[Echobase-commits] r537 - in trunk/echobase-tools/src: main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders test/resources/csv/new

13 Apr 2012

Author: tchemit
Date: 2012-04-13 12:37:05 +0200 (Fri, 13 Apr 2012)
New Revision: 537

Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/echobase/537

Log:
fixes #1107: pb cr?\195?\169ation base embarqu?\195?\169e avec donn?\195?\169es Pelgas2000 ?\195?\160 2010

Removed:
   trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoader.java
   trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoaderIT.java
   trunk/echobase-tools/src/test/resources/csv/new/input-Echotype.csv
Modified:
   trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoader.java
   trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/AbstractLoaderIT.java
   trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoaderIT.java
   trunk/echobase-tools/src/test/resources/csv/new/input-Voyage_echotype.csv

Deleted: trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoader.java
===================================================================

--- trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoader.java	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoader.java	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -1,131 +0,0 @@
-/*
- * #%L
- * EchoBase :: Tools
- * 
- * $Id$
- * $HeadURL$
- * %%
- * Copyright (C) 2011 Ifremer, Codelutin
- * %%
- * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
- * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by
- * the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
- * (at your option) any later version.
- * 
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU Affero General Public License
- * along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * #L%
- */
-package fr.ifremer.echobase.tools.loaders;
-
-import com.google.common.collect.Maps;
-import fr.ifremer.echobase.EchoBaseFunctions;
-import fr.ifremer.echobase.csv.EntityCsvModel;
-import fr.ifremer.echobase.entities.EchoBaseEntityEnum;
-import fr.ifremer.echobase.entities.data.Echotype;
-import fr.ifremer.echobase.entities.meta.AssociationMeta;
-import fr.ifremer.echobase.entities.meta.TableMeta;
-import fr.ifremer.echobase.entities.references.DepthStratum;
-import fr.ifremer.echobase.entities.references.EchotypeCategory;
-import fr.ifremer.echobase.entities.references.Species;
-import fr.ifremer.echobase.services.DbEditorService;
-import fr.ifremer.echobase.tools.FileType;
-import org.nuiton.util.csv.Import;
-
-import java.io.File;
-import java.io.IOException;
-import java.util.List;
-import java.util.Map;
-
-/**
- * {@link Echotype} loader.
- *
- * @author tchemit <chemit@codelutin.com>
- * @since 0.3
- */
-public class EchotypeLoader extends EntityLoader<Echotype> {
-
-    public EchotypeLoader() {
-        super(Echotype.class,
-              new EchoBaseEntityEnum[]{EchoBaseEntityEnum.Species},
-              FileType.NEW);
-    }
-
-    @Override
-    protected void exportAssociations(File outputDir,
-                                      FileType targetType) throws IOException {
-        super.exportAssociations(outputDir, targetType);
-
-        // also export echotype associations (echotype are references)
-        AssociationMeta associationMeta =
-                getMeta().getAssociations(Echotype.PROPERTY_SPECIES);
-
-        exportAssociation(outputDir, targetType, associationMeta);
-    }
-
-    @Override
-    protected EntityCsvModel<Echotype> createCsvImportModel(TableMeta meta) {
-
-        List<Species> species = getEntities(Species.class);
-        List<DepthStratum> depthStratums = getEntities(DepthStratum.class);
-        List<EchotypeCategory> echotypeCategorys = getEntities(EchotypeCategory.class);
-
-        EntityCsvModel<Echotype> model = EntityCsvModel.newModel(
-                getCsvSeparator(),
-                meta
-        );
-
-        /*
-        "ECHOS";"IMAGES";"LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION";"ID_DESCRIPTION_DEVIATION";"GENRE_ESP;TYPE_DEVIATION"
-         */
-        model.addDefaultColumn("ID_DESCRIPTION_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_ID, int.class);
-        model.newMandatoryColumn("ECHOS", Echotype.PROPERTY_NAME);
-        model.newMandatoryColumn("LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_MEANING);
-        model.addForeignKeyForImport("IMAGES", Echotype.PROPERTY_DEPTH_STRATUM, DepthStratum.class, depthStratums, EchoBaseFunctions.DEPTH_STRATUM_ID);
-        model.addForeignKeyForImport("TYPE_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_ECHOTYPE_CATEGORY, EchotypeCategory.class, echotypeCategorys, EchoBaseFunctions.ECHO_TYPE_CATEGORY_NAME);
-        model.addForeignKeyForAssociationForImport("GENRE_ESP", Echotype.PROPERTY_SPECIES, Species.class, species, EchoBaseFunctions.SPECIES_BARACOUDA_CODE);
-        return model;
-    }
-
-    @Override
-    protected void importNewEntities(DbEditorService dbEditorService,
-                                     TableMeta meta,
-                                     Import<Echotype> importer) {
-
-        Map<String, String> keystoTopiaId = Maps.newHashMap();
-
-        for (Echotype entity : importer) {
-
-            // key for this echotype : id + depthStratum 
-            String key = entity.getId() + "_" + entity.getDepthStratum().getId();
-
-            String topiaId = keystoTopiaId.get(key);
-
-            if (topiaId == null) {
-
-                // create this new echotype
-                dbEditorService.saveEntity(meta,
-                                           "",
-                                           entity,
-                                           null,
-                                           false
-                );
-
-                topiaId = entity.getTopiaId();
-                keystoTopiaId.put(key, topiaId);
-            }
-
-            // just push the species of this echotype
-            // the saveEntity can not save it
-            Species species = entity.getSpecies().iterator().next();
-
-            Echotype echotype = getEntityById(Echotype.class, topiaId);
-            echotype.addSpecies(species);
-        }
-    }
-}

