July 2008 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

warn : "addActiveRule not implemented"
by Sigrid LEHUTA July 10, 2008

July 10, 2008

suite de mon precedant mail... En plus de ces regles qui marchent pas j ai ce message d erreur des que la condition pour la regle de gestion est vraie warn : "addActiveRule not implemented" ce qui n empeche pas les règles de s appliquer (du moins celles qui fonctionnent ;-) : ex sur la base anchois la règle "tac francais" modifiee de tac poids) du coup c est peut etre pas grave mais ca fait pas joli dans les logs... je le poste aussi en bug. sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 65

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[Isis-fish-user]Regles de gestion TACPoids et Gravity model ne marchent pas
by Sigrid LEHUTA July 10, 2008

July 10, 2008

Salut Paul, merci pour la base. plusieurs choses : - Gravity model j avoue je ne l ai jamais utilisé mais je ne crois pas me tromper en te disant que l effort total de la strategie ne changera pas, c est l allocation de l effort sur different metiers qui est modifiée (voir l equation dans le manuel de la version 2 p95) Cependant il semble qu il n y ait en effet aucun changement lorsqu on utilise gravity model... soit ta strategie est deja optimale (!!!!!) soit ca marche pas... au hasard je dirais l option 2 ! mais pourquoi ??? j essaie de regarder... - TAC tu as tester la regle TACPoids cette regle bug aussi mais on a des pistes : un vieux pb (aimed metier) et un nouveau ligne 284 "null pointer exeption" je vois pas ce qui se passe ... est ce que c est urgent ? car j ai des scripts de TAC moins generiques mais qui marchent si l espece visee par le tac est une espece principale de tous les metiers, c est a dire si tous les metiers cessent de la pecher qd le tac est atteint et reportent leur effort sur d autres metiers qui n attrapent pas cette espece (ni en principale ni en accessoire) (dans la regle actuelle les metiers pour lesquels l espece est accessoire continuent de pecher qd le tac est atteint et rejette l espece s ils l attrapent, c est cette partie la qui bug) desolee :'( Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : > Cette fois avec le répertoire attaché (qui contient aussi le fichier > error.txt) > > pmarchal(a)ifremer.fr a écrit : > >> Salut Sigrid, >> >> Ca marche (du moins j'ai maintenant des valeurs non nulles pour F et >> les captures. Merci, tu me fais gagner un temps très précieux! Mon >> problème maintenant, c'est que mon effort est invariant (d'une année >> à l'autre), ce qui provient vraisemblablement du fait qu'il n'y pas >> de règle dynamique de calcul de l'effort. J'avais sélectionné le >> Gravity Model pour voir, mais cela ne change rien. >> >> L'étape suivante est donc de paramétrer les règles de gestion et >> peut-être aussi (?) le modèle de gravité, mais je n'ai rien trouvé >> dans la doc disponible sur >> http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/index.html >> Peux tu m'indiquer où chercher? >> >> Encore merci pour tout >> >> Paul >> >> PS. Je te joins ma BD actuelle. Pour les valeurs initiales, je prends >> 10^7 pour toutes les spp et tous les ages pour le moment. >> >> Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> a écrit : >> >>> Salut Paul, >>> de rien pour le coup de main c est a ca que sert la liste (d >>> ailleurs je la remet en copie car d autres que toi aurons le pb et >>> je le mettrai aussi dans la FAQ du wiki). >>> >>> pour ton pb de captures, effort et F je crois savoir d ou ca vient >>> dans set of vessel, onglet "input effort description" >>> tu mets tous les metiers pratiques par la flotte en question et il >>> faut ensuite les decrire : pour ca tu clic sur chaque metier et tu >>> remplis les cases a droite (operation de peche, duree de la peche, >>> nombre d engins) >>> il se trouve que la valeur par defaut, zéro (d ailleurs c est pas >>> malin...), multiplie l effort ! donc si tu le change pas effort = F >>> = 0 !!! >>> donc si tu en sais qqch tu peux remplir, sinon il faut mettre 1 ca >>> rend le parametre transparent. >>> >>> les autres cases n entrent que dans le calcul des couts donc pas >>> besoin de les remplir si tu n as pas d economie dans le modele >>> >>> dis moi si ca marche >>> peux tu m envoyer ta nouvelle base ainsi qu une simulation pour que >>> j ai les corrections et les effectifs initiaux que tu utilises s il >>> te plait >>> merci >>> a+ >>> >>> >>> Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : >>>> Merci beaucoup Sigrid pour ton aide spontanée. Je suis quand même >>>> obligé de garder 2 métiers car ils ont chacun une sélectivité >>>> différente (même si c'est le même engin, cela provient du modèle >>>> utilisé pour l'évaluation du hoki). >>>> >>>> Du coup, j'ai étendu la saison des métiers concernés sur l'ensemble >>>> de l'année, et j'ai recréé la saisonalité dans les stratégies. En >>>> faisant cela, le programme ne plante plus, il