+ double val = i.getValue();
+
+ out.write(pop.getName() + ";" + step.getStep() + ";" + val + "\n");
+ }
+ }
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-19 17:05:42 +0200 (Fri, 19 Oct 2012)
New Revision: 17
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/17
Log:
nouveauscript
Added:
trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java
Added: trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java
===================================================================
--- trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java (rev 0)
+++ trunk/exports/MortalitePecheGroupe.java 2012-10-19 15:05:42 UTC (rev 17)
@@ -0,0 +1,104 @@
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package exports;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+
+import java.io.Writer;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+
+import scripts.ResultName;
+
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.export.Export;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage;
+
+/**
+ * FishingMortality.java
+ *
+ * Created: 19 Avril 2012
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 0.1 $
+ *
+ * Last update: $Date: 0000-00-00 00:00:00 $ by : $Author: $
+ */
+public class MortalitePecheGroupe implements Export {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(MortalitePecheGroupe.class);
+
+ protected String[] necessaryResult = { ResultName.MATRIX_FISHING_MORTALITY_PER_GROUP };
+
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ @Override
+ public String getExportFilename() {
+ return "MortalitePecheGroupe";
+ }
+
+ @Override
+ public String getExtensionFilename() {
+ return ".csv";
+ }
+
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Exporte la mortalite par peche par groupe et par population de la simulation (Fgroup par an calcule en decembre)");
+ }
+
+ @Override
+ public void export(SimulationStorage simulation, Writer out)
+ throws Exception {
+ TimeStep lastStep = simulation.getResultStorage().getLastStep();
+
+ for (Population pop : simulation.getParameter().getPopulations()) {
+// for (PopulationGroup group : pop.getPopulationGroup()) { // Rajouter une boucle sur les groupes ??
+ for (TimeStep step = new TimeStep(0); !step.after(lastStep); step = step.next()) {
+
+ MatrixND mat = simulation.getResultStorage().getMatrix(step,
+ pop, ResultName.MATRIX_FISHING_MORTALITY_PER_GROUP); // group
+
+ if (mat != null) { // can be null if simulation is stopped before last year simulation
+ for (MatrixIterator i = mat.iterator(); i.hasNext();) {
+ i.next();
+ Object[] sems = i.getSemanticsCoordinates();
+ PopulationGroup group = (PopulationGroup)sems[1];
+ double val = i.getValue();
+
+ out.write(pop.getName() + ";" + step.getStep() + ";" + group.getAge() + ";" + val + "\n"); // + ";" + group.getAge()
+ }
+ }
+ }
+ //}
+ }
+ }
+ }
+
+
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-16 17:47:45 +0200 (Tue, 16 Oct 2012)
New Revision: 16
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/16
Log:
correction erreur Metier dans postAction
Modified:
trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java
Modified: trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java
===================================================================
--- trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java 2012-10-16 15:47:17 UTC (rev 15)
+++ trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java 2012-10-16 15:47:45 UTC (rev 16)
@@ -152,7 +152,7 @@
// la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
// les captures de tous les metiers sont connues
// Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
- // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
+ // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
if (affectation) {
log.info("deb de affecterCaptureRejetSelonOgive");
@@ -166,8 +166,8 @@
for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
PopulationGroup group = (PopulationGroup) coordonnees[2];
-
- if (metier.getName().equals("metier lang simp Sud")||metier.getName().equals("metier lang simp Nord")||metier.getName().equals("metier lang simple")||metier.getName().equals("metier lang jum Nord")||metier.getName().equals("metier lang jum Sud")||metier.getName().equals("metier lang jum")) {
+ Metier met = (Metier) coordonnees[1];
+ if (met.getName().equals("metier lang simp Sud")||met.getName().equals("metier lang simp Nord")||met.getName().equals("metier lang simple")||met.getName().equals("metier lang jum Nord")||met.getName().equals("metier lang jum Sud")||met.getName().equals("metier lang jum")) {
