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Re: [Isis-fish-user] (sans objet)
by Benjamin POUSSIN June 26, 2008

June 26, 2008

On Wed, 25 Jun 2008 08:06:11 +0200 Paul.Marchal(a)ifremer.fr wrote: > Bonjour Benjamin, > > Désolé de te prendre à la gorge - j'imagine que tu as d'autres chats à > fouetter - mais je voulais savoir si tu avais une idée d'où provient > mon bug (cf mon mail d'hier avec les fichiers attachés). En fait, > j'aurais bien voulu, si possible, présenter quelques résultats pour la > semaine prochaine... Bonjour, Lorsque tu fais des simulations que sur les populations, il ne faut pas demander les resultats sur la peche, sinon il y a probleme. Donc dans l'interface de lancement des resultats il faut aller sur l'onglet *Export des resultats* et ne selectionner que Abundance, Biomass et RegionDefinition (si tu as besoins des exports) et dans l'onglet *Choix des resultats* tu selectionnes matrixAbundance et matrixBiomass. J'ai fait tourne des simulations avec les 3 pops sans problemes. Pour ce qui ait de faire tourner des simulations avec la strategie, il faut, comme te la signale hilaire, que pour chaque metier chaque mois fasse partie d'une saison et tu as quelques metier qui n'ont qu'une saison qui ne recouvre pas toute l'annee. (Cstr02Ensp, Cstr02Esp, Cstr03Ensp, Cstr03Esp). Je pense qu'ensuite tout devrait fonctionner (je croise les doigts ;) -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Re: [Isis-fish-user] (sans objet)
by hdrouine＠ifremer.fr June 24, 2008