me sort des biomasses >>>> à peu près réalistes, mais le F et donc les captures affichent avec >>>> insistance un gros 0. >>>> >>>> Aurais tu une suggestion? >>>> >>>> Kia Ora >>>> >>>> Paul >>>> Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> a écrit : >>>> >>>>> le meme mail avec un sujet (plus pratique pour ranger) >>>>> >>>>> >>>>> Sigrid LEHUTA a écrit : >>>>>> Salut Paul, >>>>>> Je ne sais pas si qqn t as repondu >>>>>> je crois avoir trouvé l erreur (mais j ai eu la flemme de corriger >>>>>> pour etre sure... desolee :-( ) >>>>>> il s agit toujours des metiers-mois non renseignés : en fait tu as >>>>>> rajouté les saisons manquantes comme des nouveaux metiers, alors >>>>>> qu il >>>>>> faut les ajouter au metier existant. Je m explique : >>>>>> en ce moment tu as par exemple 2 metiers "Cstr03" l'un Ensp d >>>>>> octobre >>>>>> a mai, l autre Esp de juin a septembre >>>>>> tu ne devrais avoir qu un unique metier "Csrt03" avec 2 saisons >>>>>> "octobre-mai" et "juin-septembre" et les target factor qui vont avec >>>>>> pour chaque saison >>>>>> >>>>>> pour le faire : >>>>>> choisis lequel des 2 metiers redondants tu gardes (mettons Ensp) >>>>>> *-dans l onglet Seasons/Zones de ce metier clique sur "nouveau" et >>>>>> deplace la zone jaune pour creer la saison juin a septembre, >>>>>> -selectionne la zone de pêche >>>>>> -SAUVER. >>>>>> c est fait tu as maintenant 2 saisons dans la liste deroulante de ce >>>>>> metier (qui se completent pour former une année). >>>>>> * Il te reste a completer les target factors, -dans l onglet >>>>>> especes >>>>>> capturables, >>>>>> -tu selectionnes la saison juin a septembre dans la liste deroulante >>>>>> - et tu crees l equation du facteur cible de cette saison >>>>>> * tu peux maintenant effacer Cstr03Esp ! >>>>>> >>>>>> ya pu ka faire pareil avec les autres metiers redondants >>>>>> bon courage ! >>>>>> tiens moi au courant si ca marche... ou pas ! je vais me promener >>>>>> dans >>>>>> ta base en attendant pour voir si t as pas fait d autres bêtises ;-P >>>>>> >>>>>> Sigrid >>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> >>>>>> Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : >>>>>>> Bonjour Benjamin, >>>>>>> >>>>>>> Merci, on avance pas à pas... >>>>>>> >>>>>>> Cette fois, j'ai pu lancer une simulation mais elle plante >>>>>>> probablement en raison d'un pb de saisie des inputs de la pêcherie >>>>>>> (j'ai essayé en prenant chacun de mes 3 stocks un à un, même >>>>>>> résultat). >>>>>>> >>>>>>> J'ai rajouté un port et vérifié qu'il y avait bien correspondance >>>>>>> entre zones de repro et zones de recrutement pour les 3 stocks que >>>>>>> j'ai conservés. >>>>>>> >>>>>>> Je t'envoie ma base de données et mon fichier d'erreur. Ci-dessous, >>>>>>> je te mets le fichier log de la simulation: >>>>>>> >>>>>>> " >>>>>>> INFO|11:33:34,514|SimulationHelper.java|402|localSimulateSameThread|6/24/08 >>>>>>> 11:33 AM Java version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: 3.1.3 >>>>>>> INFO|11:33:34,530|SimulationHelper.java|270|changeClassLoader|Classloader >>>>>>> used for simulation: >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader@d85f3c >>>>>>> [file:/C:/Documents%20and%20Settings/MarchalP.FISHREG/isis-database-3/simulations/%202008-06-24-11-00%202008-06-24-11-33/] >>>>>>> INFO|11:33:34,561|SimulationStorage.java|106|setParameter|DEBUG: >>>>>>> store param: {libLogLevel=error, preScript=, usePreScript=false, >>>>>>> inQueue=false, onlyExport=false, numberOfYear=1, >>>>>>> scriptLogLevel=info, >>>>>>> simulLogLevel=info, rules=GraviteCPUE,, useOptimization=true, >>>>>>> useStatistic=false, exportDirectory=C:\Documents and >>>>>>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-export, useAnalysePlan=false, >>>>>>> isisFishVersion=3.1.3, population.HokiEast.number=[[1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7]], >>>>>>> regionName=NZHOKI, local=true, populations=HokiEast, >>>>>>> description=First try using the eastern hoki stock only, >>>>>>> analysePlan=, plans=, simulatorName=DefaultSimulator.java, >>>>>>> strategies=FirstTry, analysePlanNumber=-1, exports=, >>>>>>> resultNames=matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixFuelCostsPerVessel,matrixBiomass,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixEffortPerStrategyMet,matrixCatchRatePerStrategyMet,matrixPrice,matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixFuelCostsOfTravelPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixFishingMortality,matrixEffortPerZonePop,matrixCrewSharePerStrategyPerVessel,matrixLandingPerMet,matrixDiscardsPerStrMet,matrixDiscardsWeightPerStrMet,matrixNoActivity,matrixCostsOfFishingPerVessel,matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet,matrixCatchPerStrategyMet,matrixFishingTimePerMonthPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixStdTravelEffortPerStrategyMet,matrixCatchWeightPerStrategyMet,matrixMetierZone,matrixSharedNotFixedCostsPerVessel,matrixAbundance,matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixOtherRunningCostsPerVessel,} >>>>>>> INFO|11:33:34,921|SimulationHelper.java|90|message|Mise