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equation de prix : comment utiliser un resultat dans l equation ???
by Sigrid LEHUTA Sept. 9, 2009

Sept. 9, 2009

hello, je veux faire intervenir les débarquements du mois dans l'équation de prix, mais j'arrive pas :'( il me dit qu il y a une erreur dans l equation de prix et en effet quand je fais afficher la matrice des captures recupérée dans l equation de prix, il me renvoit "null". voici les deux techniques que j ai testées pour récupérer la matrice des captures (je sais toujours pas la difference entre les deux mais aucune ne marche) : Population pop = group.getPopulation(); String name = "ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP"; technique 1 : Date date2 = context.getSimulationStorage().getResultStorage().getLastDate(); MatrixND landing = context.getSimulationStorage().getResultStorage().getMatrix(date2,pop, name) ; technique 2 : Date date = context.getSimulationControl().getDate().previous(); MatrixND landing = context.getResultManager().getMatrix(date, pop, name) ; (j ai pris soin de mettre date.previous() au cas ou ca viendrait de getPrice() qui serait appelé avant la création de la nouvelle ligne de la matrice de captures mais je pense pas) Est ce parce que je m'y prends mal ou parce que je ne peux pas du tout la reccupérer ? merci beaucoup !!!! sig -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123) _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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vous n'utilisez pas le depot correct...??
by Sigrid LEHUTA Sept. 8, 2009

Sept. 8, 2009

Hello, C est le message que j ai eu ce matin en ouvrant la nouvelle version : "vous n'utilisez pas le depot correct pour votre version d'ISIS-Fish 3.2 voulez vous utilisez le depot correct ?" ou quelque chose dans ce gout là... Dans le doute j ai mis oui mais est ce que vous pourriez mettre un message dans FAQ expliquant la signification des messages comme celui ci et nous permettre de mesurer la potentielle gravité du clic ? ;-) Merci :-) Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 65 (interne : 8165) _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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seminaire ISIS-Fish
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr Sept. 7, 2009

Sept. 7, 2009

Bonjour à tous et désolée pour ce long silence. La liste des participants etant assez courte, le seminaire se desoulera finalement sur trois jours du 14 au 16 septembre. Une nouvelle session ouverte aussi aux non utilisateurs pourrait se dérouler au premier semestre 2010. Avec le CR du seminaire je preparerai un doodle pour identifier une periode qui satisfasse le plus grand nombre. Pour la semaine prochaine, chaque participant est supposé venir avec son ordinateur portable. Il serait préférable que chacun est téléchargée la nouvelle version d'ISIS et installé NetBeans (http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.…) pour les Tps de JAVA. Programme Séminaire des utilisateurs d'ISIS-Fish 14-15-6 septembre à NANTES * Lundi Matin : 10h-12h (intervenants : Stéphanie, Sigrid, Benjamin, Jean, Eric)* Présentation des évolutions de la V3.1 à la V3.2 Utilisation du WIKI Caparmor Installation de la V3.2 Installation de NetBeans Discussion *Lundi après-midi : 14h-18h **(intervenants : Benjamin, **Jean, Eric)* Démonstration de simulations avec la V3.2 en local et sur caparmor Interfaces de script Cours Java (syntaxe, API, manipulation des objets ISIS) Discussion *Mardi matin : 9h-12h **(intervenants : Benjamin, **Jean, Eric)* TP Java + reprise des scripts ISIS Debuggage Discussion *Mardi après-midi : 14h-18h **(intervenants : ** Stéphanie, ** **Jean)* TP analyse de sensibilité Discussion *Mercredi **(intervenants : Benjamin, **Jean, Eric)* Debuggage Au plaisir de vous voir la semaine prochaine! Stephanie _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Nouvelle version d'IsisFish 3.2 disponible au telechargement
by Eric Chatellier Sept. 7, 2009

