lansement des simulations
Bonjour, J’ai un petit problème, je suis en train d’installer l’analyse de sensibilité sur un nouvel ordi (système Windows 7) mais dès que je lance les simus de l’analyse, ISIS se ferme toute de suit, j’ai déjà eu le même problème quand j’ai lancé la sensibilité avec la nouvelle version. J’ai suivi les suggestions d’Eric Chatelleier dans son mail de 14 octobre mais le problème persiste. Je vous envoie le fichier d’erreor après que j’ai modifié le fichier "go.bat" et ajouter à la fin "2>&1" Merci bien pour votre aide Chirine
Le 27/11/2009 16:45, chirine HUSSEIN a écrit :
Bonjour,
J’ai un petit problème, je suis en train d’installer l’analyse de sensibilité sur un nouvel ordi (système Windows 7) mais dès que je lance les simus de l’analyse, ISIS se ferme toute de suit, j’ai déjà eu le même problème quand j’ai lancé la sensibilité avec la nouvelle version. J’ai suivi les suggestions d’Eric Chatelleier dans son mail de 14 octobre mais le problème persiste.
Bonjour, Sous windows 7, c'est possible, nous n'avons pas encore eu la possibilité de tester Isis-fish sur ce système. Pouvez vous nous fournir quelques renseignement pour déterminer l'origine du probleme : - quelle est la version de R que vous avez installé ? - est-il possible que votre Windows 7 soit une version 64 bits ? - ou est installé R ? cela peut etre par exemple : - C:\Program Files\R-2.9.2\library -ou C:\Users\yourname\Documents\R\win-library\2.9 -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
bonjour, la version de R que j'ai installé est R 2.9.0, il est installé : C:\programmes\R le systeme d'explotation de Windows 7est une version 32 bits merci bien ________________________________ De : Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Ven 27 Novembre 2009, 17 h 04 min 57 s Objet : Re: [Isis-fish-users] lansement des simulations Le 27/11/2009 16:45, chirine HUSSEIN a écrit :
Bonjour,
J’ai un petit problème, je suis en train d’installer l’analyse de sensibilité sur un nouvel ordi (système Windows 7) mais dès que je lance les simus de l’analyse, ISIS se ferme toute de suit, j’ai déjà eu le même problème quand j’ai lancé la sensibilité avec la nouvelle version. J’ai suivi les suggestions d’Eric Chatelleier dans son mail de 14 octobre mais le problème persiste.
Bonjour, Sous windows 7, c'est possible, nous n'avons pas encore eu la possibilité de tester Isis-fish sur ce système. Pouvez vous nous fournir quelques renseignement pour déterminer l'origine du probleme : - quelle est la version de R que vous avez installé ? - est-il possible que votre Windows 7 soit une version 64 bits ? - ou est installé R ? cela peut etre par exemple : - C:\Program Files\R-2.9.2\library -ou C:\Users\yourname\Documents\R\win-library\2.9 -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
Le 30/11/2009 09:26, chirine HUSSEIN a écrit :
bonjour, la version de R que j'ai installé est R 2.9.0, il est installé : C:\programmes\R le systeme d'explotation de Windows 7est une version 32 bits
merci bien Bonjour,
En fait, le message d'erreur dit bien qu'il n'arrive pas a trouver les librairies de R. Pouvez-vous verifier que vous avez bien les deux variables d'envirronement suivantes : - R_HOME qui a pour valeur "C:\Program Files\R\R-2.9.0" - PATH qui contient "%R_HOME%\bin" PS: Je complete la FAQ sur le wiki d'Isis -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
Pouvez-vous verifier que vous avez bien les deux variables d'envirronement suivantes : - R_HOME qui a pour valeur "C:\Program Files\R\R-2.9.0"
j'ai verfié l'existance des deux varibles. ________________________________ De : Jean Couteau <couteau@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Lun 30 Novembre 2009, 10 h 08 min 11 s Objet : Re: [Isis-fish-users] Re : lansement des simulations plutôt "C:\programmes\R\R-2.9.0" ou "C:\programmes\R" non ? _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
j'ai verfié l'existance des deux varibles.