en place >>>>>>> des >>>>>>> aspects Cache >>>>>>> INFO|11:33:34,921|SimulationControl.java|126|setText|Mise en place >>>>>>> des aspects Cache >>>>>>> INFO|11:33:35,046|DataStorage.java|164|getMemStorage|Create new >>>>>>> memory storage for 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33 >>>>>>> INFO|11:33:35,483|SimulationHelper.java|90|message|Simulation >>>>>>> execution >>>>>>> INFO|11:33:35,483|SimulationControl.java|126|setText|Simulation >>>>>>> execution >>>>>>> INFO|11:33:35,483|SimulationContext.java|291|message|Exécution des >>>>>>> scripts de Presimulation >>>>>>> INFO|11:33:35,483|SimulationControl.java|126|setText|Exécution des >>>>>>> scripts de Presimulation >>>>>>> INFO|11:33:35,983|SimulationControl.java|126|setText|Rules >>>>>>> initialisation:[rules.GraviteCPUE@ba5bfd] >>>>>>> INFO|11:33:36,061|DefaultSimulator.java|114|simulate|Rule >>>>>>> GraviteCPUE >>>>>>> initialized >>>>>>> INFO|11:33:36,061|SimulationControl.java|126|setText|begin step >>>>>>> janvier 0 >>>>>>> INFO|11:33:36,077|ResultManager.java|154|isEnabled|Enabled result: >>>>>>> [matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet, matrixFuelCostsPerVessel, >>>>>>> matrixBiomass, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>>>>>> matrixEffortPerStrategyMet, matrixCatchRatePerStrategyMet, >>>>>>> matrixPrice, matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixFuelCostsOfTravelPerVessel, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>>>>>> matrixFishingMortality, matrixEffortPerZonePop, >>>>>>> matrixCrewSharePerStrategyPerVessel, matrixLandingPerMet, >>>>>>> matrixDiscardsPerStrMet, matrixDiscardsWeightPerStrMet, >>>>>>> matrixNoActivity, matrixCostsOfFishingPerVessel, >>>>>>> matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet, >>>>>>> matrixCatchPerStrategyMet, matrixFishingTimePerMonthPerVessel, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>>>>>> matrixStdTravelEffortPerStrategyMet, >>>>>>> matrixCatchWeightPerStrategyMet, >>>>>>> matrixMetierZone, matrixSharedNotFixedCostsPerVessel, >>>>>>> matrixAbundance, matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixOtherRunningCostsPerVessel] >>>>>>> INFO|11:33:36,124|SimulationControl.java|126|setText|Evalute Rules >>>>>>> conditions (1 rules) >>>>>>> INFO|11:33:36,124|SimulationControl.java|126|setText|Do pre >>>>>>> action Rules >>>>>>> ERROR|11:33:36,140|SimulationHelper.java|505|localSimulateSameThread|Error >>>>>>> during simulation >>>>>>> java.lang.NullPointerException >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>>>>>> >>>>>>> Source) >>>>>>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>>>>>> at >>>>>>> simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>>>>>> INFO|11:33:36,218|SimulationHelper.java|574|localSimulateSameThread|Simulation >>>>>>> time: 1.702 >>>>>>> " >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> Sinon, y aurait il un debugger que je je puisse utiliser, cela >>>>>>> permettrait peut-être de gagner du temps? >>>>>>> >>>>>>> Merci pour ton aide >>>>>>> >>>>>>> Paul >>>>>>> >>>>>>>> Bonjour, >>>>>>>> >>>>>>>> Regarde si dans le repertoire isis-database/scripts tu as des >>>>>>>> fichiers >>>>>>>> si ce n'est pas le cas, il est normale que les simulations ne >>>>>>>> fonctionnent pas. >>>>>>>> >>>>>>>> Il semble (pour une raison inconnu pour l'instant :)) que tu ne te >>>>>>>> connecte pas bien au svn. Donc tu peux recuperer le zip: >>>>>>>> >>>>>>>> http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-database-… >>>>>>>> Et mettre le contenu en plus de ce que tu as deja dans ton >>>>>>>> isis-database. Ce zip contient les scripts de simulation, et donc >>>>>>>> forcement sans eux ca ne peut pas fonctionner :). >>>>>>>> >>>>>>>> Pour ce qui est de la validite de ta region, il me semble qu'il >>>>>>>> y avait >>>>>>>> encore de petites erreurs (pas de port, et pas de >>>>>>>> correspondance zone >>>>>>>> repro/recu pour une population). >>>>>>>> >>>>>>>> Mais sinon, oui, tu n'as pas besoin de regle de gestion, tu >>>>>>>> peux meme >>>>>>>> simuler sans strategie pour simuler seulement la dynamique d'une >>>>>>>> population si tu le souhaites. >>>>>>>> >>>>>>>> Bon courage, et ne craque pas, on est presque ou bout :) >>>>>>>> >>>>>>>> -- >>>>>>>> Benjamin >>>>>>>> -------------------- >>>>>>>> tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 >>>>>>>> email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii >>>>>>>> http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii >>>>>>>> >>>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> >>>>>>> ------------------------------------------------------------------------ >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:322) getClassPathURLsFromJarManifest - >>>>>>> class-path jar to scan >>>>>>> /C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS >>>>>>> Fish/isis-fish-3.1.3/lib/isis-fish-3.1.3.