Sept. 7, 2009

Bonjour, La nouvelle version d'IsisFish est a present disponible au telechargement. Il s'agit de la version 3.2. Cette version initie la branche 3.2 d'IsisFish, tous les utilisateurs sont invites a utiliser cette nouvelle version. Les versions 3.1 ne beneficieront plus d'aucun support. Avant de commencer ------------------ Cette version apporte de nouvelles fonctionnalites et de profonds changements. Avant toutes chose, il est conseille d'effectuer une sauvegarde de vos donnees a partir de la version 3.1.3 d'IsisFish. Action a effectuer: - exportez votre base de donnees de travail pour la V3.1.3 Dans l'interface de saisie de la pecherie, ouvrez votre region, et cliquez dans Fichier > Exporter la region et choisissez un repertoire pour enregistrer votre region - fermez maintenant IsisFish-3.1.3 - renommez le dossier "isis-database-3" en "isis-database-3.1.3" (ce dossier est normalement situe dans votre repertoire utilisateur, sous windows C:\Documents and settings\<user>\) Tele©chargement de la nouvelle version ------------------------------------- Rendez vous ensuite sur le site http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/. Dans le menu, dirigez vous ensuite sur "Telechargement". Et telechargez la derniere version (par exemple isis-fish-3.2.x.y-bin.zip). Decompressez l'archive que vous venez de telecharger. Apres avoir telecharge IsisFish -------------------------------- Lancez la nouvelle version en cliquant sur le fichier "go.bat" present dans le repertoire d'IsisFish apres decompression. IsisFish telecharge un nouveau "isis-database-3" et vous propose une migration de la base de donnees. Il vous proposera egalement cette migration pour toutes vos bases de donnees. Il est obligatoire d'accepter cette migration, sans quoi ces bases ne fonctionneront pas. Vous n'avez aucun problemes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Dans le cas ou vous n'auriez aucun probleme apparent (IsisFish se lance) verifiez quand meme que le fichier debug.txt ne contient aucune erreur. S'il en contient, n'hesitez pas a demander de l'aide sur isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en envoyant votre fichier debug.txt. Dirigez-vous dans l'interfaces des scripts et verifiez que vos scripts ne contiennent pas d'erreurs et compilent (en cliquant sur verifier). Vous avez des problemes ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Si vous avez des problemes (isis ne se lance pas, ou rien ne fonctionne). Envoyez un message a la liste isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en precisant le comportement d'IsisFish ou les erreurs rencontrees et accompagnez votre message du fichier debug.txt. Apres le premier lancement -------------------------- Si le premier lancement d'IsisFish s'est bien passe, vous pouvez : - reimporter vos bases de donnees (en acceptant la migration demandee normalement) - faire tourner une simulation Si la simulation n'a pas fonctionne, vous pouvez demander de l'aide sur isis-fish-users(a)list.isis-fish.org en joignant votre fichier debug.txt Vous pouvez ensuite, recopier vos anciens scripts (plans d'analyses, regles, export) depuis le dossier "isis-database-3.1.3" que vous avez sauvegarde vers le dossier "isis-database-3". N'oubliez pas ensuite de valider tous vos scripts dans l'interfaces dans l'interface de gestion des scripts et de verifier qu'ils compilent bien. Informations complementaires ---------------------------- Les informations complementaires concernant IsisFish sont presentes sur le wiki. En particulier : - le manuel : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… - les changements : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Valeur du paramètre calculé lors de la calibration
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr Sept. 4, 2009

Sept. 4, 2009

Bonjour à tous les utilisateurs d'ISIS, je relance ma petite question à propos de la calibration : le paramètre calculé a parfois des valeurs de l'ordre de 2e06 et d'autre fois des valeurs de 7e06 (selon pour quel groupe de taille je calibre la capturabilité). Cela signifie-t-il que dans le deuxième cas la calibration est mauvaise ou peu importe (juste choisir la valeur la plus faible de toutes les simus) ? Bien que la valeur du paramètre soit de 7e06, au bout de 50 - 60 simulations, elle reste assez stable et les valeurs des capturabilités ne changent quasiment plus...donc je suppose que la calib a bien marché ? Qui pourrait me confirmer / infirmer ces hypothèses ? Merci, Delphine _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Valeur considérée correcte du paramètre calculé pour la calibration
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr Sept. 1, 2009