double propTrie = 1 / (1 + Math.exp(-(group.getLength() - param_Retention_L50)/ param_Retention_slope));
double propRejet = 1 - propTrie;
@@ -175,17 +175,25 @@
double value = i.getValue() * propRejet;
log.info("VALUE" + value);
i.setValue(value);
+ if (param_propSurvie >0) {
+ //ajout de la survie aux effectifs
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
}else if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
i.setValue(0); // initialise discard si pas de rejet (ie taille>=TailleMin et pas metierLangoustine)
- }
- if (param_propSurvie >0) {
+ } else{ // group.getLength() < param_TailleMin
+ if (param_propSurvie >0) {
//ajout de la survie aux effectifs
eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
eff.getValue(coordonnees[2],
coordonnees[3]) + i.getValue() *
param_propSurvie);
- }
+ }
+ }
}
discard.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
popMon.addDiscard(step, pop, discard);
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-10-16 17:47:17 +0200 (Tue, 16 Oct 2012)
New Revision: 15
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/15
Log:
corrections erreur metier dans postAction
Modified:
trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java
Modified: trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java
===================================================================
--- trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java 2012-09-06 10:41:07 UTC (rev 14)
+++ trunk/rules/TACpoids20012011OgiveTriMerlu.java 2012-10-16 15:47:17 UTC (rev 15)
@@ -93,29 +93,30 @@
public double param_TailleMin = 27.0;
/** TAC in tonnes */
@Doc("TAC in tons 2001")
- public double param_tacInTons2001 = 4000.0;
+ public double param_tacInTons2001 =8452;
@Doc("TAC in tons 2002")
- public double param_tacInTons2002 = 3200.0;
+ public double param_tacInTons2002 = 10098;
@Doc("TAC in tons 2003")
- public double param_tacInTons2003 = 3000.0;
+ public double param_tacInTons2003 = 11220;
@Doc("TAC in tons 2004")
- public double param_tacInTons2004 = 3150.0;
+ public double param_tacInTons2004 = 14623;
@Doc("TAC in tons 2005")
- public double param_tacInTons2005 = 3100.0;
+ public double param_tacInTons2005 = 15932;
@Doc("TAC in tons 2006")
- public double param_tacInTons2006 = 4000.0;
+ public double param_tacInTons2006 = 16412;
@Doc("TAC in tons 2007")
- public double param_tacInTons2007 = 4320.0;
+ public double param_tacInTons2007 = 19701;
@Doc("TAC in tons 2008")
- public double param_tacInTons2008 = 4320.0;
+ public double param_tacInTons2008 = 20196;
@Doc("TAC in tons 2009")
- public double param_tacInTons2009 = 4100.0;
+ public double param_tacInTons2009 = 19261;
@Doc("TAC in tons 2010")
- public double param_tacInTons2010 = 3900.0;
+ public double param_tacInTons2010 = 20609;
@Doc("TAC in tons 2011")
- public double param_tacInTons2011 = 3900.0;
+ public double param_tacInTons2011 = 20609;
+
@@ -179,7 +180,7 @@
TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
.getSpeciesTargetSpecies(param_species);
boolean result = false;
- if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
+ if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
double param_tacInTons = 0;
if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
@@ -367,15 +368,15 @@
// la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
// les captures de tous les metiers sont connues
// Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
- // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
+ // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
// la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
- log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
log.info("pop : " + pop.getName());
// si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
@@ -396,7 +397,7 @@
+ discardRegle);
if (param_propSurvie > 0) {
MatrixND eff = popMon.getN(pop);
- //on réajoute les survivants aux effectifs
+ //on réajoute les survivants aux effectifs
for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
.next();) {
Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
@@ -411,15 +412,15 @@
log.info("deb de affecterCaptureRejetSelonOgive");
PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
- for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
MatrixND eff = popMon.getN(pop);
for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
PopulationGroup group = (PopulationGroup) coordonnees[2];
-
