February 2026 - Cantharella-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Re: [Cantharella-devel] Disque plein VMPHARMADEV-PROTO
by Andrés Maldonado 18 Feb '26

18 Feb '26

Bonjour Laurence, En effet je suis intervenu, j'ai retiré une sauvegarde en trop et j'ai modifié la commande pour retirer les anciennes sauvegardes sur toutes les machines. Avant, l'option -mtime était utilisée, mais cette option ne prend pas en compte les fractions de jours. Par exemple, pour correspondre à -mtime +3, un fichier doit avoir été modifié il y a au moins 4 jours. On gardait donc plus de sauvegardes que souhaité, jusqu'à 5 dans de rares cas comme celui qui s'est produit hier. Maintenant c'est l'option -mmin qui est utilisée, on ne devrait plus avoir de sauvegardes en trop à partir de demain. Bien cordialement, Andrés Maldonado Code Lutin On 18/02/2026 12:44, laurence.tronc(a)ird.fr wrote: > > Bonjour, > > Notre hébergeur nous a alerté sur un disque plein hier : > > /"une alerte disque est remontée hier soir à 22h25 concernant le > serveur VMPHARMADEV-PROTO. > LV_BACKUPS - Il semblerait que la stratégie de rétention défini dans > le script ne se soit pas appliquée."/ > > > > > Je vois que le disque est maintenant revenu en dessous du seuil > d'alerte, peut-être avez-vous pu intervenir ? > > [ird-ltronc@VMPHARMADEV-PROTO ~]$ sudo df -Th | grep BACKUP > /dev/mapper/VG_DATA-LV_BACKUPS ext4 7.8G 5.3G 2.1G 72% > /backups > > Bien cordialement, > > > -- Laurence Tronc Ingénieur système en appui aux outils scientifiques > Direction pour le Développement des Usages Numériques Innovants IRD - > Institut de Recherche pour le Développement +33 4 34 11 44 45 >

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Re: [Cantharella-devel] URGENT/IMPORTANT : Vulnérabilité sur votre VM -SSL- ?
by Andrés Maldonado 05 Feb '26

05 Feb '26

Bonjour Laurence, Merci pour l'alerte, je viens de vérifier nos images et nous avons en effet la vulnérabilité sur notre image registry.nuiton.org/ird/cantharella:1.5.6. Je viens de faire une nouvelle image 1.5.7 qui met à jour les paquets Ubuntu. Cette image contient le paquet openssl 3.0.13-0ubuntu3.7, qui corrige la CVE-2025-15467: https://changelogs.ubuntu.com/changelogs/pool/main/o/openssl/openssl_3.0.13… L'image postgres:15-alpine n'est pas concernée, elle utilise les librairies openssl les plus récentes de la branche 3.5, qui contiennent les patchs pour la CVE-2025-15467: libcrypto3-3.5.5-r0 x86_64 {openssl} (Apache-2.0) [installed] libssl3-3.5.5-r0 x86_64 {openssl} (Apache-2.0) [installed] Je déploie de suite la nouvelle image registry.nuiton.org/ird/cantharella:1.5.7. Bonne journée Andrés Maldonado Code Lutin On 05/02/2026 12:11, laurence.tronc(a)ird.fr wrote: > > Bonjour, > > *_Vous avez une (ou plusieurs) VM hébergées via la DDUNI._* > Une *_vulnérabilité importante _*a été publiée : > > * *_Vous utilisez Docker : pouvez-vous vérifier au plus vite si vos > images sont concernées, et les mettre à jour le cas échéant ?_* > * (Concernant l'OS des VM elles-mêmes, notre hébergeur a déjà patché > en urgence les VM concernées). > > _*PHIM :*_ > > Docker_detected *_vmbiologrist_* gristHome|gristlabs/grist:1.7.4, > gristDocWorker3|gristlabs/grist:1.7.4, > gristDocWorker2|gristlabs/grist:1.7.4, > gristDocWorker1|gristlabs/grist:1.7.4, redis|redis:8.0.3, > dex|dexidp/dex:v2.43.1, postgresGrist|postgres:16, > n8n|docker.n8n.io/n8nio/n8n:1.95.3, postgres|postgres:16 > Docker_detected *_vmpanexplorer2_* dash-docker|dash-docker/app > > *_LEMAR :_* > > Docker_detected *_vmcantharella-lemar_* > cantharella-web|registry.nuiton.org/ird/cantharella:1.5.6, > cantharella-db|postgres:15-alpine > Docker_detected *_vmcantharella-trial_* > cantharella-web|registry.nuiton.org/ird/cantharella:1.5.6, > cantharella-db|postgres:15-alpine > Docker_detected *_vmpharmadev-proto_* > cantharella-web|registry.nuiton.org/ird/cantharella:1.5.6, > cantharella-db|postgres:15-alpine > > *_DIADE :_* > > Docker_detected *_vmceres_* > rice-pilaf|ghcr.io/bioinfodlsu/rice-pilaf/app:latest > > *_EGCE :_* > > Docker_detected *_vmentomo_* node-red|node-red-extra, grafana|grafana, > mosquitto|mosquitto, influxdb|influxdb > > *_AMAP :_* > > Docker_detected *_vmherbiergf1f-proto_* specify7-nginx-1|nginx, > specify7-specify7-sandbox-1|specifyconsortium/specify7-service:v7.11, > specify7-specify7-1|specifyconsortium/specify7-service:v7.11, > specify7-redis-1|redis:6.0, > specify7-report-runner-1|specifyconsortium/report-runner, > specify7-specify7-sandbox-worker-1|specifyconsortium/specify7-service:v7.11, > specify7-specify7-worker-1|specifyconsortium/specify7-service:v7.11 > Docker_detected *_vmherbiergf2f-proto_* canobs-web-1|canobs-web, > cafriplot-web-1|cafriplot-web, > assets-asset-server-1|specifyconsortium/specify-asset-service, > assets-assets-1|nginx:alpine, static-collections-1|nginx:alpine, > dokuwiki-wiki-1|dokuwiki/dokuwiki:stable, traefik-lb-1|traefik:v3 > > *_MARBEC :_* > > Docker_detected *_vmot2_* vms-ws-nginx-1|nginx:latest, > vms-ws-vms-ws-1|registry.forge.ird.fr/marbec/ob7/vms/vms-ws-server:latest > Docker_detected *_vmot8_* > loop-app-1|git.dzeio.com/aptatio/ifremer-loop:latest, > akador|crccheck/hello-world > > > > CVE-2025-15467 : > https://openssl-library.org/news/vulnerabilities/index.html#CVE-2025-15467 > > En vous remerciant par avance, > Bien cordialement, > > -- > Laurence Tronc > Ingénieur système en appui aux outils scientifiques > Direction pour le Développement des Usages Numériques Innovants > IRD - Institut de Recherche pour le Développement > +33 4 34 11 44 45