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\isis-fish-3.1.3.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xmlrpc-2.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-lang-2.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\asm-attrs-1.5.4-snapshot.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\openmap-4.6.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-collections-3.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\spring-beans-2.0.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\j2ssh-core-0.2.2.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\bsh-2.0b1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\junit-3.8.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\svnkit-1.1.2.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\ganymed-ssh2-build210.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\dom4j-1.6.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xml-apis-1.0.b2.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\lutincommandline-ui-0.4.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-logging-1.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\log4j-1.2.12.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\logkit-1.0.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\avalon-framework-4.1.3.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\servlet-api-2.3.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\jaxx-1.0.4-SNAPSHOT.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\lutinutil-0.29-SNAPSHOT.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-primitives-1.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-beanutils-1.7.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\javahelp-2.0.02.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\lutincommandline-0.4.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\spring-core-2.0.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\qdox-1.4.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\lutinmatrix-0.15.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - 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jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\ant-1.7.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\ant-launcher-1.7.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\jaxen-1.1.1.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\jdom-1.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xercesImpl-2.0.2.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search >>>>>>> C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS >>>>>>> Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xom-1.0.jar >>>>>>> INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - 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[] >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:109) main - 6/24/08 11:21 AM Java >>>>>>> version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: 3.1.3 >>>>>>> INFO [main] (Config.java:105) init - [main] >>>>>>> INFO [main] (Config.java:105) init - [vcs] >>>>>>> INFO [main] (SVNHelper.java:191) findTypeRepo - try svn url >>>>>>> svn://labs.libre-entreprise.org/svnroot/isis-fish-data/tags (3.1.3) >>>>>>> WARN [main] (SVNHelper.java:197) findTypeRepo - >>>>>>> org.codelutin.vcs.VCSException: >>>>>>> org.tmatesoft.svn.core.SVNException: >>>>>>> svn: Connection refused: connect >>>>>>> INFO [main] (I18nLoader.java:102) close - nb languages loaded : 1 >>>>>>> INFO [main] (Language.java:183) close - Language <locale: en_US, >>>>>>> encoding: ISO-8859-1,nbStences:1176> >>>>>>> INFO [main] (I18nBundleManager.java:167) load - Language <locale: >>>>>>> fr_FR, encoding: UTF-8,nbStences:1176>, nbEntries: 6, nbSentences: >>>>>>> 1176 in 29.409ms >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:182) init - connectionState : ERROR >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:182) init - hasPreviousConfig : true >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:182) init - isTypeChanged : false >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:182) init - needMigration : false >>>>>>> INFO [main] (MatrixFactory.java:68) <clinit> - Converter XML pour >>>>>>> MatrixND ajoute >>>>>>> INFO [main] (MatrixFactory.java:85) <clinit> - librairie topia non >>>>>>> presente. Import/Export JDBC impossible >>>>>>> INFO [main] (IsisVcsConfig.java:442) validate - [SVN] >>>>>>> configuration >>>>>>> is init. >>>>>>> INFO [main] (IsisVcsConfig.java:443) validate - [SVN] remote : >>>>>>> svnroot/isis-fish-data/trunk >>>>>>> INFO [main] (IsisVcsConfig.java:444) validate - [SVN] local : >>>>>>> C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 >>>>>>> INFO [main] (IsisVcsConfig.java:445) validate - [SVN] state : >>>>>>> ERROR >>>>>>> INFO [main] (SVNHandler.java:138) initWorkingCopy0 - repositoryURL >>>>>>> to