- if (metier.getName().equals("metier lang simp Sud")||metier.getName().equals("metier lang simp Nord")||metier.getName().equals("metier lang simple")||metier.getName().equals("metier lang jum Nord")||metier.getName().equals("metier lang jum Sud")||metier.getName().equals("metier lang jum")) {
+ Metier met = (Metier) coordonnees[1];
+ if (met.getName().equals("metier lang simp Sud")||met.getName().equals("metier lang simp Nord")||met.getName().equals("metier lang simple")||met.getName().equals("metier lang jum Nord")||met.getName().equals("metier lang jum Sud")||met.getName().equals("metier lang jum")) {
double propTrie = 1 / (1 + Math.exp(-(group.getLength() - param_Retention_L50)/ param_Retention_slope));
double propRejet = 1 - propTrie;
@@ -427,18 +428,27 @@
double value = i.getValue() * propRejet;
log.info("VALUE" + value);
i.setValue(value);
+ if (param_propSurvie >0) {
+ //ajout de la survie aux effectifs
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
}else if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
i.setValue(0); // initialise discard si pas de rejet (ie taille>=TailleMin et pas metierLangoustine)
- }
- if (param_propSurvie >0) {
+
+ } else { //si group.getLength() < param_TailleMin
+ if (param_propSurvie >0) {
//ajout de la survie aux effectifs
eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
- eff.getValue(coordonnees[2],
- coordonnees[3]) + i.getValue() *
- param_propSurvie);
- }
- }
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *param_propSurvie);
+ }
+
+ }
+ }
discard.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
popMon.addDiscard(step, pop, discard);
}
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-09-06 12:41:07 +0200 (Thu, 06 Sep 2012)
New Revision: 14
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/14
Log:
nouveau script
Added:
trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java
Added: trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java
===================================================================
--- trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java (rev 0)
+++ trunk/rules/Ogive_de_Tri_Merlu.java 2012-09-06 10:41:07 UTC (rev 14)
@@ -0,0 +1,196 @@
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.List;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Iterator;
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+import scripts.ResultName;
+import scripts.SiMatrix;
+
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import scripts.ResultName;
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.ResultManager;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * Cette methode remplace aussi TailleMin pour le Merlu dans PecherieGdG
+ * inspire de TailleMIN
+ * Created: 30 novembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.1 $
+ *
+ * Last update: $Date: 2012 08_28 $
+ * by : $Stephanie Mahevas$
+ */
+public class Ogive_de_Tri_Merlu extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(Ogive_de_Tri_Merlu.class);
+
+ @Doc(value = "Begin step")
+ public TimeStep param_beginStep = new TimeStep(0);
+
+ @Doc(value = "End step")
+ public TimeStep param_endStep = new TimeStep(119);
+
+ @Doc(value = "Affected species")
+ public Species param_species = null;
+
+ @Doc(value = "param_Retention_L50")
+ public double param_Retention_L50 = 29.4307;
+
+ @Doc(value = "param_Retention_slope")
+ public double param_Retention_slope = 2.02485;
+
+ @Doc(value = "param_TailleMin")
+ public double param_TailleMin = 27;
+
+ @Doc(value = "Proportion de survie")
+ public double param_propSurvie = 0;
+
+ boolean affectation = true;
+
+ public String[] necessaryResult = {
+ // put here all necessary result for this rule
+ // example:
+ // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
+ };
+
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ *
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() throws Exception {
+ return _("rejet des captures de merlu selon une sigmoide avec prop de survie selon Metier - pecherie Merlu-Langoustine GdG");
+ }
+
+ /**
+ * des valeurs
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+ }
+
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ boolean result = true;
+ if (step.before(param_beginStep)) {
+ result = false;
+ } else if (step.after(param_endStep)) {
+ result = false;
+ }
+
+
+ log.info("fin de condition OgiveTri:" + result);
+ return result;
+
+ // fin
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execut
+ * temps de la simulation.
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+ // nothing
+ affectation = true;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execut
+ * temps de la simulation.
