ca ressemble à un problème de syntaxe dans le chemin d'accès

en unix /home1/datawork/nbarrier/libs/R/lib mais en R ??

J'ai fait des tests. Quand je lance R sur datarmor

getwd()
[1] "X:/ISIS_Travail/CalibrISIS_WestMed2412"

setwd("/home1/datawork/smahevas") ne fonctionne pas ni setwd("$DATAWORK/smahevas")

je ne sais pas quelle syntaxe il faut utiliser mais c'est le problème... Désolée de ne pas plus t'aider mais tu peux approfondir cette piste.

Sinon tu as un pb dans le fichier pbs : il faut que tu corriges
export ISIS_BD=$DATAWORK/myISISdb ---> $SCRATCH/myISISdb

a+
Steph

08/10/2024 à 15:27, dedah.ahmed-babou@ird.fr a écrit :
Bonjour à tous,
Je voudrais lancer une calibration sur datarmor. Le code R se plante car il ne trouve pas la fonction calibration_setup de la librairie calibrar. Je pense tout de même que j'ai bien accès au répertoire : NICO_REPO=/home1/datawork/nbarrier/libs/R/lib.

Ci-joint mes fichiers log, le pbs et le .R.

Si quelqu'un a une idée, merci par avance.

Dedah.


_______________________________________________
Isis-fish-users mailing list
Isis-fish-users@list.isis-fish.org
https://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
Archives et moteur de recherche: http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/
-- 
......................................................................
Stephanie MAHEVAS
UMR DECOD (Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l'océan)
IFREMER/HALGO/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique)  
https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/

 Tel: (33) 2 40 37 41 81 - 06 75 83 59 33

    o   \ o /  _ o         __|    \ /     |__        o _  \ o /   o
   /|\    |     /\   ___\o   \o    |    o/    o/__   /\     |    /|\
   / \   / \   | \  /)  |    ( \  /o\  / )    |  (\  / |   / \   / \
......................................................................