use : >>>>>>> svn://labs.libre-entreprise.org/svnroot/isis-fish-data/trunk >>>>>>> INFO [main] (IsisFish.java:138) main - after init done in 5.323s. >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (SimulationManager.java:326) run - >>>>>>> Start simulation thread >>>>>>> INFO [Simulation Thread remote] (SimulationManager.java:326) run - >>>>>>> Start simulation thread >>>>>>> INFO [main] (IsisTray.java:96) getInstance - Use System tray: >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.IsisTray$AWTSystemTray >>>>>>> SwixML 1.5 (#144) >>>>>>> INFO [main] (Editor.java:124) addEditor - Can't find your editor >>>>>>> class: org.codelutin.widget.editor.NetBeansEditor >>>>>>> INFO [main] (Editor.java:124) addEditor - Can't find your editor >>>>>>> class: org.codelutin.widget.editor.JEditEditor >>>>>>> OpenMap(tm) Version 4.6 >>>>>>> Copyright (C) BBNT Solutions LLC. All rights reserved. >>>>>>> See http://openmap.bbn.com/ for details. >>>>>>> >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> INFO [Thread-3] (RegionStorage.java:207) getRegion - Try to open >>>>>>> region NZHOKI(C:\Documents and >>>>>>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3\regions\NZHOKI) >>>>>>> INFO [Thread-3] (DataStorage.java:211) getStorage - Create new >>>>>>> storage for NZHOKI >>>>>>> **** false *****0 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 7 >>>>>>> Set to 7 >>>>>>> Set to 7 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Set to 2 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Set to 21 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Set to 5 >>>>>>> Set to 5 >>>>>>> Set to 5 >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> Installing UI >>>>>>> Installing HIGHLIGHT >>>>>>> INFO [Thread-11] (SimulationStorage.java:224) getSimulation - >>>>>>> Try to >>>>>>> open simulation 2008-06-24-11-00(C:\Documents and >>>>>>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3\simulations\ >>>>>>> 2008-06-24-11-00) >>>>>>> **** false *****0 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationHelper.java:90) message - >>>>>>> backup >>>>>>> database in progress >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:126) setText - >>>>>>> backup database in progress >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationHelper.java:90) message - >>>>>>> backup >>>>>>> database finished >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:126) setText - >>>>>>> backup database finished >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationHelper.java:90) message - >>>>>>> Scripts >>>>>>> and rules Compilation >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationControl.java:126) setText - >>>>>>> Scripts and rules Compilation >>>>>>> Note: >>>>>>> C:\DOCUME~1\MARCHA~1.FIS\LOCALS~1\Temp\isisfish-simultation-1214264011061-preparation\scripts\SiMatrix.java >>>>>>> uses unchecked or unsafe operations. >>>>>>> Note: Recompile with -Xlint:unchecked for details. >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationHelper.java:90) message - Temps >>>>>>> de compilation 2.327s INFO [AWT-EventQueue-0] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Temps de compilation 2.327s >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (SimulationStorage.java:224) >>>>>>> getSimulation - Try to open simulation 2008-06-24-11-00 >>>>>>> 2008-06-24-11-33(C:\Documents and >>>>>>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3\simulations\ >>>>>>> 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33) >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (DataStorage.java:211) getStorage - >>>>>>> Create new storage for 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33 >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:402) localSimulateSameThread - 6/24/08 11:33 >>>>>>> AM Java version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: 3.1.3 >>>>>>> AspectWerkz - INFO - Pre-processor >>>>>>> org.codehaus.aspectwerkz.transform.AspectWerkzPreProcessor >>>>>>> loaded and >>>>>>> initialized >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:270) changeClassLoader - Classloader used >>>>>>> for >>>>>>> simulation: fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader@d85f3c >>>>>>> [file:/C:/Documents%20and%20Settings/MarchalP.FISHREG/isis-database-3/simulations/%202008-06-24-11-00%202008-06-24-11-33/] >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationStorage.java:106) setParameter - DEBUG: store param: >>>>>>> {libLogLevel=error, preScript=, usePreScript=false, inQueue=false, >>>>>>> onlyExport=false, numberOfYear=1, scriptLogLevel=info, >>>>>>> simulLogLevel=info, rules=GraviteCPUE,, useOptimization=true, >>>>>>> useStatistic=false, exportDirectory=C:\Documents and >>>>>>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-export, useAnalysePlan=false, >>>>>>> isisFishVersion=3.1.3, population.HokiEast.number=[[1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>>>>>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7]], >>>>>>> regionName=NZHOKI, local=true, populations=HokiEast, >>>>>>> description=First