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ // Application de l'ogive de tri sur les captures
+ // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
+ // les captures de tous les metiers sont connues
+ // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
+ // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
+
+ if (affectation) {
+ log.info("deb de affecterCaptureRejetSelonOgive");
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+
+ for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
+ Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
+ PopulationGroup group = (PopulationGroup) coordonnees[2];
+
+ if (metier.getName().equals("metier lang simp Sud")||metier.getName().equals("metier lang simp Nord")||metier.getName().equals("metier lang simple")||metier.getName().equals("metier lang jum Nord")||metier.getName().equals("metier lang jum Sud")||metier.getName().equals("metier lang jum")) {
+
+ double propTrie = 1 / (1 + Math.exp(-(group.getLength() - param_Retention_L50)/ param_Retention_slope));
+ double propRejet = 1 - propTrie;
+ log.info("REJETS" + propRejet);
+ double value = i.getValue() * propRejet;
+ log.info("VALUE" + value);
+ i.setValue(value);
+
+ }else if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
+ i.setValue(0); // initialise discard si pas de rejet (ie taille>=TailleMin et pas metierLangoustine)
+ }
+ if (param_propSurvie >0) {
+ //ajout de la survie aux effectifs
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
+ }
+ discard.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discard);
+ }
+ affectation = true; // pour ne pas refaire l'affectation au prochain metier
+ }
+ }
+}
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-09-06 12:40:41 +0200 (Thu, 06 Sep 2012)
New Revision: 13
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/13
Log:
nouveau script
Added:
trunk/rules/TACpoids20012011.java
Added: trunk/rules/TACpoids20012011.java
===================================================================
--- trunk/rules/TACpoids20012011.java (rev 0)
+++ trunk/rules/TACpoids20012011.java 2012-09-06 10:40:41 UTC (rev 13)
@@ -0,0 +1,390 @@
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.HashSet;
+import java.util.Set;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
+
+import scripts.ResultName;
+import scripts.RuleUtil;
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
+ * et/ou avec survie ou non.
+ *
+ * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
+ * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
+ * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
+ * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
+ *
+ * Created: 7 septembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.3 $
+ *
+ * Last update: $Date: 290607 $
+ * by : $Author: sigrid $
+ */
+public class TACpoids20012011 extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011.class);
+
+ @Doc("Affected species")
+ public Species param_species = null;
+
+ @Doc("Proportion de survie")
+ public double param_propSurvie = 0;
+
+
+ /** TAC in tonnes */
+ @Doc("TAC in tons 2001")
+ public double param_tacInTons2001 = 22600;
+ @Doc("TAC in tons 2002")
+ public double param_tacInTons2002 = 27000;
+ @Doc("TAC in tons 2003")
+ public double param_tacInTons2003 = 30000;
+ @Doc("TAC in tons 2004")
+ public double param_tacInTons2004 = 39100;
+ @Doc("TAC in tons 2005")
+ public double param_tacInTons2005 = 42600;
+ @Doc("TAC in tons 2006")
+ public double param_tacInTons2006 = 43900;
+ @Doc("TAC in tons 2007")
+ public double param_tacInTons2007 = 52680;
+ @Doc("TAC in tons 2008")
+ public double param_tacInTons2008 = 54000;
+ @Doc("TAC in tons 2009")
+ public double param_tacInTons2009 = 51500;
+ @Doc("TAC in tons 2010")
+ public double param_tacInTons2010 = 55105;
+ @Doc("TAC in tons 2011")
+ public double param_tacInTons2011 = 55105;
+
+ boolean affectation = true;
+
+
+
+ protected String[] necessaryResult = {
+ // put here all necessary result for this rule
+ // example:
+ // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
+ };
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ *
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("TAC weight in tons.\nIf you want survival discard use propSurvie other than 0.\nIf you wish TAC computed as a proportion of the biomass use propTac other than 0.");
+ }
+
+ /**
+ * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
+ * des valeurs
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concerné
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ log.info("test si TAC atteint");
+ // read species in current session : supprimé car bug corrigé
+ //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(param_species.getTopiaId());
+
+ double param_tacInTons = 0;
+ boolean result = false;
+ if (step.getYear()>10) {
+ result = false;
+ } else {
+ if (step.getYear()==0) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2001;
+ } else if (step.getYear()==1) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2002;
+ } else if (step.getYear()==2) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2003;
+ } else if (step.getYear()==3) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2004;
+ } else if (step.getYear()==4) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2005;
+ } else if (step.getYear()==5) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2006;
+ } else if (step.getYear()==6) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2007;
+ } else if (step.getYear()==7) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2008;
+ } else if (step.getYear()==8) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2009;
+ } else if (step.getYear()==9) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2010;
+ } else if (step.getYear()==10) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2011;
+ }
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ if (ts != null) {
+ double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
+ param_species, step);
+ log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
+ + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
+ if (catchTons >= param_tacInTons) {
+ result = true;
+ }
+ }
+ }
+ return result;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concerné
+ */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+ affectation = true;
