Plan d'analyse: calibration avec 1 q
Merci Eric pour la ligne de code, ca marche. Une question sur la calibration de la capturabilité q. Je suis en train de modifier le script CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite pour qu'il n'évalue qu'un seul q par espèce (je crois que Benoit l'avais fait aussi). Donc je fais beaucoup de copier/coller. Au niveau données, ma population a 8 groupes d'âge dans ISIS. J'ai 8 ans de données de débarquements mensuels (les groupes, metiers et startegies sont cumulés) donc la matrice de débarquements observés est de dimension 96 lignes *1 colonne Le code compile bien, par contre ca se corse quand je tente une simulation... La simulation se termine mais en fait utilise la valeur q de défaut que j'ai rentré dans l'interface. La calibration elle-même plante lamentablement. En toute apparence j'ai raté quelque chose dans mon code.... D'après le debug, la calibration s'arrête pendant le after simulation, quand elle essaye d'obtenir la valeur observée pour la comparer a la valeur simulée afin de calculer le critère. Effectivement, l'indice (dim) ne veut rien dire. Comment se faisse ?! Le debug ainsi que mon script de calibration qui ne marche pas (si ca aide) sont en PJ (en zip parce que c'est un peu gros...). Merci d'avance ! Jess *************************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow Wild Fisheries Program-Fisheries Aquaculture & Coasts (FAC) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre@utas.edu.au<mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º>
Le 01/04/2011 04:37, Jessica Andre a écrit :
Merci Eric pour la ligne de code, ca marche.
Une question sur la calibration de la capturabilité /q/. Je suis en train de modifier le script CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite pour qu’il n’évalue qu’un seul /q /par espèce (je crois que Benoit l’avais fait aussi). Donc je fais beaucoup de copier/coller.
Au niveau données, ma population a 8 groupes d’âge dans ISIS. J’ai 8 ans de données de débarquements mensuels (les groupes, metiers et startegies sont cumulés) donc la matrice de débarquements observés est de dimension 96 lignes *1 colonne
Le code compile bien, par contre ca se corse quand je tente une simulation... La simulation se termine mais en fait utilise la valeur q de défaut que j’ai rentré dans l’interface. La calibration elle-même plante lamentablement. En toute apparence j’ai raté quelque chose dans mon code….
D’après le debug, la calibration s’arrête pendant le after simulation, quand elle essaye d’obtenir la valeur observée pour la comparer a la valeur simulée afin de calculer le critère. Effectivement, l’indice (dim) ne veut rien dire.
Comment se faisse ?!
Le debug ainsi que mon script de calibration qui ne marche pas (si ca aide) sont en PJ (en zip parce que c’est un peu gros…).
Il y a deux erreurs différentes dans le debug lié au fait que les matrices L et matrixLandings n'ont pas les mêmes dimensions. La premières est : INFO [pool-2-thread-2] (SimplexCalibration1Cachability.java:371) afterSimulation - dimension of L [96, 1, 1, 1, 1] INFO [pool-2-thread-2] (SimplexCalibration1Cachability.java:372) afterSimulation - dimension of observation [96, 1] ERROR [pool-2-thread-2] (SimulationService.java:925) finished - Stop simulation plan, because can't call afterSimulation correctly on plan analyseplans.SimplexCalibration1Cachability java.util.NoSuchElementException: L'élément demandé [0, 0, 0, 0, 0] n'existe pas dans la matrice [96, 1] Après, je pense que vous avez retester en ajoutant la ligne: L = L.reduce(); qui a provoqué l'erreur suivante : INFO [pool-2-thread-2] (SimplexCalibration1Cachability.java:371) afterSimulation - dimension of L [96] INFO [pool-2-thread-2] (SimplexCalibration1Cachability.java:372) afterSimulation - dimension of observation [96, 1] ERROR [pool-2-thread-2] (SimulationService.java:925) finished - Stop simulation plan, because can't call afterSimulation correctly on plan analyseplans.SimplexCalibration1Cachability java.util.NoSuchElementException: L'élément demandé [0] n'existe pas dans la matrice [96, 1] Dans votre cas, il faut sûrement réduire la matrice sur les dimensions voulues via "L.reduceDims(int... dims)" car "L.reduce();" la réduit trop. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
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