Pouvez vous refaire le test avec le fichier go.bat en piece-jointe et me revoyer le fichier debug.txt ? Merci. PS: le fichier joint s'appele "go.txt" (a renommer en go.bat) parce que on ne peut pas envoyer de fichier bat par mail. -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
j'ai verfié l'existance des deux varibles.
Pouvez vous refaire le test avec le fichier go.bat en piece-jointe et me revoyer le fichier debug.txt ?
Merci.
PS: le fichier joint s'appele "go.txt" (a renommer en go.bat) parce que on ne peut pas envoyer de fichier bat par mail.
Plutot ce fichier go.bat là. -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
voila le fichier debud.txt Merci ________________________________ De : Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Lun 30 Novembre 2009, 11 h 44 min 46 s Objet : Re: [Isis-fish-users] Re : Re : lansement des simulations
j'ai verfié l'existance des deux varibles.
Pouvez vous refaire le test avec le fichier go.bat en piece-jointe et me revoyer le fichier debug.txt ?
Merci.
PS: le fichier joint s'appele "go.txt" (a renommer en go.bat) parce que on ne peut pas envoyer de fichier bat par mail.
Plutot ce fichier go.bat là. -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
voila le fichier debud.txt Merci
Les deux variables ont l'air bonnes. Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci
Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister.
J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\". Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug. merci bien ________________________________ De : Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Lun 30 Novembre 2009, 13 h 50 min 49 s Objet : Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : lansement des simulations Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
Ok, donc maintenant ce n'est plus un problème de Windows 7 mais un problème R. Le package sensitivity a-t-il été installé dans R (install.packages("sensitivity"))? Si oui, quels sont les paramètres de l'AS ? (nombre de facteurs, cardinalité)? (Est-ce bien 86 facteurs continus de cardinalité 5 ?) chirine HUSSEIN wrote:
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug.
merci bien
------------------------------------------------------------------------ *De :* Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 13 h 50 min 49 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : lansement des simulations
Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci
Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister.
J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0".
-- Éric <chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com>> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com <http://www.codelutin.com/>
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oui, j'ai bien installé le package sensitivity dans R, pour les paramètres de AS, j'ai 86 facteurs continus de cardinalité 5. merci ________________________________ De : Jean Couteau <couteau@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Lun 30 Novembre 2009, 15 h 11 min 24 s Objet : Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : Re : lansement des simulations Ok, donc maintenant ce n'est plus un problème de Windows 7 mais un problème R. Le package sensitivity a-t-il été installé dans R (install.packages("sensitivity"))? Si oui, quels sont les paramètres de l'AS ? (nombre de facteurs, cardinalité)? (Est-ce bien 86 facteurs continus de cardinalité 5 ?) chirine HUSSEIN wrote:
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug. merci bien
------------------------------------------------------------------------ *De :* Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 13 h 50 min 49 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : lansement des simulations
Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci > Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0".
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oui, j'ai bien installé le package sensitivity dans R, pour les paramètres de AS, j'ai 86 facteurs continus de cardinalité 5. merci Je ne vois aucun problème dans le code R généré par ISIS, cependant ce code n'est pas interprété par R. J'ai essayé de différentes manières et j'arrive a créer le plan d'expérience directement depuis R en simplifiant légèrement l'expression. Néanmoins, la génération fonctionne bien et pour d'autres AS nous avons pu utiliser la méthode de Morris sans problèmes et sans modification. C'est pourquoi je pense que nous rencontrons un bug dans cette méthode. Je vais essayer de contacter les