+
+ log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
+ log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
+ // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
+ // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
+
+ context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
+
+ //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
+ for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
+ double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
+ .getProportionMetier(metier);
+ if (prop != 0) {
+ strs.add(str);
+ }
+ }
+
+ for (Strategy str : strs) {
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
+ .getMonth());
+
+ // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
+ // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
+ // et pechant avec le meme engin
+ Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
+ // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
+ // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
+ Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
+ // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
+ // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
+ // proportion peut etre nulle
+ Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
+
+ for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
+ .getPossibleMetiers()) {
+ Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
+ if (
+ /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
+ &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivie")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase(
+ "non Activite")
+ && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
+ .contains(newMetier)) {
+ possibleMetierCase3.add(newMetier);
+
+ if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
+ possibleMetierCase2.add(newMetier);
+
+ if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
+ possibleMetierCase1.add(newMetier);
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+ Set<Metier> possibleMetier = null;
+ if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 1");
+ possibleMetier = possibleMetierCase1;
+ } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 2");
+ possibleMetier = possibleMetierCase2;
+ } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 3");
+ possibleMetier = possibleMetierCase3;
+ }
+
+ if (possibleMetier != null) {
+ // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
+ // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
+ // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
+ // dans la strategie
+
+ double somme = 0;
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ somme += smi.getProportionMetier(met);
+ }
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ double newProportion = smi.getProportionMetier(met)
+ + (smi.getProportionMetier(metier)
+ * smi.getProportionMetier(met) / somme);
+ smi.setProportionMetier(met, newProportion);
+ }
+ smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
+ log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
+ } else {
+ log.info("[TAC] Use no activity");
+
+ // sinon on met tout dans le metier nonActivite
+ MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
+ MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
+ ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
+ .getStrategies(step), siMatrix
+ .getMetiers(step));
+ mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
+
+ smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executée apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concerné
+ */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
+
+ if (affectation) {
+ // ATTENTION
+ // les captures pour cette metapop ne sont plus du qu'au metier
+ // pour qui l'espece est secondaire: elles sont affectees aux
+ // rejets
+
+ //pb : ne se fait pas par metier
+ // il faut une matrice pour chaques pas de temps qui stocke les
+ // rejets par metier, par metapop et par classes d'age (comme
+ // pour les captures)
+ //////
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+ log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+
+ log.info("pop : " + pop.getName());
+ // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
+ // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
+ // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
+ // TOUTES les captures dans les rejets
+ MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
+ //log.info("discard : " + discard);
+ if (discard != null) {
+ discard.mults(0);
+ }
+ log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
+ MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
+ // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
+ discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
+ log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
+ + discardRegle);
+ if (param_propSurvie > 0) {
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+ //on réajoute les survivants aux effectifs
+ for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
+ .next();) {
+ Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
+ eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
+ coord[2], coord[3])
+ + i.getValue() * param_propSurvie);
+ }
+ }
+ }
+ // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
+ // le refaire
+ affectation = false;
+ }
+
+ }
+
+}
1
0
Author: smahevas
Date: 2012-09-06 12:40:24 +0200 (Thu, 06 Sep 2012)
New Revision: 12
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-community/12
Log:
nouveau script
Added:
trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java
Added: trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java
===================================================================
--- trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java (rev 0)
+++ trunk/rules/TACpoids20012011TailleMin.java 2012-09-06 10:40:24 UTC (rev 12)
@@ -0,0 +1,445 @@
+/*
+ * #%L
+ * IsisFish data
+ * %%
+ * Copyright (C) 2006 - 2011 Ifremer, CodeLutin
+ * %%
+ * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+ * it under the terms of the GNU General Public License as
+ * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+ * License, or (at your option) any later version.
+ *
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+ * GNU General Public License for more details.