Modified: trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoader.java
===================================================================
--- trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoader.java	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoader.java	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -23,22 +23,26 @@
  */
 package fr.ifremer.echobase.tools.loaders;
 
-import com.google.common.base.Preconditions;
 import com.google.common.collect.Lists;
+import com.google.common.collect.Maps;
 import com.healthmarketscience.jackcess.Database;
 import com.healthmarketscience.jackcess.Table;
 import fr.ifremer.echobase.EchoBaseFunctions;
 import fr.ifremer.echobase.EchoBaseTechnicalException;
+import fr.ifremer.echobase.csv.AbstractImportModel;
 import fr.ifremer.echobase.csv.EchobaseCsvUtil;
 import fr.ifremer.echobase.entities.EchoBaseEntityEnum;
 import fr.ifremer.echobase.entities.data.Echotype;
-import fr.ifremer.echobase.entities.data.EchotypeDAO;
+import fr.ifremer.echobase.entities.data.EchotypeImpl;
 import fr.ifremer.echobase.entities.data.Voyage;
 import fr.ifremer.echobase.entities.meta.AssociationMeta;
 import fr.ifremer.echobase.entities.meta.TableMeta;
 import fr.ifremer.echobase.entities.references.AreaOfOperation;
+import fr.ifremer.echobase.entities.references.DepthStratum;
+import fr.ifremer.echobase.entities.references.EchotypeCategory;
 import fr.ifremer.echobase.entities.references.Mission;
 import fr.ifremer.echobase.entities.references.Species;
+import fr.ifremer.echobase.services.DbEditorService;
 import fr.ifremer.echobase.tools.FileType;
 import org.apache.commons.logging.Log;
 import org.apache.commons.logging.LogFactory;
@@ -46,10 +50,6 @@
 import org.nuiton.topia.persistence.TopiaDAO;
 import org.nuiton.util.csv.Import;
 import org.nuiton.util.csv.ImportModel;
-import org.nuiton.util.csv.ImportToMap;
-import org.nuiton.util.csv.ImportableColumn;
-import org.nuiton.util.csv.ModelBuilder;
-import org.nuiton.util.csv.ValueSetter;
 
 import java.io.BufferedReader;
 import java.io.File;
@@ -68,20 +68,17 @@
 public class VoyageLoader extends EntityLoader<Voyage> {
 
     /** Logger. */
-    private static final Log log =
-            LogFactory.getLog(AcousticInstrumentLoader.class);
+    private static final Log log = LogFactory.getLog(VoyageLoader.class);
 
     public VoyageLoader() {
-        super(Voyage.class,
-              new EchoBaseEntityEnum[]{EchoBaseEntityEnum.Echotype},
-              FileType.BARACOUDA);
+        super(Voyage.class, FileType.BARACOUDA);
     }
 
     @Override
     protected void exportAssociations(File outputDir, FileType targetType) throws IOException {
         super.exportAssociations(outputDir, targetType);
 
-        // also export echotype associations (echotype are references)
+        // also export voyage - echotype associations
         AssociationMeta associationMeta =
                 getMeta().getAssociations(Voyage.PROPERTY_ECHOTYPE);
 
@@ -134,53 +131,68 @@
         }
     }
 
-    public void generateEchotypeAssociation(File csvfile,
-                                            File outputDir,
-                                            boolean cleanTransaction) throws IOException, TopiaException {
+    public void generateEchotype(File csvfile,
+                                 File outputDir,
+                                 boolean cleanTransaction) throws IOException, TopiaException {
 
