Le 19/04/2010 09:13, Bastien Preuss a écrit :
Bonjour,
Bonjour,
Une question pour Eric je pense !
Je peux maintenant faire tourner isis sur le cluster (à noter que isis est bcp plus fluide sur mon poste windows, que sur la machine d’entrée du cluster sous Linux).
Mais il y a un petit soucis :
En fait, on ouvre isis sur la machine d’entrée du cluster puis on envoie la simu à distance sur le cluster comme si c’était CAPARMOR, en modifiant la configuration. Après avoir appuyer sur « simuler » la fenêtre de progression s’ouvre, mais là la simu reste toujours sur « préparation du démarrage ». Pour que la simu se lance réellement il faut lancer en ligne de commande un fichier créé par isis… La simu semble alors se dérouler correctement.
Mais ce qui est bizarre, c’est que l’on ne voit nulle part le Job sur le cluster, en fait il semble que isis ne passe pas par pbs qui gère les jobs du cluster. Isis créé un fichier .csh, mais ne semble pas le communiquer à pbs…
Cela viendrait-il d’un problème dans les paramètres de configuration de la liaison avec le cluster (la connexion marche bien quand on fait le test)?
Ou autre chose ?
C'est déjà pas mal. Je me doutais que cela ne fonctionnerais pas du premier coup et qu'il y aurait une phase de tâtonnement pour trouver la bonne configuration. Voici ce que fait Isis (dans le cas d'une seule simulation) : /usr/pbs/bin/qsub -m n /home/<user>/isis-tmp/simulation-xyz-script.seq|tee /home/user/isis-tmp/simulation-xyz-pbs.id où : /home/<user>/isis-tmp est le dossier temporaire où isis met toutes les données xyz est l'identifiant de la simulation simulation-xyz-script.seq est le script pour psb simulation-xyz-pbs.id est un fichier où est ecrit le numéro du job PSB Donc: l'executable /usr/pbs/bin/qsub doit exister (l'emplacement se configure dans Isis) Ensuite, la commande totale ne devrait renvoyer aucune erreur. Sinon, comment lancez vous le job à la main ? PS: tu peut téléphoner un matin si tu veux, ca sera moins long -- Éric <chatellier@codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com