try using the eastern hoki stock only, >>>>>>> analysePlan=, plans=, simulatorName=DefaultSimulator.java, >>>>>>> strategies=FirstTry, analysePlanNumber=-1, exports=, >>>>>>> resultNames=matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixFuelCostsPerVessel,matrixBiomass,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixEffortPerStrategyMet,matrixCatchRatePerStrategyMet,matrixPrice,matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixFuelCostsOfTravelPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixFishingMortality,matrixEffortPerZonePop,matrixCrewSharePerStrategyPerVessel,matrixLandingPerMet,matrixDiscardsPerStrMet,matrixDiscardsWeightPerStrMet,matrixNoActivity,matrixCostsOfFishingPerVessel,matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet,matrixCatchPerStrategyMet,matrixFishingTimePerMonthPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixStdTravelEffortPerStrategyMet,matrixCatchWeightPerStrategyMet,matrixMetierZone,matrixSharedNotFixedCostsPerVessel,matrixAbundance,matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixOtherRunningCostsPerVessel,} >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:90) message - Mise en place des aspects >>>>>>> Cache >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Mise en place des aspects >>>>>>> Cache >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (DataStorage.java:164) getMemStorage - Create new memory storage >>>>>>> for >>>>>>> 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33 >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:90) message - Simulation execution >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Simulation execution >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationContext.java:291) message - Exécution des scripts de >>>>>>> Presimulation >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Exécution des scripts de >>>>>>> Presimulation >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Rules >>>>>>> initialisation:[rules.GraviteCPUE@ba5bfd] >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (DefaultSimulator.java:114) simulate - Rule GraviteCPUE initialized >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - begin step janvier 0 >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (ResultManager.java:154) isEnabled - Enabled result: >>>>>>> [matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet, matrixFuelCostsPerVessel, >>>>>>> matrixBiomass, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>>>>>> matrixEffortPerStrategyMet, matrixCatchRatePerStrategyMet, >>>>>>> matrixPrice, matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixFuelCostsOfTravelPerVessel, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>>>>>> matrixFishingMortality, matrixEffortPerZonePop, >>>>>>> matrixCrewSharePerStrategyPerVessel, matrixLandingPerMet, >>>>>>> matrixDiscardsPerStrMet, matrixDiscardsWeightPerStrMet, >>>>>>> matrixNoActivity, matrixCostsOfFishingPerVessel, >>>>>>> matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet, >>>>>>> matrixCatchPerStrategyMet, matrixFishingTimePerMonthPerVessel, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet, >>>>>>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>>>>>> matrixStdTravelEffortPerStrategyMet, >>>>>>> matrixCatchWeightPerStrategyMet, >>>>>>> matrixMetierZone, matrixSharedNotFixedCostsPerVessel, >>>>>>> matrixAbundance, matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>>>>>> matrixOtherRunningCostsPerVessel] >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Evalute Rules conditions (1 >>>>>>> rules) >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationControl.java:126) setText - Do pre action Rules >>>>>>> ERROR [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:505) localSimulateSameThread - Error during >>>>>>> simulation >>>>>>> java.lang.NullPointerException >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>>>>>> >>>>>>> Source) >>>>>>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>>>>>> at >>>>>>> simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>>>>>> INFO [SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33] >>>>>>> (SimulationHelper.java:574) localSimulateSameThread - Simulation >>>>>>> time: 1.702 >>>>>>> --- Cache Statistiques --- >>>>>>> Total call: 20 >>>>>>> Cache used: 9 >>>>>>> Cache usage: 45% >>>>>>> -------------------- >>>>>>> >>>>>>> Exception in thread "SimThread 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33" >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationException: Error during >>>>>>> simulation >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:507) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>>>>>> Caused by: java.lang.NullPointerException >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>>>>>> >>>>>>> Source) >>>>>>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>>>>>> at >>>>>>> simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>>>>>> ... 