-
-        Map<String, Species> speciess =
-                getUniverse(Species.class, EchoBaseFunctions.SPECIES_BARACOUDA_CODE);
-
         Map<String, Voyage> voyages =
                 getUniverse(Voyage.class, EchoBaseFunctions.VOYAGE_NAME);
 
-        EchotypeImportModel model = new EchotypeImportModel(getCsvSeparator());
+        Map<String, Species> species = getUniverse(Species.class, EchoBaseFunctions.SPECIES_BARACOUDA_CODE);
+        Map<String, DepthStratum> depthStratums = getUniverse(DepthStratum.class, EchoBaseFunctions.DEPTH_STRATUM_ID);
+        Map<String, EchotypeCategory> echotypeCategorys = getUniverse(EchotypeCategory.class, EchoBaseFunctions.ECHO_TYPE_CATEGORY_NAME);
 
-        /*
-       "CAMPAGNE";"ECHOS";"IMAGES";"LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION";"ID_DESCRIPTION_DEVIATION";"GENRE_ESP"
-        */
-        model.newMandatoryColumn("CAMPAGNE");
-        model.newMandatoryColumn("ID_DESCRIPTION_DEVIATION");
-        model.newMandatoryColumn("GENRE_ESP");
-        model.newIgnoredColumn("ECHOS");
-        model.newIgnoredColumn("IMAGES");
-        model.newIgnoredColumn("LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION");
+        ImportModel<EchotyeRow> model = new EchotypeImportModel(
+                getCsvSeparator(),
+                voyages,
+                species,
+                depthStratums,
+                echotypeCategorys
+        );
 
-        TableMeta meta = getTable(EchoBaseEntityEnum.Voyage);
+        TableMeta meta = getTable(EchoBaseEntityEnum.Echotype);
         AssociationMeta associationMeta =
-                meta.getAssociations(Voyage.PROPERTY_ECHOTYPE);
+                getMeta().getAssociations(Voyage.PROPERTY_ECHOTYPE);
 
+        DbEditorService dbEditorService =
+                getService(DbEditorService.class);
+
         try {
-            EchotypeDAO echotypeDAO = (EchotypeDAO) getDAO(Echotype.class);
             BufferedReader bf = new BufferedReader(new FileReader(csvfile));
             try {
 
-                Import<Map<String, Object>> importer = ImportToMap.newImport(model, bf);
+                Map<String, String> keystoTopiaId = Maps.newHashMap();
 
+                Import<EchotyeRow> importer = Import.newImport(model, bf);
+
                 try {
-                    for (Map<String, Object> entity : importer) {
-                        String campagneName = (String) entity.get("CAMPAGNE");
-                        String idEchotype = (String) entity.get("ID_DESCRIPTION_DEVIATION");
-                        String specieEchotype = (String) entity.get("GENRE_ESP");
-                        Voyage voayge = getFK(voyages, campagneName);
-                        Species species = getFK(speciess, specieEchotype);
-                        Echotype echotype = echotypeDAO.findByIdAndSpecies(
-                                Integer.valueOf(idEchotype),
-                                species
-                        );
-                        Preconditions.checkNotNull(echotype, String.format("Could not find echotype with (id,species) = (%s,%s)", idEchotype, specieEchotype));
-                        voayge.addEchotype(echotype);
+                    for (EchotyeRow row : importer) {
+
+                        Echotype entity = row.getEchotype();
+
+                        // key for this echotype : id + depthStratum
+                        String key = entity.getId() + "_" + entity.getDepthStratum().getId();
+
+                        String topiaId = keystoTopiaId.get(key);
+
+                        if (topiaId == null) {
+
+                            // create this new echotype
+                            dbEditorService.saveEntity(meta,
+                                                       "",
+                                                       entity,
+                                                       null,
+                                                       false
+                            );
+
+                            topiaId = entity.getTopiaId();
+                            keystoTopiaId.put(key, topiaId);
+
+                            Echotype echotypeSaved =
+                                    dbEditorService.getEntityById(Echotype.class, topiaId);
+                            echotypeSaved.addSpecies(row.getSpecies());
+                            row.getVoyage().addEchotype(echotypeSaved);
+                        }
                     }
                 } finally {
 
@@ -195,10 +207,15 @@
                 bf.close();
             }
 
-            File out = getTableFile(outputDir, associationMeta, FileType.ASSOCIATION);
+            File out;
 