Sept. 1, 2009

Bonjour à tous les ISIS-Fish Users, j'ai lancé plusieurs calibration, il semble que ça marche (enfin) plutôt bien. En tous cas, il n'y a plus de valeurs négatives et celles qui sortent semblent cohérentes. Mon ordi tourne pas trop mal jusqu'à environ 80/90 simulations...au-delà, il met à peu près 24h pour ajouter 2 simus supplémentaires...hum hum. Je me demandais s'il y a des valeurs du paramètre calculé considérées comme "bonnes" pour choisir nos valeurs de q1/q2 correspondantes ? Ou alors, comme suggéré, prendre la plus petite de toutes les simus... Mais bon, j'ai essayé de calibrer plusieurs valeurs de capturabilité, pour différents groupes. La calibration pour les 2 premiers groupes me donne une valeur de paramètre (la plus petite) de 2 539 540... et la calibration de 2 autres valeurs de capturabilité me donne le plus petit paramètre à 7 222 682....c'est la plus petite valeur après 86 simus...mais bien plus grande que pour la calibration des 2 autres capturabilités... Est-ce normal ou c'est que la recherche de la plus petite valeur n'était pas suffisamment aboutie ? Merci, Delphine _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Migration de la liste / List migration
by Benjamin POUSSIN Aug. 27, 2009

Aug. 27, 2009

Bonjour à tous, ISIS-fish a son propre domain isis-fish.org. Les listes de diffusions ont été migrées et tous les utilisateurs ont normalement du être réabonnés aux nouvelles listes. La nouvelle adresse de cette liste: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Nous sommes désolés des désagréments causés et vous remercions de votre soutien. Cordialement, L'équipe de développement. ---------------------------- Dear all, ISIS-fish has its own domain isis-fish.org. The mailing-lists have been migrated and everybody should have been automatically subscribing the new lists. New mail address for this list: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org We are sorry for the inconvenience, and thank you for your support. Best regards, The development team. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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[Isis-fish-user] Calibration : valeurs de q1 négatives...et emplacement d'un individu faisant la taille limite de classe
by Delphine.Rocklin＠ifremer.fr Aug. 24, 2009

Aug. 24, 2009

Bonjour à tous j'ai lancé plusieurs simus de calibration, mais les résultats me semblent bien étranges. Pour les 3 premières simus, il me calcule le paramètre en utilisant les 3 valeurs de M1, M2 et M3 proposées dans le script. Par contre, pour les simus suivantes, il n'a pas vraiment l'air de prendre en compte le pas de calcul de 1e-05. Il propose des valeurs de q1 négatives....je ne comprends pas trop pourquoi (fichier Historic.csv ci-joint). Est-ce que qqun a déjà eu ces soucis et pourrait m'expliquer le pourquoi du comment ? Sinon je n'ai pas reçu d'avis concernant l'emplacement d'un individu faisant la taille limite de 2 classes de taille...est-ce qu'un individu de 60 cm va dans la classe 50-60 ou dans la 60-70 ?? Merci ! delphine

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Re: [Isis-fish-user] Maillage
by Benjamin POUSSIN Aug. 4, 2009

Aug. 4, 2009

On Tue, 4 Aug 2009 15:50:16 +1100 "Bastien Preuss" <Bastien.Preuss(a)noumea.ird.nc> wrote: > Bonjour, > > > > Je voudrais savoir si la taille minimale de la maille et le nombre maximum > de mailles dans la région sont fixés dans Isis ou si cela ne dépend que je > la puissance de lordinateur utilisé. > > Dans mon cas, je voulais tester une maille assez fine : 0.001 degré, ce qui > représentait un nombre de mailles dans ma région égale à 1 million, bien > sure ça ne marche pas ! Normalement ca ne depend que de la puissance de la machine, mais je ne pense pas qu'actuellement il y ait des machines assez puissante pour supporter des calculs avec autant de maille dans des temps raisonnable. Je te conseil donc de diviser au moins par 100 ton nombre de maille. Il serait bien que quelqu'un se devoue pour faire des tests de difference de performance entre 10, 100, 1000, 10000 mailles avec le meme nombre de zone (et tous les memes objets). -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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[Isis-fish-user] Maillage
by Bastien Preuss Aug. 4, 2009

Aug. 4, 2009

Bonjour, Je voudrais savoir si la taille minimale de la maille et le nombre maximum de mailles dans la région sont fixés dans Isis ou si cela ne dépend que je la puissance de lordinateur utilisé. Dans mon cas, je voulais tester une maille assez fine : 0.001 degré, ce qui représentait un nombre de mailles dans ma région égale à 1 million, bien sure ça ne marche pas ! Merci. Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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