1 more >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (SimulationDoneQueueModel.java:92) >>>>>>> simulationWillBeRemoved - in done model for 2008-06-24-11-00 >>>>>>> 2008-06-24-11-33 pos 0 >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (SimulationDoneQueueModel.java:95) >>>>>>> simulationWillBeRemoved - isStopSimulationRequest : false >>>>>>> ERROR [Simulation Thread local] (SimulationDoneQueueModel.java:118) >>>>>>> simulationWillBeRemoved - error while simulation >>>>>>> java.lang.NullPointerException >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>>>>>> >>>>>>> Source) >>>>>>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>>>>>> at >>>>>>> simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>>>>>> INFO [Simulation Thread local] (SimulationControl.java:126) setText >>>>>>> - stop with error java.lang.NullPointerException >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>>>>>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>>>>>> Source) >>>>>>> at >>>>>>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>>>>>> >>>>>>> Source) >>>>>>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>>>>>> at >>>>>>> simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>>>>>> at >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:100) <init> - >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsoleHandler@112a5d >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:393) >>>>>>> getLevelReader >>>>>>> - (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, >>>>>>> nbLines:29)) >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:122) start - with >>>>>>> reader (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, >>>>>>> nbLines:29)) in 32 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:106) newConsole - handler >>>>>>> start in 32 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsole.java:157) <init> - >>>>>>> fr.ifremer.isisfish.logging.console.LogConsole[$JFrame0,0,0,574x576,invalid,hidden,layout=java.awt.BorderLayout,title=Console >>>>>>> de log simulation ' 2008-06-24-11-00 >>>>>>> 2008-06-24-11-33',resizable,normal,defaultCloseOperation=DISPOSE_ON_CLOSE,rootPane=javax.swing.JRootPane[,4,36,566x536,invalid,layout=javax.swing.JRootPane$RootLayout,alignmentX=0.0,alignmentY=0.0,border=,flags=16777673,maximumSize=,minimumSize=,preferredSize=],rootPaneCheckingEnabled=true] >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 30 --> 25 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (SimulationLoggerUtil.java:180) >>>>>>> showSimulationLogConsole - affichage de la console de log pour la >>>>>>> simulation 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 25 --> 51 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 51 --> 49 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 49 --> 47 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 47 --> 40 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 40 --> 38 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - change newLinesInEditor : 38 --> 43 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LogConsoleHandler.java:257) >>>>>>> propertyChange >>>>>>> - 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change newLinesInEditor : 67 --> 66 >>>>>>> INFO [AWT-EventQueue-0] (LineReader.java:104) close - >>>>>>> (levels:[])(file:simulation.log (offsetfile:offsets_0, nbLines:29)) >>>>>>> >>>>>>> ------------------------------------------------------------------------ >>>>>>> _______________________________________________ >>>>>>> Isis-fish-user mailing list >>>>>>> Isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org >>>>>>> http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-user >>>>>>> >>>>>> >>>>> >>>>> -- >>>>> Sigrid LEHUTA >>>>> ~ ><> ~ >>>>> >>>>> Doctorante >>>>> Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique >>>>> IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 >>>>> 44311 Nantes Cedex 03 >>>>> Tél : +33 (0)2 40 37 81 65 >>>>> >>>>> >>>>> _______________________________________________ >>>>> Isis-fish-user mailing list >>>>> Isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org >>>>> http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-user >>>>> >>>>> >>>>> >>>> >>>> >>>> >>>> >>>> >>> >>> -- >>> Sigrid LEHUTA >>> ~ ><> ~ >>> Doctorante >>> Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique >>> IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 >>> Tél : +33 (0)2 40 37 81 65 >>> >>> >>> >>> >> >> >> >> > > > ------------------------------------------------------------------------ > > _______________________________________________ > Isis-fish-user mailing list > Isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org > http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-user -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 65

