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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish March 31, 2012

March 31, 2012

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Etat des développements sur IsisFish (Habitat et distribution)
by Eric Chatellier March 20, 2012

March 20, 2012

Bonjour, Voici la liste des développements en cours sur isis. Version 4.1 ----------- Isis fish habitat : en attente du retour de Stéphanie http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/versions/105 Version 4.0.1 ------------- Distribution dans les AS. Gestion de la distribution dans les interfaces graphiques OK. A faire : jean et moi pour gerer les distribution dans les scripts d'AS A faire: tester XSA sur caparmor (fin de semaine ou semaine prochaine) http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/versions/104 Version 4.0.0.3 --------------- Corrections diverses suite aux test de loic. En attente de release par Codelutin. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Questions sur le code des exports d'ISIS
by Loic GASCHE March 15, 2012

March 15, 2012

Bonjour, Je crois que je commence à saisir le fonctionnement et les interactions entre les divers scripts d'ISIS, mais même en utilisant le modèle de données, la liste des APIs ISIS et Java, il y a des morceaux de code que je ne comprends pas (pour le moment j'ai surtout regardé les exports en détails, alors ça concerne un export). Comme le code dans un mail c'est moche j'ai mis mes questions en commentaires dans script d'export et j'ai mis ce dernier en PJ... S'il y a une meilleure solution je suis preneur. Loïc

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Bug dans la copie des simulations depuis caparmor ?
by Loic GASCHE March 6, 2012

March 6, 2012

Bonjour, J'ai reçu le mail suivant, qui fait état d'un soucis dans le déroulement d'une simulation dans caparmor. A première vue tout continue à tourner comme il faut, mais est-ce que cette erreur pourrait me causer un problème, au moment de faire l'analyse de sensibilité par exemple ? La simulation 991 n'a pas encore été récupérée par ISIS alors je ne peux pas savoir si elle a tourné comme il faut pour le moment. Loïc -------- Message original -------- Sujet: PBS JOB 3001498[991].service0.ice.ifremer.fr Date : Mon, 5 Mar 2012 12:40:05 +0000 (GMT) De : adm(a)ifremer.fr (root) Pour : lgasche(a)ifremer.fr PBS Job Id: 3001498[991].service0.ice.ifremer.fr Job Name: simulation-as_t Post job file processing error; job 3001498[991].service0.ice.ifremer.fr on host r5i0n14.ice.ifremer.fr Unable to copy file /var/spool/PBS/spool/3001498[991].service0.ice.ifremer.fr.OU to service4.ice.ifremer.fr:/home1/caparmor/lgasche/simulation-as_t.o3001498.991 >>> error from copy service4.ice.ifremer.fr: Connection refused 4.ice.ifremer.fr, user lgasche, command scp -v -r -p -t /home1/caparmor/lgasche/simulation-as_t.o3001498.991 OpenSSH_5.1p1, OpenSSL 0.9.8h 28 May 2008 debug1: Reading configuration data /etc/ssh/ssh_config debug1: Applying options for * debug1: Connecting to service4.ice.ifremer.fr [10.150.0.197] port 22. debug1: Connection established. debug1: identity file /home1/caparmor/lgasche/.ssh/id_rsa type 1 debug1: identity file /home1/caparmor/lgasche/.ssh/id_dsa type 2 ssh_exchange_identification: Connection closed by remote host lost connection >>> end error output Output retained on that host in: /var/spool/PBS/undelivered/3001498[991].service0.ice.ifremer.fr.OU

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Re: [Isis-fish-devel] [Isis-fish-commits] r3623 - in branches/4.1/src: main/java/fr/ifremer/isisfish/equation main/java/fr/ifremer/isisfish/util test/java/fr/ifremer/isisfish/util
by Eric Chatellier March 2, 2012

March 2, 2012

Le 02/03/2012 10:51, echatellier(a)users.forge.codelutin.com a écrit : > Author: echatellier > Date: 2012-03-02 10:51:52 +0100 (Fri, 02 Mar 2012) > New Revision: 3623 > > Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish/3623 > > Log: > #841 : Utilisation de paranamer au lieu de l'annotation @Args > Juste des tests (ca ne fonctionne pas avec paranamer) J'ai essayé d'utiliser paranamer pour supprimer les annotations @Args mais cela fonctionne seulement pour les classes, pas les interfaces (pour le bytecode). -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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ISIS est particulièrement lent pour récupérer les simulations depuis CAPARMOR
by Loic GASCHE March 2, 2012