+ *
+ * You should have received a copy of the GNU General Public
+ * License along with this program. If not, see
+ * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+ * #L%
+ */
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.HashSet;
+import java.util.Set;
+import java.util.List;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Iterator;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixIterator;
+import org.nuiton.math.matrix.MatrixND;
+
+import scripts.ResultName;
+import scripts.RuleUtil;
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.EffortDescription;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Population;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Species;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.StrategyMonthInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.TargetSpecies;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.MetierSeasonInfo;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.PopulationGroup;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.TimeStep;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * TAC peut-etre utilise pour les differents TAC, en proportion des effectifs
+ * et/ou avec survie ou non.
+ *
+ * <li>Pour utiliser le tac proportionnel, il faut mettre dans le parametre
+ * propTac une valeur > 0, le TAC sera alors recalcule a chaque mois de janvier.
+ * <li>Pour utiliser la survie il faut mettre dans le parametre propSurvie une
+ * valeur > 0, automatiquement les suvie seront ajoute aux effectifs
+ *
+ * Created: 7 septembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.3 $
+ *
+ * Last update: $Date: 30 aout 2012 $
+ * by : $Author: Stephanie Mahevas$
+ */
+public class TACpoids20012011TailleMin extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(TACpoids20012011TailleMin.class);
+
+ @Doc("Affected species")
+ public Species param_species = null;
+
+ @Doc("Proportion de survie")
+ public double param_propSurvie = 0.45;
+
+
+ /** TAC in tonnes */
+ @Doc("TAC in tons 2001")
+ public double param_tacInTons2001 = 4000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2002")
+ public double param_tacInTons2002 = 3200.0;
+ @Doc("TAC in tons 2003")
+ public double param_tacInTons2003 = 3000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2004")
+ public double param_tacInTons2004 = 3150.0;
+ @Doc("TAC in tons 2005")
+ public double param_tacInTons2005 = 3100.0;
+ @Doc("TAC in tons 2006")
+ public double param_tacInTons2006 = 4000.0;
+ @Doc("TAC in tons 2007")
+ public double param_tacInTons2007 = 4320.0;
+ @Doc("TAC in tons 2008")
+ public double param_tacInTons2008 = 4320.0;
+ @Doc("TAC in tons 2009")
+ public double param_tacInTons2009 = 4100.0;
+ @Doc("TAC in tons 2010")
+ public double param_tacInTons2010 = 3900.0;
+ @Doc("TAC in tons 2011")
+ public double param_tacInTons2011 = 3900.0;
+
+ @Doc(value = "param_TailleMin")
+ public double param_TailleMin = 85.0;
+
+
+
+ boolean affectation = true; // pour ne passer qu'une seule fois dans afterSimulation (pour le premier metier)
+ boolean tacAtteint = false; // pour ne passer dans beforeSimulation que si le tac est atteint
+
+
+
+ protected String[] necessaryResult = {
+ // put here all necessary result for this rule
+ // example:
+ // ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ // ResultName.MATRIX_NET_VALUE_OF_LANDINGS_PER_STRATEGY_MET,
+ };
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ *
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Combinaison de la regle tac poids sur 2001-2011 avec tailleMin + prop de survie des rejets.");
+ }
+
+ /**
+ * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
+ * des valeurs
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ log.info("test si TAC atteint");
+ // read species in current session : plus necessaire bug resolu
+ //param_species = (Species) context.getDB().findByTopiaId(
+ // param_species.getTopiaId());
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ boolean result = false;
+ if (ts != null) { // on n'applique la regle que si espece capturée par ce metier
+ double param_tacInTons = 0;
+
+ if (step.getYear()>10) { //si on est apres 2011
+ result = false;
+ } else {
+ result = true; // au moins tailleMin s'applique
+ if (step.getYear()==0) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2001;
+ } else if (step.getYear()==1) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2002;
+ } else if (step.getYear()==2) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2003;
+ } else if (step.getYear()==3) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2004;
+ } else if (step.getYear()==4) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2005;
+ } else if (step.getYear()==5) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2006;
+ } else if (step.getYear()==6) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2007;
+ } else if (step.getYear()==7) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2008;
+ } else if (step.getYear()==8) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2009;
+ } else if (step.getYear()==9) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2010;