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[Cantharella-LEMAR] Erreur interne à l'import de spécimen
by Sylvain PETEK 05 Feb '26

05 Feb '26

Bonjour Andrés et Jean, Merci beaucoup à tous les deux!! Bonne journée, Sylvain -----Message d'origine----- De : Cantharella-devel <cantharella-devel-bounces(a)list.forge.codelutin.com> De la part de Andrés Maldonado Envoyé : mercredi 4 février 2026 14:04 À : cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com Objet : [SPAM] Re: [Cantharella-devel] Re: [Cantharella-LEMAR] Erreur interne à l'import de spécimen Bonjour Sylvain, Jean a corrigé le problème d'imports, et j'ai déployé la nouvelle version sur toutes les instances. L'import devrait fonctionner à présent même si les références ne sont pas en majuscules. Bonne journée, Andrés Maldonado Code Lutin On 03/02/2026 17:23, Sylvain PETEK wrote: > Bonjour Jean, > > Je viens de réessayer avec les références en majuscule et ça fonctionne!! Merci bcp! > > Pour le lieu de dépôt, il m'a bien signalé la longueur trop importante. > > Bonne fin de journée, > > Sylvain > > > -----Message d'origine----- > De : Cantharella-devel > <cantharella-devel-bounces(a)list.forge.codelutin.com> De la part de > Jean Couteau Viney Envoyé : mardi 3 février 2026 15:20 À : > cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com > Objet : [SPAM] Re: [Cantharella-devel] [Cantharella-LEMAR] Erreur > interne à l'import de spécimen > > Bonjour Sylvain, > > peux-tu réessayer avec les références en majuscules ? Si cela fonctionne, nous pourrons faire un correctif pour que le soucis ne se reproduise plus. > > Jean > > PS : Je peux déjà te dire que le lieu de dépôt est en erreur pour quasi toutes les lignes car il fait plus de 60 caractères. > > Le Mon, 2 Feb 2026 16:27:58 +0100, > "Sylvain PETEK " <sylvain.petek(a)ird.fr> a écrit : > >> Bonjour, >> >> >> >> J’ai voulu importer des spécimens (fichier ci-joint), ce qui m’a >> généré une erreur interne. >> >> >> >> A voir d’où ça pourrait venir. >> >> >> >> Merci d’avance, >> >> >> Sylvain >> > _______________________________________________ > Cantharella-devel mailing list > Cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com > https://list.forge.codelutin.com/cgi-bin/mailman/listinfo/cantharella- > devel > > > > > _______________________________________________ > Cantharella-devel mailing list > Cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com > https://list.forge.codelutin.com/cgi-bin/mailman/listinfo/cantharella- > devel _______________________________________________ Cantharella-devel mailing list Cantharella-devel(a)list.forge.codelutin.com https://list.forge.codelutin.com/cgi-bin/mailman/listinfo/cantharella-devel

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[Cantharella-LEMAR] Erreur interne à l'import de spécimen
by Sylvain PETEK 04 Feb '26

04 Feb '26

Bonjour, J’ai voulu importer des spécimens (fichier ci-joint), ce qui m’a généré une erreur interne. A voir d’où ça pourrait venir. Merci d’avance, Sylvain

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