+            // Export echotypes
+            out = getTableFile(outputDir, meta, FileType.NEW);
+            getExportService().exportDatas(meta, out);
+
+            // Export voyage - echotype association
+            out = getTableFile(outputDir, associationMeta, FileType.ASSOCIATION);
             getExportService().exportDatas(associationMeta, out);
-
         } finally {
             if (cleanTransaction) {
                 serviceContext.getTransaction().rollbackTransaction();
@@ -206,43 +223,86 @@
         }
     }
 
-    public static class EchotypeImportModel implements ImportModel<Map<String, Object>> {
+    public static class EchotyeRow {
 
-        protected final char separator;
+        protected final Echotype echotype;
 
+        protected Voyage voyage;
 
-        protected final ModelBuilder<Map<String, Object>> modelBuilder;
+        protected Species species;
 
-        public EchotypeImportModel(char separator) {
-            this.separator = separator;
-            modelBuilder = new ModelBuilder<Map<String, Object>>();
+        public EchotyeRow() {
+            echotype = new EchotypeImpl();
         }
 
-        @Override
-        public char getSeparator() {
-            return separator;
+        public Voyage getVoyage() {
+            return voyage;
         }
 
-        @Override
-        public void pushCsvHeaderNames(List<String> headerNames) {
+        public Species getSpecies() {
+            return species;
         }
 
-        @Override
-        public Map<String, Object> newEmptyInstance() {
-            return null;
+        public Echotype getEchotype() {
+            return echotype;
         }
 
-        @Override
-        public Iterable<ImportableColumn<Map<String, Object>, Object>> getColumnsForImport() {
-            return (Iterable) modelBuilder.getColumnsForImport();
+        public void setVoyage(Voyage voyage) {
+            this.voyage = voyage;
         }
 
-        public ImportableColumn<Map<String, Object>, String> newMandatoryColumn(String headerName) {
-            return modelBuilder.newMandatoryColumn(headerName, (ValueSetter) EchobaseCsvUtil.newMapProperty(headerName));
+        public void setSpecies(Species species) {
+            this.species = species;
         }
 
-        public ImportableColumn<Map<String, Object>, String> newIgnoredColumn(String headerName) {
-            return modelBuilder.newIgnoredColumn(headerName);
+        public void setName(String name) {
+            echotype.setName(name);
         }
+
+        public void setMeaning(String meaning) {
+            echotype.setMeaning(meaning);
+        }
+
+        public void setId(int id) {
+            echotype.setId(id);
+        }
+
+        public void setEchotypeCategory(EchotypeCategory echotypeCategory) {
+            echotype.setEchotypeCategory(echotypeCategory);
+        }
+
+        public void setDepthStratum(DepthStratum depthStratum) {
+            echotype.setDepthStratum(depthStratum);
+        }
     }
+
+    public static class EchotypeImportModel extends AbstractImportModel<EchotyeRow> {
+
+
+        public EchotypeImportModel(char separator,
+                                   Map<String, Voyage> voyages,
+                                   Map<String, Species> species,
+                                   Map<String, DepthStratum> depthStratums,
+                                   Map<String, EchotypeCategory> echotypeCategorys) {
+            super(separator);
+
+
+            /*
+             "CAMPAGNE";"ECHOS";"IMAGES";"LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION";"ID_DESCRIPTION_DEVIATION";"GENRE_ESP";"TYPE_DEVIATION"
+            */
+
+            newMandatoryColumn("ID_DESCRIPTION_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_ID, EchobaseCsvUtil.PRIMITIVE_INTEGER);
+            newMandatoryColumn("ECHOS", Echotype.PROPERTY_NAME);
+            newMandatoryColumn("LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_MEANING);
+            newForeignKeyColumn("CAMPAGNE", "voyage", Voyage.class, Voyage.PROPERTY_NAME, voyages);
+            newForeignKeyColumn("IMAGES", Echotype.PROPERTY_DEPTH_STRATUM, DepthStratum.class, DepthStratum.PROPERTY_ID, depthStratums);
+            newForeignKeyColumn("GENRE_ESP", Echotype.PROPERTY_SPECIES, Species.class, Species.PROPERTY_BARACOUDA_CODE, species);
+            newForeignKeyColumn("TYPE_DEVIATION", Echotype.PROPERTY_ECHOTYPE_CATEGORY, EchotypeCategory.class, EchotypeCategory.PROPERTY_NAME, echotypeCategorys);
+        }
+
+        @Override
+        public VoyageLoader.EchotyeRow newEmptyInstance() {
+            return new EchotyeRow();
+        }
+    }
 }
\ No newline at end of file