chirine HUSSEIN wrote: personnes ayant programmé le package sensitivity pour essayer de trouver le problème. Jean Couteau Code Lutin PS : le code : a<-morris(model=NULL,factors=86,r=10,design=list(type="oat",levels=c(5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5),grid.jump=c(2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2)),binf=c(0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,12.0,0.06,10.0,11.0,0.0,0.0,0.0,10.0,0.0,11.0,0.0,1120.0,0.0,10.0,22.0,12.0,10.0,10.0,11.0,0.0,11.0,15.0,0.0,0.0,23.0,16.0,22.0,0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,18.0,0.0,0.0,11.0,11.0,0.0,3.0,22.0,0.0,8.0,0.0,0.0,0.0,0.0,8.0,0.1456,11.0,0.0,18.0,17.0,11.0,7.0,11.0,20.0,0.0464,16.0,0.0,1.0,0.1515,0.0,0.0,0.0,0.0,1.0,11.0,9.0,0.0,0.0,11.0,1120.0,1120.0,0.0749,0.0,1120.0,0.0,0.0,13.0,16.0,0.0),bsup=c(1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,16.0,0.09,14.0,15.0,2.0,2.0,1.0,14.0,1.0,15.0,1.0,1680.0,1.0,14.0,26.0,16.0,14.0,14.0,14.0,1.0,15.0,19.0,1.0,1.0,27.0,20.0,26.0,1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,22.0,2.0,1.0,15.0,15.0,1.0,7.0,26.0,1.0,12.0,1.0,1.0,2.0,1.0,12.0,0.2184,15.0,1.0,22.0,21.0,15.0,11.0,15.0,24.0,0.0696,20.0,1.0,5.0,0.22,1.0,1.0,2.0,1.0,5.0,15.0,13.0,1.0,1.0,15.0,1680.0,1680.0,0.11244,1.0,1680.0,2.0,1.0,17.0,20.0,1.0)) m'a permis de générer le plan d'expérience. Vous pouvez essayer de passer le paramètre modifR à true et de remplacer l'expression présentée par celui-ci, cela devrait générer le bon plan d'expérience mais sans les noms des facteurs. Cela ne devrait rien changer mais je vous recommende d'interpréter les résultats avec la plus grande attention possible au cas ou des facteurs seraient inversés (cela ne devrait pas être le cas mais il vaut mieux faire attention). Attention aussi au nombre de simulations générées, vous allez en avoir 870 à faire tourner ainsi, cela risque de prendre beaucoup de temps.
------------------------------------------------------------------------ *De :* Jean Couteau <couteau@codelutin.com> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 15 h 11 min 24 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : Re : lansement des simulations
Ok, donc maintenant ce n'est plus un problème de Windows 7 mais un problème R.
Le package sensitivity a-t-il été installé dans R (install.packages("sensitivity"))?
Si oui, quels sont les paramètres de l'AS ? (nombre de facteurs, cardinalité)? (Est-ce bien 86 facteurs continus de cardinalité 5 ?)
chirine HUSSEIN wrote:
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug. merci bien
------------------------------------------------------------------------ *De :* Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com>> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 13 h 50 min 49 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : lansement des simulations
Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci
Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0".
-- Éric <chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com> <mailto:chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com>>> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com <http://www.codelutin.com/> <http://www.codelutin.com/>
_______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org <mailto:Isis-fish-users@list.isis-fish.org> <mailto:Isis-fish-users@list.isis-fish.org <mailto:Isis-fish-users@list.isis-fish.org>> http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
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Bonjour, Je viens de lire votre mail car j’avais un problème de connexion depuis hier, je pense que le problème n’est pas avec la méthode de Morris, car j’ai déjà testé le même plan des simulations sur mon enceint ordinateur (Windows XP). Merci bien ________________________________ De : Jean Couteau <couteau@codelutin.com> À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Envoyé le : Lun 30 Novembre 2009, 16 h 12 min 07 s Objet : Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : Re : Re : lansement des simulations chirine HUSSEIN wrote:
oui, j'ai bien installé le package sensitivity dans R, pour les paramètres de AS, j'ai 86 facteurs continus de cardinalité 5. merci Je ne vois aucun problème dans le code R généré par ISIS, cependant ce code n'est pas interprété par R. J'ai essayé de différentes manières et j'arrive a créer le plan d'expérience directement depuis R en simplifiant légèrement l'expression. Néanmoins, la génération fonctionne bien et pour d'autres AS nous avons pu utiliser la méthode de Morris sans problèmes et sans modification. C'est pourquoi je pense que nous rencontrons un bug dans cette méthode. Je vais essayer de contacter les personnes ayant programmé le package sensitivity pour essayer de trouver le problème.