+ } else if (step.getYear()==10) {
+ param_tacInTons = param_tacInTons2011;
+ }
+ // test si Tac atteint
+ double catchTons = RuleUtil.getTotalCatchTons(context,
+ param_species, step);
+ log.info("[TAC] catchTons = " + catchTons
+ + " >= param_tacInTons:" + param_tacInTons);
+ if (catchTons >= param_tacInTons) {
+ tacAtteint = true;
+ }
+ }
+ }
+ return result;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context la simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+ affectation = true;
+
+ if (tacAtteint) {
+
+ log.info("[TAC] preAction for: " + metier);
+ log.info(" TAC atteint [TAC] preAction for: " + metier);
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(step.getMonth())
+ .getSpeciesTargetSpecies(param_species);
+ if (ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
+ // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
+ // aimedMetiers ne fonctionne pas je ne sais pas pourquoi ! mais au final forbiddenMetier aura le meme effet
+
+ context.getMetierMonitor().addforbiddenMetier(metier);
+
+ //recupere toutes les strategies pratiquant le metier et pour lesquelles la proportion !=0
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
+ for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(step)) {
+ double prop = str.getStrategyMonthInfo(step.getMonth())
+ .getProportionMetier(metier);
+ if (prop != 0) {
+ strs.add(str);
+ }
+ }
+
+ for (Strategy str : strs) {
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(step
+ .getMonth());
+
+ // 1er cas de figure: l'effort est reporte sur un metier de la
+ // meme strategie, n'ayant pas l'espece comme capture principale
+ // et pechant avec le meme engin
+ Set<Metier> possibleMetierCase1 = new HashSet<Metier>();
+ // second cas de figure: on cherche un metier de substitution
+ // sans condition sur les engins, mais qui soit pratique
+ Set<Metier> possibleMetierCase2 = new HashSet<Metier>();
+ // 3 eme cas de figure: on cherche des metiers non vises,
+ // sans consideration sur les engins, et pour lesquels la
+ // proportion peut etre nulle
+ Set<Metier> possibleMetierCase3 = new HashSet<Metier>();
+
+ for (EffortDescription effort : str.getSetOfVessels()
+ .getPossibleMetiers()) {
+ Metier newMetier = effort.getPossibleMetiers();
+ if (
+ /*!aimedMetiers.contains(newMetier)
+ &&*/!metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActiviy")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase("nonActivie")
+ && !metier.getName().equalsIgnoreCase(
+ "non Activite")
+ && !context.getMetierMonitor().getForbiddenMetier()
+ .contains(newMetier)) {
+ possibleMetierCase3.add(newMetier);
+
+ if (smi.getProportionMetier(newMetier) != 0) {
+ possibleMetierCase2.add(newMetier);
+
+ if (metier.getGear().equals(newMetier.getGear())) {
+ possibleMetierCase1.add(newMetier);
+ }
+ }
+ }
+ }
+
+ Set<Metier> possibleMetier = null;
+ if (possibleMetierCase1.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 1");
+ possibleMetier = possibleMetierCase1;
+ } else if (possibleMetierCase2.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 2");
+ possibleMetier = possibleMetierCase2;
+ } else if (possibleMetierCase3.size() != 0) {
+ log.info("[TAC] Use case 3");
+ possibleMetier = possibleMetierCase3;
+ }
+
+ if (possibleMetier != null) {
+ // on repartit maintenant l'effort entre les differents metiers
+ // possibles dans la meme strategie si un metier possible existe
+ // bien la repartion est proportionnelle a l'effort deja alloue
+ // dans la strategie
+
+ double somme = 0;
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ somme += smi.getProportionMetier(met);
+ }
+ for (Metier met : possibleMetier) {
+ double newProportion = smi.getProportionMetier(met)
+ + (smi.getProportionMetier(metier)
+ * smi.getProportionMetier(met) / somme);
+ smi.setProportionMetier(met, newProportion);
+ }
+ smi.setProportionMetier(metier, 0); //le metier vise a alors une proportion nulle
+ log.info("[TAC] il y a des metiers possibles");
+ } else {
+ log.info("[TAC] Use no activity");
+
+ // sinon on met tout dans le metier nonActivite
+ MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
+ MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(step,
+ ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY, siMatrix
+ .getStrategies(step), siMatrix
+ .getMetiers(step));
+ mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
+
+ smi.getProportionMetier().setValue(metier, 0);
+ }
+ }
+ }
+
+
+ }
+
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execute apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ *
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @param step le pas de temps courant
+ * @param metier le metier concern */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, TimeStep step, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+
+
+ if (affectation) {
+ // Application des rejets si Tac atteint et tailleMin sinon sur les captures
+ // la matrice de captures a une dimension metier - donc a cette etape, toutes
+ // les captures de tous les metiers sont connues
+ // Ne doit pas s'appliquer pour chaque metier de la boucle mais une seule fois!