Modified: trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/AbstractLoaderIT.java
===================================================================
--- trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/AbstractLoaderIT.java	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/AbstractLoaderIT.java	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -352,7 +352,6 @@
             entityLoaders.add(newService(TSParametersLoader.class));
             entityLoaders.add(newService(StrataLoader.class));
             entityLoaders.add(newService(EchotypeCategoryLoader.class));
-            entityLoaders.add(newService(EchotypeLoader.class));
             entityLoaders.add(newService(VesselTypeLoader.class));
             entityLoaders.add(newService(VesselLoader.class));
             entityLoaders.add(newService(OperationEventLoader.class));

Deleted: trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoaderIT.java
===================================================================
--- trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoaderIT.java	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/EchotypeLoaderIT.java	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -1,46 +0,0 @@
-/*
- * #%L
- * EchoBase :: Tools
- * 
- * $Id$
- * $HeadURL$
- * %%
- * Copyright (C) 2011 Ifremer, Codelutin
- * %%
- * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
- * it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by
- * the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
- * (at your option) any later version.
- * 
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU Affero General Public License
- * along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * #L%
- */
-package fr.ifremer.echobase.tools.loaders;
-
-import fr.ifremer.echobase.entities.data.Echotype;
-import org.junit.Test;
-
-/**
- * To test the {@link EchotypeLoader}.
- *
- * @author tchemit <chemit@codelutin.com>
- * @since 0.2
- */
-public class EchotypeLoaderIT extends AbstractLoaderIT<Echotype, EchotypeLoader> {
-
-    public EchotypeLoaderIT() {
-        super(EchotypeLoader.class, 43, 0);
-    }
-
-    @Test
-    public void testGenerateNewEntities() throws Exception {
-        generateNewEntities();
-    }
-
-}

Modified: trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoaderIT.java
===================================================================
--- trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoaderIT.java	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders/VoyageLoaderIT.java	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -24,11 +24,9 @@
 package fr.ifremer.echobase.tools.loaders;
 
 import fr.ifremer.echobase.entities.EchoBaseEntityEnum;
-import fr.ifremer.echobase.entities.data.Echotype;
 import fr.ifremer.echobase.entities.data.Voyage;
 import fr.ifremer.echobase.entities.meta.AssociationMeta;
 import fr.ifremer.echobase.entities.meta.MetaFilenameAware;
-import fr.ifremer.echobase.entities.meta.TableMeta;
 import fr.ifremer.echobase.tools.FileType;
 import org.junit.Assert;
 import org.junit.Test;
@@ -64,15 +62,13 @@
     }
 
     @Test
-    public void testGenerateEchotypeAssociation() throws Exception {
+    public void testGenerateEchotype() throws Exception {
 
         loadDependencies(EchoBaseEntityEnum.Voyage, dones);
+        loadDependencies(EchoBaseEntityEnum.Species, dones);
+        loadDependencies(EchoBaseEntityEnum.DepthStratum, dones);
+        loadDependencies(EchoBaseEntityEnum.EchotypeCategory, dones);
 
-        TableMeta table = serviceContext.getDbMeta().getTable(EchoBaseEntityEnum.Echotype);
-        AssociationMeta echotypeAssociation =
-                table.getAssociations(Echotype.PROPERTY_SPECIES);
-        loadDependencies(echotypeAssociation, dones);
-
         AssociationMeta associationMeta =
                 loader.getMeta().getAssociations(Voyage.PROPERTY_ECHOTYPE);
 
@@ -88,7 +84,7 @@
         Assert.assertTrue(inFile.exists());
 
 
-        loader.generateEchotypeAssociation(
+        loader.generateEchotype(
                 inFile,
                 outFile,
                 true

