Merci Eric pour la nouvelle version et la doc nickel. * Nous ne parvenons pas à lancer cependant. en pj un dossier avec la région, le prescript, un fichier csv qui ressemblerait a ce que R produirait, un parameter.properties et la ligne de commande pour Lancer isis depuis R (launchISIS.R). Peux tu regarder ce qui cloche, possiblement dans le prescript ? * Nous n'avons pas lancé isis sur le pc de Ricardo au préalable peut etre est ce ce qui bloque ? Quand on lance comme ca, cree t il le isis-fish-4?​ testFromR.zip <https://drive.google.com/file/d/1nnp_Yv3mL-Eb5vYG3gslA33tysDq2t6Q/view?usp=drive_web> ​ * D'autre part comment faire pour utiliser un script d'export non present dans le svn officiel ? Doit on lancer isis obligatoirement une fois sur le PC pour ajouter l'export dans le isis-fish-4 ? Merci beaucoup Le 19 juillet 2018 à 13:43, Sigrid Lehuta <sigridlehuta@gmail.com> a écrit :

Merci beaucoup Eric ! On essaie demain avec Ricardo, je te tiens au courant et t'appelerai peut etre si j ai des questions. Sigrid

2018-07-19 10:38 GMT+02:00 Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com>:

...

Bonjour,

Suite à la réunion d'hier, voici la version d'isis (en developpement) qui permet de lancer des simulations sur une region en ligne de commande: https://forge.codelutin.com/attachments/download/5369/isis- fish-4.4.2.1-r9-gc9040f4a-bin.zip

Et le début de documentation associé: http://isis-fish.org/v4/user/tutorials/simulationFromR.html

-- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28 _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

Le 20/07/2018 à 18:49, Sigrid Lehuta a écrit :

Au cas ou le lien ne marcherait pas...

Le 20 juillet 2018 à 18:47, Sigrid Lehuta <sigridlehuta@gmail.com <mailto:sigridlehuta@gmail.com>> a écrit :

Merci Eric pour la nouvelle version et la doc nickel.

* Nous ne parvenons pas à lancer cependant. en pj un dossier avec la région, le prescript, un fichier csv qui ressemblerait a ce que R produirait, un parameter.properties et la ligne de commande pour Lancer isis depuis R (launchISIS.R). Peux tu regarder ce qui cloche, possiblement dans le prescript ?

Je parviens a lancer le tout depuis R en modifiant le prescript par contre:     MEMORY="-Xmx2048M"     exec = "isis-fish-4.4.2.1-SNAPSHOT.jar"     log = "debug.txt"     args = "--simulationWithRegionNameAndScript test"     region = "DiscardLess_Channel"     script = "preScript.java"     cmd = sprintf("java %s -jar %s %s %s %s", MEMORY, exec, args, region, script)     message(cmd)     system(cmd) J'ai supprimé du fichier "parameters.properties" les paramêtres liè aux optimisations (dans le contexte) ca n'a pas trop de sens. Et la simulation fini tout de même par s'arréter en erreur, mais c'est du à des erreurs d'equation dans la région. C'est un changement que l'on avait décidé pour la version 4.4.2.0 dans IsisFish, si les equations ne compilent pas, maintenant, les simulations échouent: https://forge.codelutin.com/issues/9677

* Nous n'avons pas lancé isis sur le pc de Ricardo au préalable peut etre est ce ce qui bloque ? Quand on lance comme ca, cree t il le isis-fish-4?​  testFromR.zip <https://drive.google.com/file/d/1nnp_Yv3mL-Eb5vYG3gslA33tysDq2t6Q/view?usp=drive_web>

Normalement non, les simulations se lance après récupération des dépots de sources. Mais il faut avoir une connexion internent quand même.

​ * D'autre part comment faire pour utiliser un script d'export non present dans le svn officiel ? Doit on lancer isis obligatoirement une fois sur le PC pour ajouter l'export dans le isis-fish-4 ?

S'il est dans le dossier "communautaire", cela fonctionnera (Isis va le récuperer). L'important est qu'il soit dans le dossier isis-fish-4 quand la simulation démarre. -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28