+ // affectation est mis àtrue àla fin de la boucle sur les pop
+ // la preaction ne tourne que si le TAC est atteint
+
+ if (tacAtteint) { //postAction de la regle TAC dans ce cas TailleMin ne s'applique pas
+ log.info("[TAC] postAction for: " + metier);
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+ log.info("popMon biomass" + popMon.getBiomass(param_species));
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+
+ log.info("pop : " + pop.getName());
+ // si on a deja une matrice rejet on le vide (elle vient
+ // forcement de la regle taille minimale or si le tac est
+ // atteint, tout va dorenavent dans les rejets et on mais
+ // TOUTES les captures dans les rejets
+ MatrixND discard = popMon.getDiscard(step, pop);
+ //log.info("discard : " + discard);
+ if (discard != null) {
+ discard.mults(0);
+ }
+ log.info("catch = " + popMon.getCatch(pop));
+ MatrixND discardRegle = popMon.getCatch(pop).copy(); //nouvelle instance pour le calcul dans la regle
+ // ca ne doit pas pouvoir marcher car MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET est de dimension pop groupe str met - et discard n'a plus la dimension pop
+ discardRegle.setName(ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discardRegle);
+ log.info("[TAC] add discard for " + pop + ": "
+ + discardRegle);
+ if (param_propSurvie > 0) {
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+ //on réajoute les survivants aux effectifs
+ for (MatrixIterator i = discardRegle.iterator(); i
+ .next();) {
+ Object[] coord = i.getSemanticsCoordinates();
+ eff.setValue(coord[2], coord[3], eff.getValue(
+ coord[2], coord[3])
+ + i.getValue() * param_propSurvie);
+ }
+ }
+ }
+
+ } else {
+ //on applique TailleMin uniquement si tac pas atteint
+ log.info(" TailleMin.actionApres:" + step + " metapop:" +
+ param_species + " metier:" + metier);
+ log.info("deb de affecterCaptureREJETTailleMin");
+
+ PopulationMonitor popMon = context.getPopulationMonitor();
+
+ for (Population pop : param_species.getPopulation()) {
+ //if (popMon.getDiscard(step, pop) == null) {
+ MatrixND discard = popMon.getCatch(pop).copy();
+ MatrixND eff = popMon.getN(pop);
+
+ for (MatrixIterator i = discard.iterator(); i.next();) {
+ Object[] coordonnees = i.getSemanticsCoordinates();
+ PopulationGroup group =
+ (PopulationGroup) coordonnees[2];
+ if (group.getLength() >= param_TailleMin) {
+ i.setValue(0);
+ } else if (param_propSurvie > 0) {
+ eff.setValue(coordonnees[2], coordonnees[3],
+ eff.getValue(coordonnees[2],
+ coordonnees[3]) + i.getValue() *
+ param_propSurvie);
+ }
+ }
+ discard.setName(
+ ResultName.MATRIX_DISCARDS_PER_STR_MET_PER_ZONE_POP);
+ popMon.addDiscard(step, pop, discard);
+ //}
+ }
+
+ }
+ // on a affecte une fois cette meta pop au rejet il ne faut pas
+ // le refaire
+ affectation = false;
+ }
+
+ }
+
+}
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