Deleted: trunk/echobase-tools/src/test/resources/csv/new/input-Echotype.csv
===================================================================
--- trunk/echobase-tools/src/test/resources/csv/new/input-Echotype.csv	2012-04-13 00:48:55 UTC (rev 536)
+++ trunk/echobase-tools/src/test/resources/csv/new/input-Echotype.csv	2012-04-13 10:37:05 UTC (rev 537)
@@ -1,184 +0,0 @@
-"ECHOS";"IMAGES";"LIBELLE_DESCRIPTION_DEVIATION";"ID_DESCRIPTION_DEVIATION";"GENRE_ESP";"TYPE_DEVIATION"
-"D1";"CLAS";"(JUV03) agrégats ou bancs à proximité immédiate du fond (<10 m d'altitude)";37;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"(JUV03) agrégats ou bancs à proximité immédiate du fond (<10 m d'altitude)";37;"ENGR-ENC";PO;
-"D1";"CLAS";"(JUV03) agrégats ou bancs à proximité immédiate du fond (<10 m d'altitude)";37;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"MICR-POU";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"MICR-POU";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"SCOM-JAP";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"SCOM-SCO";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"MICR-POU";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"SCOM-JAP";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"SCOM-SCO";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC";PO;
-"D1";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL";PO;
-"D1";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP";PO;
-"D1";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO";PO;
-"D1";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-PIC";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + POUTASSOU + divers )";26;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + POUTASSOU + divers )";26;"MICR-POU";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + POUTASSOU + divers )";26;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + POUTASSOU + divers )";26;"TRAC-TRU";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"COMP-LEM";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"MERL-MER";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"MERL-MNG";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"SCOM-JAP";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"SCOM-SCO";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"TRAC-MED";PO;
-"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"TRAC-TRU";PO;
-"D2";"CLAS";"(JUV03) bancs bien formés de pleine eau";38;"CLUP-HAR";PO;
-"D2";"CLAS";"(JUV03) bancs bien formés de pleine eau";38;"ENGR-ENC";PO;
-"D2";"CLAS";"(JUV03) bancs bien formés de pleine eau";38;"SARD-PIL";PO;
-"D2";"CLAS";"(JUV03) bancs bien formés de pleine eau";38;"SCOM-SCO";PO;
-"D2";"CLAS";"(JUV03) bancs bien formés de pleine eau";38;"SPRA-SPR";PO;
-"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"ENGR-ENC";PO;
-"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"SARD-PIL";PO;
-"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"SPRA-SPR";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs bien distincts: Anchois, Sardines Sprats et Harengs situés entre le fond et 50m au dessus du fond";61;"CLUP-HAR";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs bien distincts: Anchois, Sardines Sprats et Harengs situés entre le fond et 50m au dessus du fond";61;"ENGR-ENC";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs bien distincts: Anchois, Sardines Sprats et Harengs situés entre le fond et 50m au dessus du fond";61;"SARD-PIL";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs bien distincts: Anchois, Sardines Sprats et Harengs situés entre le fond et 50m au dessus du fond";61;"SPRA-SPR";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"ENGR-ENC";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SARD-PIL";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SCOM-JAP";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SCOM-SCO";PO;
-"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SPRA-SPR";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection accores et large (merlan bleu et petit anchois PEGASE 97)";25;"ENGR-ENC";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection accores et large (merlan bleu et petit anchois PEGASE 97)";25;"MICR-POU";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"CAPR-APE";PO;
-"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"MICR-POU";PO;
-"D3";"CLAS";"Merlans bleus, myctophidés et capros présents au large";62;"CAPR-APE";PO;
-"D3";"CLAS";"Merlans bleus, myctophidés et capros présents au large";62;"MICR-POU";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV03) agrégats à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";39;"ENGR-ENC";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV03) agrégats à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";39;"SARD-PIL";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV03) agrégats à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";39;"SCOM-SCO";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"ENGR-ENC";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"KATS-PEL";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"SARD-PIL";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"SCOM-JAP";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"SCOM-SCO";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"THYN-ALA";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"TRAC-MED";PO;
-"D3";"SURF";"(JUV05) Détection en surface dont Juvenile d'anchois - diffuse et continue";31;"TRAC-TRU";PO;
-"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SCOM-SCO";PO;
-"D4";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE";PO;
-"D4";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU";PO;
-"D4";"SURF";"(JUV03) bancs bien formés à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";40;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"SURF";"(JUV03) bancs bien formés à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";40;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"SURF";"(JUV03) bancs bien formés à proximité de la surface (<35 m de profondeur)";40;"SCOM-SCO";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SCOM-JAP";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SCOM-SCO";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SPRA-SPR";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"TRAC-MED";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"TRAC-TRU";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-JAP";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-SCO";PO;
-"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SPRA-SPR";PO;
-"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SPRA-SPR";PO;
-"D4";"SURF";"Sardines, Maquereaux, Anchois situés proche de la surface";63;"ENGR-ENC";PO;
-"D4";"SURF";"Sardines, Maquereaux, Anchois situés proche de la surface";63;"SARD-PIL";PO;
-"D4";"SURF";"Sardines, Maquereaux, Anchois situés proche de la surface";63;"SCOM-JAP";PO;
-"D4";"SURF";"Sardines, Maquereaux, Anchois situés proche de la surface";63;"SCOM-SCO";PO;
-"D5";"CLAS";"""Fau D2"" - CHINCHARD en banc classique, dense et très mobile";2;"TRAC-MED";PO;
-"D5";"CLAS";"""Fau D2"" - CHINCHARD en banc classique, dense et très mobile";2;"TRAC-TRU";PO;