March 2, 2012

Bonjour, Voulant essayer la nouvelle version 4.0.0.3 incorporant les modification d'Eric, j'ai lancé deux AS identiques aux précédentes sur caparmor hier soir. Apparemment il y a eu un problème de connexion cette nuit pendant qu'ISIS récupérait les simulations et ce processus semblait arrêté ce matin. J'ai donc relancé ISIS et la récupération des simulations depuis caparmor a repris, mais elle sont d'une lenteur effroyable : ISIS m'indique avoir récupéré 6 simus au cours de la dernière heure... et ça correspond bien à la création de mes dernières simulations dans isis-database. Par dessus le marché on dirait que j'ai également eu un plantage de Java, si j'en crois le message d'erreur qui est apparu dans le dossier "sensitivityresults" de isis-database (en PJ). Voilà, en gros je m'interroge sur la cause possible de cette lenteur. Dans la queue de lancement des simus j'ai une simu affichée commme terminée avec le message "Recherche de la dernière simulation", et rien pour les autres. Est-ce que le fait d'avoir lancé deux AS peut créer un cafouillage au moment de récupérer les simulations et causer ce ralentissement ? Est-ce qu' arrêter les simulations qui sont dans la queue de simulation et à les relancer pourrait relancer la récupération de ces dernières ? Loïc

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish March 1, 2012

March 1, 2012

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Caparmor n'aime pas les accents ?
by Loic GASCHE Feb. 28, 2012

Feb. 28, 2012

Bonjour, En voulant relancer mon AS d'hier sur caparmor, j'ai trouvé que les noms de certaines variables de mon AS avaient été modifiés. Ca porte sur les TargetFactors, et manifestement ça vient de la présence d'accents. Par exemple, Beaming7D_Sole_janvier_dA_A_cembre__TargetFactor__targetFactorEquation (la première fois que j'ai regardé la liste j'avais même des @ ou un caractère du genre au milieu des A dans dA_A_cembre) au lieu de Beaming7D_Sole_janvier_décembre__TargetFactor__targetFactorEquation Est-ce que cela peut poser problème dans le déroulement d'une AS (surtout si je reprends une simu de l'AS avec les noms modifiés pour refaire une AS identique)? Loïc

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Fwd: Demande/Question n°129734 : Mise à jour du module R sur caparmor
by Eric Chatellier Feb. 28, 2012

Feb. 28, 2012

-------- Message original -------- Sujet: Demande/Question n°129734 : Mise à jour du module R sur caparmor Date : Mon, 27 Feb 2012 16:39:55 +0100 (CET) De : assistance(a)ifremer.fr Répondre à : Tina.Odaka(a)ifremer.fr Pour : noboby(a)ifremer.fr Copie à : chatellier(a)codelutin.com, dcroizef(a)ifremer.fr Bonjour, Votre demande n°129734 concernant " Mise à jour du module R sur caparmor " a été fermée. Réponse de l'assistance : ------------------------- R/patched-2.14.1-25.1-gnu is installed. version compiled by intel is beeing studied by one of our colleague,denis. he'll let you know once it is installed. tinal Bonne journée. L'assistance informatique RIC. --------------------------------------------------------- Dear user, Your question n°129734 about " Mise à jour du module R sur caparmor " has been closed. Response : -------------- R/patched-2.14.1-25.1-gnu is installed. version compiled by intel is beeing studied by one of our colleague,denis. he'll let you know once it is installed. tinal Regards.

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Impossible de modifier le TargetFactor pour un groupe dans ISIS
by Loic GASCHE Feb. 24, 2012

Feb. 24, 2012

Bonjour, Comme le fait que mes TargetFactors portaient tous le même nom (null(TargetFactor)) m'empêchait de faire tourner mes AS, j'ai entrepris de les renommer. Aucun soucis pour mes groupes "sole" et "plie", mais pour mon groupe "others" la plupart du temps je ne peux pas sauvegarder mes modifications et ISIS affiche le message que j'ai mis en PJ. Quelle pourrait-être la cause de cette erreur ? Question subsidiaire : j'ai dans la liste de mes équations de TargetFactor plusieurs équations sans nom qui ne me servent à rien, est-il possible de les supprimer afin de donner un peu plus de lisibilité à ma liste ? Loïc

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