Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration
Oui j'ai déjà effectué la calibration de la manière que tu viens de décrire, et c'est en utilisant les meilleurs valeurs de q1 et q2 que j'obtiens ces écarts d'environs -15% sur la capture annuelle. Je me demandais juste si cela semblait correcte par rapport à ce qui est obtenu dans d'autres appli Isis. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 18:27 À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration Question délicate... La Palisse te dirait il faut que l'écart soit minimal.... c'est le principe de l'optimisation on cherche ici un minimum. Donc conditionnellement à ton modèle, tu prends la valeur de q qui minimise tes écarts entre obs et simulées. Il est clair que si tu changes ton critere en cours de calibration tu fausses l'algorithme. Il faudrait dans ce cas utiliser un algorithme d'optimisation multi-criteres, mais j'imagine que tu n'as pas le temps d'explorer cette piste. Donc pragmatiquement, il faut 1/ choisir une variable de sortie Y et critere Somme des ecarts au carré entre Yobs et Ysimulé, chercher la valeur de q qui minimise cet écart 2/ si plusieurs valeurs possibles, identifier d'autres Y (Y' et Y") de sortie d'ISIS pour lesquelles tu as des observations et confronter à nouveau tes Y'simu et Y"simu à Y'obs et Y"obs. Tu peux alors sélectionner la valeur de q qui te semble la plus satisfaisante. Pour plus de ref, Sigrid a un papier en cours de révision. Elle peut peut-etre te le transmettre??? bon courage stephanie Bastien Preuss a écrit :
Bonjour,
Une petite questions pour ceux qui ont du recul sur leur(s) application(s) Isis.
Je me demande quel écart entre captures observées et captures simulées est acceptable après calibration de la capturabilité.
Dans mon cas, ma captures totale annuelle est de +15% par rapport à ma capture observée qui me sert de référence. Bien sur, lorsque que je regarde à un niveau plus fin, par exemple les captures par mois, par stratégie, etc. cet écart varie, généralement entre +-1% et +-97%.
Merci.
Bastien
Bastien Preuss
Doctorant (PhD Student)
IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie
101 Promenade Roger Laroque
BP A5
98848 Noumea cedex
New-Caledonia
Tel: (+687) 260 723
P_ __afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité_
------------------------------------------------------------------------
_______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
-- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas@ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
je ne me rappelle pas quels étaient les ordres de grandeurs Sigrid? Youen? Benoit? Camille?... mais dans tous les cas, je ne suis pas sure que cela soit un indicateur très pertinent car si tu as un gros pics observés que tu ne reproduis pas tu vas gonfler ton % alors que tout le reste sera nikel, plus tu augmentent ton pas de temps, plus tu as de chance de gonfler ton % ..... steph Bastien Preuss a écrit :
Oui j'ai déjà effectué la calibration de la manière que tu viens de décrire, et c'est en utilisant les meilleurs valeurs de q1 et q2 que j'obtiens ces écarts d'environs -15% sur la capture annuelle. Je me demandais juste si cela semblait correcte par rapport à ce qui est obtenu dans d'autres appli Isis.
Bastien
-----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 18:27 À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration
Question délicate... La Palisse te dirait il faut que l'écart soit minimal.... c'est le principe de l'optimisation on cherche ici un minimum. Donc conditionnellement à ton modèle, tu prends la valeur de q qui minimise tes écarts entre obs et simulées. Il est clair que si tu changes ton critere en cours de calibration tu fausses l'algorithme. Il faudrait dans ce cas utiliser un algorithme d'optimisation multi-criteres, mais j'imagine que tu n'as pas le temps d'explorer cette piste. Donc pragmatiquement, il faut 1/ choisir une variable de sortie Y et critere Somme des ecarts au carré entre Yobs et Ysimulé, chercher la valeur de q qui minimise cet écart 2/ si plusieurs valeurs possibles, identifier d'autres Y (Y' et Y") de sortie d'ISIS pour lesquelles tu as des observations et confronter à nouveau tes Y'simu et Y"simu à Y'obs et Y"obs. Tu peux alors sélectionner la valeur de q qui te semble la plus satisfaisante. Pour plus de ref, Sigrid a un papier en cours de révision. Elle peut peut-etre te le transmettre??? bon courage stephanie
Bastien Preuss a écrit :
Bonjour,
Une petite questions pour ceux qui ont du recul sur leur(s) application(s) Isis.
Je me demande quel écart entre captures observées et captures simulées est acceptable après calibration de la capturabilité.