-"D5";"CLAS";"(Pel03) Gros Bancs très denses et très mobiles de CHINCHARD";20;"TRAC-TRU";PO;
-"D5";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE";PO;
-"D5";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU";PO;
-"D5";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"CAPR-APE";PO;
-"D5";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"MICR-POU";PO;
-"D5";"CLAS";"Grands fléchards";14;"TRAC-TRU";PO;
-"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"COMP-LEM";PO;
-"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"MERL-MER";PO;
-"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"MICR-POU";PO;
-"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"TRAC-MED";PO;
-"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"TRAC-TRU";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"ENGR-ENC";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"SARD-PIL";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"SCOM-JAP";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"SCOM-SCO";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"SPRA-SPR";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"TRAC-MED";PO;
-"D6";"CLAS";"(JUV05) catégorie non classifiable";33;"TRAC-TRU";PO;
-"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"COMP-LEM";PO;
-"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"ENGR-ENC";PO;
-"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SARD-PIL";PO;
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-"PEGASE1997";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SPRA-SPR"
-"PEGASE1997";"D3";"CLAS";"Détection accores et large (merlan bleu et petit anchois PEGASE 97)";25;"ENGR-ENC"
-"PEGASE1997";"D3";"CLAS";"Détection accores et large (merlan bleu et petit anchois PEGASE 97)";25;"MICR-POU"
-"PEGASE1998";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"COMP-LEM"
-"PEGASE1998";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-MED"
-"PEGASE1998";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-PIC"
-"PEGASE1998";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-TRU"
-"PEGASE1998";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"ENGR-ENC"
-"PEGASE1998";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SARD-PIL"
-"PEGASE1998";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SCOM-JAP"
-"PEGASE1998";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SCOM-SCO"
-"PEGASE1998";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau ) + grands fléchards";8;"SPRA-SPR"
-"PEGASE1998";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"CAPR-APE"
-"PEGASE1998";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores et grands fonds (merlan bleu)";11;"MICR-POU"
-"PELGAS2000";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"COMP-LEM"
-"PELGAS2000";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-MED"
-"PELGAS2000";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-PIC"
-"PELGAS2000";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2000";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2000";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2000";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2000";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2000";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2000";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2000";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2000";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2000";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SARD-PIL"
-"PELGAS2000";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2000";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2000";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"COMP-LEM"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SARD-PIL"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"TRAC-MED"
-"PELGAS2000";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2001";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"COMP-LEM"
-"PELGAS2001";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-MED"
-"PELGAS2001";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-PIC"
-"PELGAS2001";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers)";12;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2001";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2001";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2001";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2001";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2001";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2001";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2001";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SARD-PIL"
-"PELGAS2001";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2001";"D5";"CLAS";"Grands fléchards";14;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2002";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"COMP-LEM"
-"PELGAS2002";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"TRAC-MED"
-"PELGAS2002";"D1";"CLAS";"Diffuse près du fond (Chinchard + divers) + bancs de chinchards";13;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2002";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2002";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2002";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2002";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2002";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2002";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2002";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2002";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2002";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SARD-PIL"
-"PELGAS2002";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2002";"D5";"CLAS";"""Fau D2"" - CHINCHARD en banc classique, dense et très mobile";2;"TRAC-MED"
-"PELGAS2002";"D5";"CLAS";"""Fau D2"" - CHINCHARD en banc classique, dense et très mobile";2;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2003";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"COMP-LEM"
-"PELGAS2003";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"MICR-POU"
-"PELGAS2003";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-MED"
-"PELGAS2003";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2003";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2003";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2003";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2003";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2003";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2003";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2003";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2003";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2003";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SARD-PIL"
-"PELGAS2003";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2003";"D5";"CLAS";"(Pel03) Gros Bancs très denses et très mobiles de CHINCHARD";20;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"COMP-LEM"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SARD-PIL"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"TRAC-MED"