Jean Couteau Code Lutin PS : le code : a<-morris(model=NULL,factors=86,r=10,design=list(type="oat",levels=c(5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5),grid.jump=c(2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2)),binf=c(0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,12.0,0.06,10.0,11.0,0.0,0.0,0.0,10.0,0.0,11.0,0.0,1120.0,0.0,10.0,22.0,12.0,10.0,10.0,11.0,0.0,11.0,15.0,0.0,0.0,23.0,16.0,22.0,0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,18.0,0.0,0.0,11.0,11.0,0.0,3.0,22.0,0.0,8.0,0.0,0.0,0.0,0.0,8.0,0.1456,11.0,0.0,18.0,17.0,11.0,7.0,11.0,20.0,0.0464,16.0,0.0,1.0,0.1515,0.0,0.0,0.0,0.0,1.0,11.0,9.0,0.0,0.0,11.0,1120.0,1120.0,0.0749,0.0,1120.0,0.0,0.0,13.0,16.0,0.0),bsup=c(1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,16.0,0.09,14.0,15.0,2.0,2.0,1.0,14.0,1.0,15.0,1.0,1680.0,1.0,14.0,26.0,16.0,14.0,14.0,14.0,1.0,15. 0,19.0,1.0,1.0,27.0,20.0,26.0,1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,22.0,2.0,1.0,15.0,15.0,1.0,7.0,26.0,1.0,12.0,1.0,1.0,2.0,1.0,12.0,0.2184,15.0,1.0,22.0,21.0,15.0,11.0,15.0,24.0,0.0696,20.0,1.0,5.0,0.22,1.0,1.0,2.0,1.0,5.0,15.0,13.0,1.0,1.0,15.0,1680.0,1680.0,0.11244,1.0,1680.0,2.0,1.0,17.0,20.0,1.0)) m'a permis de générer le plan d'expérience. Vous pouvez essayer de passer le paramètre modifR à true et de remplacer l'expression présentée par celui-ci, cela devrait générer le bon plan d'expérience mais sans les noms des facteurs. Cela ne devrait rien changer mais je vous recommende d'interpréter les résultats avec la plus grande attention possible au cas ou des facteurs seraient inversés (cela ne devrait pas être le cas mais il vaut mieux faire attention). Attention aussi au nombre de simulations générées, vous allez en avoir 870 à faire tourner ainsi, cela risque de prendre beaucoup de temps.
------------------------------------------------------------------------ *De :* Jean Couteau <couteau@codelutin.com> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 15 h 11 min 24 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : Re : lansement des simulations
Ok, donc maintenant ce n'est plus un problème de Windows 7 mais un problème R.
Le package sensitivity a-t-il été installé dans R (install.packages("sensitivity"))?
Si oui, quels sont les paramètres de l'AS ? (nombre de facteurs, cardinalité)? (Est-ce bien 86 facteurs continus de cardinalité 5 ?)
chirine HUSSEIN wrote:
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug. merci bien
------------------------------------------------------------------------ *De :* Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com>> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 13 h 50 min 49 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : lansement des simulations
Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci > Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0".
-- Éric <chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com> <mailto:chatellier@codelutin.com <mailto:chatellier@codelutin.com>>> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com <http://www.codelutin.com/> <http://www.codelutin.com/>
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chirine HUSSEIN wrote:
Bonjour,
Je viens de lire votre mail car j’avais un problème de connexion depuis hier, je pense que le problème n’est pas avec la méthode de Morris, car j’ai déjà testé le même plan des simulations sur mon enceint ordinateur (Windows XP).
Merci bien
Après quelques échanges sur les mailing-list de R m'ont permis d'identifier le problème. En fait, le problème vient du fait que la commande est trop longue pour R, il faudrait la couper en plusieures lignes. Je ne sais pas si ça peut marcher car je n'ai pas essayé encore, mais vous pouvez essayer de modifier l'instruction envoyée à R (en mettant le paramètre modifR à true) et couper l'instruction en plusieures lignes (attention à la scission qui doit être réalisée conformément aux conventions R (parenthèses et virgules)). Autrement la méthode indiquée dans mes mails précédent devrait fonctionner aussi. Jean
------------------------------------------------------------------------ *De :* Jean Couteau <couteau@codelutin.com> *À :* isis-fish-users@list.isis-fish.org *Envoyé le :* Lun 30 Novembre 2009, 16 h 12 min 07 s *Objet :* Re: [Isis-fish-users] Re : Re : Re : Re : Re : lansement des simulations
chirine HUSSEIN wrote:
oui, j'ai bien installé le package sensitivity dans R, pour les paramètres de AS, j'ai 86 facteurs continus de cardinalité 5. merci Je ne vois aucun problème dans le code R généré par ISIS, cependant ce code n'est pas interprété par R. J'ai essayé de différentes manières et j'arrive a créer le plan d'expérience directement depuis R en simplifiant légèrement l'expression. Néanmoins, la génération fonctionne bien et pour d'autres AS nous avons pu utiliser la méthode de Morris sans problèmes et sans modification. C'est pourquoi je pense que nous rencontrons un bug dans cette méthode. Je vais essayer de contacter les personnes ayant programmé le package sensitivity pour essayer de trouver le problème.