Dans mon cas, ma captures totale annuelle est de +15% par rapport à ma capture observée qui me sert de référence. Bien sur, lorsque que je regarde à un niveau plus fin, par exemple les captures par mois, par stratégie, etc. cet écart varie, généralement entre +-1% et +-97%.
Merci.
Bastien
Bastien Preuss
Doctorant (PhD Student)
IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie
101 Promenade Roger Laroque
BP A5
98848 Noumea cedex
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Hello, je n avais pas calcule les ecarts en %... c est tres subjectif tout ca... ca depend ce que tu optimises, combien de points etc. Pour la mortalite naturelle par exemple on avait carrement optimise les valeurs du taux de croissance de la population (tendance) plutot que celle de la biomasse point par point et la tu peux avoir un fit parfait. je m etais surtout assuree de la reproduction des patterns saisonniers et des tendances, de l absence de biais systematique, meme si les valeurs absolues etaient parfois un peu eloignees des observations. voici le papier en question (a ne pas diffuser stp) j espere que c est utile. La methode proposee dans le papier permet en tous cas d identifier les forces et faiblesses d une parametrisation. c est un peu l approche que tu as eu en identifiant les echelles auxquelles ca marche bien et celle ou c est moins satisfaisant. pragmatiquement si ca marche bien pour les trucs qui t interessent le + c est cool. pour les autres tu devras etre reserve sur les conclusions. je te recommande Sterman 1984 (pj) pour une bonne definition de "acceptable". Bises Quoting Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas@ifremer.fr>:
je ne me rappelle pas quels étaient les ordres de grandeurs Sigrid? Youen? Benoit? Camille?... mais dans tous les cas, je ne suis pas sure que cela soit un indicateur très pertinent car si tu as un gros pics observés que tu ne reproduis pas tu vas gonfler ton % alors que tout le reste sera nikel, plus tu augmentent ton pas de temps, plus tu as de chance de gonfler ton % ..... steph
Bastien Preuss a écrit :
Oui j'ai déjà effectué la calibration de la manière que tu viens de décrire, et c'est en utilisant les meilleurs valeurs de q1 et q2 que j'obtiens ces écarts d'environs -15% sur la capture annuelle. Je me demandais juste si cela semblait correcte par rapport à ce qui est obtenu dans d'autres appli Isis.
Bastien
-----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 18:27 À : isis-fish-users@list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration
Question délicate... La Palisse te dirait il faut que l'écart soit minimal.... c'est le principe de l'optimisation on cherche ici un minimum. Donc conditionnellement à ton modèle, tu prends la valeur de q qui minimise tes écarts entre obs et simulées. Il est clair que si tu changes ton critere en cours de calibration tu fausses l'algorithme. Il faudrait dans ce cas utiliser un algorithme d'optimisation multi-criteres, mais j'imagine que tu n'as pas le temps d'explorer cette piste. Donc pragmatiquement, il faut 1/ choisir une variable de sortie Y et critere Somme des ecarts au carré entre Yobs et Ysimulé, chercher la valeur de q qui minimise cet écart 2/ si plusieurs valeurs possibles, identifier d'autres Y (Y' et Y") de sortie d'ISIS pour lesquelles tu as des observations et confronter à nouveau tes Y'simu et Y"simu à Y'obs et Y"obs. Tu peux alors sélectionner la valeur de q qui te semble la plus satisfaisante. Pour plus de ref, Sigrid a un papier en cours de révision. Elle peut peut-etre te le transmettre??? bon courage stephanie
Bastien Preuss a écrit :
Bonjour,
Une petite questions pour ceux qui ont du recul sur leur(s) application(s) Isis.
Je me demande quel écart entre captures observées et captures simulées est acceptable après calibration de la capturabilité.
Dans mon cas, ma captures totale annuelle est de +15% par rapport à ma capture observée qui me sert de référence. Bien sur, lorsque que je regarde à un niveau plus fin, par exemple les captures par mois, par stratégie, etc. cet écart varie, généralement entre +-1% et +-97%.
Merci.
Bastien
Bastien Preuss
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-- Sigrid Lehuta Post-doctorante, Institut de Recherche du Golfe du Maine, USA contact : + 1-207-228-1695 / slehuta@ifremer.fr / slehuta@gmri.org http://www.gmri.org/people/bio.asp?ID=344 Membre de l'Association Française d'Halieutique http://halieutique.agrocampus-ouest.fr/afh/index.html
participants (3)
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Bastien Preuss -
Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr -
Stephanie MAHEVAS