-"PELGAS2003";"D6";"CLAS";"(Pel03) MELANGE - D1+D2 lorsque la structure ne permet pas de les distinguer";18;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"COMP-LEM"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"MICR-POU"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"TRAC-MED"
-"PELGAS2004";"D1";"CLAS";"(PEL04) déviation de type D1 avec du maquereau en plus";22;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2004";"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2004";"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"SARD-PIL"
-"PELGAS2004";"D2";"CLAS";"(PEL04) D2 classique sans le maquereau";24;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2004";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2004";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2004";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2004";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SARD-PIL"
-"PELGAS2004";"D4";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2004";"D5";"CLAS";"(Pel03) Gros Bancs très denses et très mobiles de CHINCHARD";20;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2004";"D6";"CLAS";"(PEL04) Maquereau";23;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2004";"D6";"CLAS";"(PEL04) Maquereau";23;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2005";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"COMP-LEM"
-"PELGAS2005";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"MICR-POU"
-"PELGAS2005";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-MED"
-"PELGAS2005";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2005";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2005";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2005";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2005";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2005";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2005";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2005";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SARD-PIL"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"TRAC-MED"
-"PELGAS2005";"D4";"SURF";"(Pel05) Bancs de surface (sardine, anchois, maquereau, sprat, chinchard)";29;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2005";"D6";"CLAS";"(Pel05) Chandelles (anchois, chinchard)";30;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2005";"D6";"CLAS";"(Pel05) Chandelles (anchois, chinchard)";30;"TRAC-MED"
-"PELGAS2005";"D6";"CLAS";"(Pel05) Chandelles (anchois, chinchard)";30;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"COMP-LEM"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"MICR-POU"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"TRAC-MED"
-"PELGAS2006";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2006";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2006";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2006";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2006";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2006";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2006";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2006";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2006";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2006";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SARD-PIL"
-"PELGAS2006";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2006";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2006";"D4";"SURF";"(Pel06) petits bancs denses sous surface (sardine, anchois, maquereau, sprat)";43;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2006";"D5";"CLAS";"(Pel03) Gros Bancs très denses et très mobiles de CHINCHARD";20;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"COMP-LEM"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"MICR-POU"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"SARD-PIL"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"TRAC-MED"
-"PELGAS2006";"D6";"CLAS";"(Pel06) Melange de D1 et D2 non différenciable";44;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2007";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"COMP-LEM"
-"PELGAS2007";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"MICR-POU"
-"PELGAS2007";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-MED"
-"PELGAS2007";"D1";"CLAS";"(Pel03) Diffuse près du fond (Chinchard + divers + POUTASSOU)";21;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2007";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2007";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SARD-PIL"
-"PELGAS2007";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-JAP"
-"PELGAS2007";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2007";"D2";"CLAS";"Bancs classiques (Sardine, sprat, Anchois, Maquereau )";7;"SPRA-SPR"
-"PELGAS2007";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"CAPR-APE"
-"PELGAS2007";"D3";"CLAS";"Détection rupture pente accores (merlan bleu, myctophidés)";10;"MICR-POU"
-"PELGAS2007";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"ENGR-ENC"
-"PELGAS2007";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SARD-PIL"
-"PELGAS2007";"D4";"CLAS";"(Pel07) Bancs de surface (Sardine, anchois et maquereau)";50;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2007";"D6";"CLAS";"(PEL07) bancs de sardine";47;"SARD-PIL"
-"PELGAS2007";"D7";"CLAS";"(Pel07) bancs de maquereau";48;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2007";"D8";"CLAS";"(Pel07) Détection au fond - mélange chinchard et maquereau";49;"COMP-LEM"
-"PELGAS2007";"D8";"CLAS";"(Pel07) Détection au fond - mélange chinchard et maquereau";49;"MICR-POU"
-"PELGAS2007";"D8";"CLAS";"(Pel07) Détection au fond - mélange chinchard et maquereau";49;"SCOM-SCO"
-"PELGAS2007";"D8";"CLAS";"(Pel07) Détection au fond - mélange chinchard et maquereau";49;"TRAC-MED"
-"PELGAS2007";"D8";"CLAS";"(Pel07) Détection au fond - mélange chinchard et maquereau";49;"TRAC-TRU"
-"PELGAS2008";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"COMP-LEM"
-"PELGAS2008";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"MICR-POU"
-"PELGAS2008";"D1";"CLAS";"(Pel06) diffuses et en petites boules près du fond (chinchard + maquereau + divers)";42;"SCOM-JAP"
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+"PELGAS2009";"D6";"SURF";"Petits bancs denses en Surface (Sardine , anchois zone sud )";15;"ENGR-ENC";PO
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+"PELGAS2010";"D1";"CLAS";"Maquereaux, Chinchards et gadidés présents dans les couches à proximité du fond";60;"COMP-LEM";PO
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+"PELGAS2010";"D4";"SURF";"Sardines, Maquereaux, Anchois situés proche de la surface";63;"ENGR-ENC";PO
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+"PELGAS2010";"D5";"CLAS";"Points bleus près du fond (Merlans leus, merlus et chinchards)";64;"COMP-LEM";PO
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[Echobase-commits] r537 - in trunk/echobase-tools/src: main/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders test/java/fr/ifremer/echobase/tools/loaders test/resources/csv/new

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