Jean Couteau Code Lutin
PS : le code :
a<-morris(model=NULL,factors=86,r=10,design=list(type="oat",levels=c(5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5,5),grid.jump=c(2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2,2)),binf=c(0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,12.0,0.06,10.0,11.0,0.0,0.0,0.0,10.0,0.0,11.0,0.0,1120.0,0.0,10.0,22.0,12.0,10.0,10.0,11.0,0.0,11.0,15.0,0.0,0.0,23.0,16.0,22.0,0.0,0.0,0.0,11.0,10.0,18.0,0.0,0.0,11.0,11.0,0.0,3.0,22.0,0.0,8.0,0.0,0.0,0.0,0.0,8.0,0.1456,11.0,0.0,18.0,17.0,11.0,7.0,11.0,20.0,0.0464,16.0,0.0,1.0,0.1515,0.0,0.0,0.0,0.0,1.0,11.0,9.0,0.0,0.0,11.0,1120.0,1120.0,0.0749,0.0,1120.0,0.0,0.0,13.0,16.0,0.0),bsup=c(1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,16.0,0.09,14.0,15.0,2.0,2.0,1.0,14.0,1.0,15.0,1.0,1680.0,1.0,14.0,26.0,16.0,14.0,14.0 ,14.0,1.0,15.0,19.0,1.0,1.0,27.0,20.0,26.0,1.0,1.0,1.0,15.0,14.0,22.0,2.0,1.0,15.0,15.0,1.0,7.0,26.0,1.0,12.0,1.0,1.0,2.0,1.0,12.0,0.2184,15.0,1.0,22.0,21.0,15.0,11.0,15.0,24.0,0.0696,20.0,1.0,5.0,0.22,1.0,1.0,2.0,1.0,5.0,15.0,13.0,1.0,1.0,15.0,1680.0,1680.0,0.11244,1.0,1680.0,2.0,1.0,17.0,20.0,1.0))
m'a permis de générer le plan d'expérience. Vous pouvez essayer de passer le paramètre modifR à true et de remplacer l'expression présentée par celui-ci, cela devrait générer le bon plan d'expérience mais sans les noms des facteurs. Cela ne devrait rien changer mais je vous recommende d'interpréter les résultats avec la plus grande attention possible au cas ou des facteurs seraient inversés (cela ne devrait pas être le cas mais il vaut mieux faire attention). Attention aussi au nombre de simulations générées, vous allez en avoir 870 à faire tourner ainsi, cela risque de prendre beaucoup de temps.
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Ok, donc maintenant ce n'est plus un problème de Windows 7 mais un
<mailto:couteau@codelutin.com>> problème R.
Le package sensitivity a-t-il été installé dans R
(install.packages("sensitivity"))?
Si oui, quels sont les paramètres de l'AS ? (nombre de facteurs,
cardinalité)? (Est-ce bien 86 facteurs continus de cardinalité 5 ?)
chirine HUSSEIN wrote:
j'ai essayé avec la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0". ISIS ne se ferme plus mais, les simulation ne demarent pas??? je vous en envoie le nouveau fichier de debug. merci bien
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Le 30/11/2009 12:06, Eric Chatellier a écrit :
voila le fichier debud.txt Merci
Les deux variables ont l'air bonnes.
Par contre, le dossier "C:\Programmes\R\R-2.9.0\bin" n'a pas l'air d'exister. J'ai l'impression que le dossier s'appele toujours "C:\Program Files\" même si Windows vous affiche quelques chose en français à la place "C:\Programmes\".
Pouvez vous quand même tenter de définir la variable R_HOME à "C:\Program Files\R\R-2.9.0".
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