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passage du projet IsisFish sous Svn
by Tony Chemit July 9, 2008

July 9, 2008

Salut Manu, Serait-il possible que tu nous passes le projet IsisFish (id de projet labs = 8 ) sous svn ? Si tu peux le faire rapidement cela nous arrangerait bien :) Merci. Tony.

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Base de Paul : non prise en compte des effectifs initiaux
by Sigrid LEHUTA July 9, 2008

July 9, 2008

maintenant a moi de bugger ;-) Benjamin !!!!! SOS !! quand je fais tourner des simus sur la base de paul je rentres les effectifs initiaux bidons 10000 poissons / classe/ zone /espece et je me retrouve avec 0 biomasse !!! (alors qu avec ma base ca marche !!!) Paul n a apparement pas ce pb tant mieux ! t as une idee ? merci a++ -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 81 65

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Suite à ton appel
by Tony Chemit July 8, 2008

July 8, 2008

Salut Ben, Je n'ai pas pu te répondre hier, j'étais déconnecté... Je viens de retester le code et on rentre bien dans le code d'implantation de la classe fr.ifremer.isisfish.commandline.actions.IsisOptionActionSimulate :) Je ne vois pas pourquoi cela ne fonctionne pas chez toi. Lors du parsing des options de la ligne de commande, cela est très silencieux (peut-être un peu trop ?) il faut bien veiller à trouver ces 3 lignes : (OptionParserContexts.java:195) detectOptions - (pos 0) --simulate [One, /tmp/yo] INFO [main] (OptionParserContexts.java:586) detectArgumentDefinition - One : simulationId:STRING INFO [main] (OptionParserContexts.java:586) detectArgumentDefinition - /tmp/yo : simulationParameter:FILE Si c'est le cas, alors on rentre bien dans l'action voulu. A noter que le deuxième paramètre est de type FILE (il doit donc exister pour être pris en compte). Désolé de ne pas avoir pu te répondre hier. Tony.

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Question Caparmor pour le lancement de nombreuses simulations
by Benjamin POUSSIN July 7, 2008

July 7, 2008

Bonjour Tina, J'ai une petite question, que preferes-tu ? Ou plutot quelle est la meilleur chose pour Caparmor. J'ai 1000 simulations a faire, il vaut mieux: - ajouter dans les travaux de caparmor 1000 simulations prenant 1 CPU a chaque fois - ajouter dans les travaux de caparmor une seule tache qui va prendre 20, 40 ou 60 processeurs le temps qu'il faut pour faire les 1000 simulations ? Pour le 1er cas, je m'appuie entierement sur l'ordonnanceur de caparmor. Dans le 2eme j'ai un peu plus de travail, donc avant de faire des choses inutiles je prefere demander ce qui est le mieux. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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