June 24, 2008

Ben oui, je viens de commencer un post-doc au Canada, donc c'est encore une heure décente pour moi. Enfin j'envisage quand même de demander à Steph de me payer pour l'assistance 24h/24 ;-) Bon si c'est pas ça le problème je sèche... C'est pourtant bizarre car l'erreur indique un retour "pointeur nul" quand il fait l'opération getMetierZone. Tes saisons métiers recouvrent bien toute l'année et tu as bien une zone pour chaque saison? Si la réponse est oui aux 2 questions, je laisse les code lutins boys prendre le relai demain matin. A+ Hilaire Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : > Bonjour Hilaire, > > Merci pour ton mail (sympa l'aide en ligne 24h sur 24...). Tu es à > l'autre bout de la Terre ou bien tu tu as des horaires de travail pas > raisonnables? > > Je viens de revérifier, et tous mes métiers sont associés à une zone > géographique. > > Merci quand même > > Paul > > hdrouine(a)ifremer.fr a écrit : > >> Salut Paul, >> Vu que je dois être un des seuls connecté à cette heure là, je me >> permets de te répondre. Tu n'aurais pas un de tes métiers qui n'a >> pas de zone de pêche? autant que je sache c'est pas "permis" (même >> si le métier ne pêche pas, il faut malgré tout lui attribuer une >> zone) et fait planter la simu. >> A+ >> Hilaire >> >> >> >> Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : >> >>> Bonjour Benjamin, >>> >>> Merci, on avance pas à pas... >>> >>> Cette fois, j'ai pu lancer une simulation mais elle plante >>> probablement en raison d'un pb de saisie des inputs de la pêcherie >>> (j'ai essayé en prenant chacun de mes 3 stocks un à un, même >>> résultat). >>> >>> J'ai rajouté un port et vérifié qu'il y avait bien correspondance >>> entre zones de repro et zones de recrutement pour les 3 stocks que >>> j'ai conservés. >>> >>> Je t'envoie ma base de données et mon fichier d'erreur. Ci-dessous, >>> je te mets le fichier log de la simulation: >>> >>> " >>> INFO|11:33:34,514|SimulationHelper.java|402|localSimulateSameThread|6/24/08 11:33 AM Java version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: >>> 3.1.3 >>> INFO|11:33:34,530|SimulationHelper.java|270|changeClassLoader|Classloader >>> used for simulation: >>> fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader@d85f3c >>> [file:/C:/Documents%20and%20Settings/MarchalP.FISHREG/isis-database-3/simulations/%202008-06-24-11-00%202008-06-24-11-33/] >>> INFO|11:33:34,561|SimulationStorage.java|106|setParameter|DEBUG: >>> store param: {libLogLevel=error, preScript=, usePreScript=false, >>> inQueue=false, onlyExport=false, numberOfYear=1, >>> scriptLogLevel=info, simulLogLevel=info, rules=GraviteCPUE,, >>> useOptimization=true, useStatistic=false, >>> exportDirectory=C:\Documents and >>> Settings\MarchalP.FISHREG\isis-export, useAnalysePlan=false, >>> isisFishVersion=3.1.3, population.HokiEast.number=[[1.0E7, 1.0E7], >>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], >>> [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7]], >>> regionName=NZHOKI, local=true, populations=HokiEast, >>> description=First try using the eastern hoki stock only, >>> analysePlan=, plans=, simulatorName=DefaultSimulator.java, >>> strategies=FirstTry, analysePlanNumber=-1, exports=, >>> resultNames=matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixFuelCostsPerVessel,matrixBiomass,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixEffortPerStrategyMet,matrixCatchRatePerStrategyMet,matrixPrice,matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel,matrixFuelCostsOfTravelPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixFishingMortality,matrixEffortPerZonePop,matrixCrewSharePerStrategyPerVessel,matrixLandingPerMet,matrixDiscardsPerStrMet,matrixDiscardsWeightPerStrMet,matrixNoActivity,matrixCostsOfFishingPerVessel,matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet,matrixCatchPerStrategyMet,matrixFishingTimePerMonthPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet,matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy,matrixStdTravelEffortPerStrategyMet,matrixCatchWeightPerStrategyMet,matrixMetierZone,matrixSharedNotFixedCostsPerVessel,matrixAbundance,matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel,matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel,matrixOtherRunningCostsPerVessel,} >>> INFO|11:33:34,921|SimulationHelper.java|90|message|Mise en place >>> des aspects Cache >>> INFO|11:33:34,921|SimulationControl.java|126|setText|Mise en place >>> des aspects Cache >>> INFO|11:33:35,046|DataStorage.java|164|getMemStorage|Create new >>> memory storage for 2008-06-24-11-00 2008-06-24-11-33 >>> INFO|11:33:35,483|SimulationHelper.java|90|message|Simulation execution >>> INFO|11:33:35,483|SimulationControl.java|126|setText|Simulation execution >>> INFO|11:33:35,483|SimulationContext.java|291|message|Exécution des >>> scripts de Presimulation >>> INFO|11:33:35,483|SimulationControl.java|126|setText|Exécution des >>> scripts de Presimulation >>> INFO|11:33:35,983|SimulationControl.java|126|setText|Rules >>> initialisation:[rules.GraviteCPUE@ba5bfd] >>> INFO|11:33:36,061|DefaultSimulator.java|114|simulate|Rule >>> GraviteCPUE initialized >>> INFO|11:33:36,061|SimulationControl.java|126|setText|begin step janvier 0 >>> INFO|11:33:36,077|ResultManager.java|154|isEnabled|Enabled result: >>> [matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMet, matrixFuelCostsPerVessel, >>> matrixBiomass, >>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>> matrixEffortPerStrategyMet, matrixCatchRatePerStrategyMet, >>> matrixPrice, matrixNetValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMetPerVessel, >>> matrixFuelCostsOfTravelPerVessel, >>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>> matrixFishingMortality, matrixEffortPerZonePop, >>> matrixCrewSharePerStrategyPerVessel, matrixLandingPerMet, >>> matrixDiscardsPerStrMet, matrixDiscardsWeightPerStrMet, >>> matrixNoActivity, matrixCostsOfFishingPerVessel, >>> matrixRepairAndMaintenanceGearCostsPerVessel, >>> matrixGrossValueOfLandingsPerSpeciesPerStrategyMet, >>> matrixCatchPerStrategyMet, matrixFishingTimePerMonthPerVessel, >>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyPerVessel, >>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>> matrixGrossValueOfLandingsPerStrategyMet, >>> matrixVesselMarginOverVariableCostsPerStrategy, >>> matrixStdTravelEffortPerStrategyMet, >>> matrixCatchWeightPerStrategyMet, matrixMetierZone, >>> matrixSharedNotFixedCostsPerVessel, matrixAbundance, >>> matrixNetRenevueToSharePerStrategyMetPerVessel, >>> matrixOwnerMarginOverVariableCostsPerStrategyMetPerVessel, >>> matrixOtherRunningCostsPerVessel] >>> INFO|11:33:36,124|SimulationControl.java|126|setText|Evalute Rules >>> conditions (1 rules) >>> INFO|11:33:36,124|SimulationControl.java|126|setText|Do pre action Rules >>> ERROR|11:33:36,140|SimulationHelper.java|505|localSimulateSameThread|Error >>> during simulation >>> java.lang.NullPointerException >>> at >>> scripts.SiMatrix.aw$original$_AW_$getMetierZone$_AW_$scripts_SiMatrix(SiMatrix.java:214) >>> at >>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>> Source) >>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.realCall(Cache.java:133) >>> at fr.ifremer.isisfish.aspect.Cache.call(Cache.java:108) >>> at >>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.proceed(Unknown >>> Source) >>> at >>> scripts.SiMatrix_1_1301386247_1169520244___AW_JoinPoint.invoke(Unknown >>> Source) >>> at scripts.SiMatrix.getMetierZone(SiMatrix.java) >>> at simulators.DefaultSimulator.simulate(DefaultSimulator.java:194) >>> at >>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper.localSimulateSameThread(SimulationHelper.java:475) >>> at >>> fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationHelper$SimThread.run(SimulationHelper.java:385) >>> INFO|11:33:36,218|SimulationHelper.java|574|localSimulateSameThread|Simulation time: >>> 1.702 >>> " >>> >>> >>> Sinon, y aurait il un debugger que je je puisse utiliser, cela >>> permettrait peut-être de gagner du temps? >>> >>> Merci pour ton aide >>> >>> Paul >>> >>>> Bonjour, >>>> >>>> Regarde si dans le repertoire isis-database/scripts tu as des fichiers >>>> si ce n'est pas le cas, il est normale que les simulations ne >>>> fonctionnent pas. >>>> >>>> Il semble (pour une raison inconnu pour l'instant :)) que tu ne te >>>> connecte pas bien au svn. Donc tu peux recuperer le zip: >>>> >>>> http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-database-… >>>> >>>> Et mettre le contenu en plus de ce que tu as deja dans ton >>>> isis-database. Ce zip contient les scripts de simulation, et donc >>>> forcement sans eux ca ne peut pas fonctionner :). >>>> >>>> Pour ce qui est de la validite de ta region, il me semble qu'il y avait >>>> encore de petites erreurs (pas de port, et pas de correspondance zone >>>> repro/recu pour une population). >>>> >>>> Mais sinon, oui, tu n'as pas besoin de regle de gestion, tu peux meme >>>> simuler sans strategie pour simuler seulement la dynamique d'une >>>> population si tu le souhaites. >>>> >>>> Bon courage, et ne craque pas, on est presque ou bout :) >>>> >>>> -- >>>> Benjamin >>>> -------------------- >>>> tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 >>>> email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii >>>> http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii >>>> >>>> >>> >>> >>> >>> >> >> >> >> >> >> > > > > > >

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Re: [Isis-fish-user] (sans objet)
by hdrouine＠ifremer.fr June 24, 2008

June 24, 2008

Salut Paul, Vu que je dois être un des seuls connecté à cette heure là, je me permets de te répondre. Tu n'aurais pas un de tes métiers qui n'a pas de zone de pêche? autant que je sache c'est pas "permis" (même si le métier ne pêche pas, il faut malgré tout lui attribuer une zone) et fait planter la simu. A+ Hilaire Paul.Marchal(a)ifremer.fr a écrit : > Bonjour Benjamin, > > Merci, on avance pas à pas... > > Cette fois, j'ai pu lancer une simulation mais elle plante > probablement en raison d'un pb de saisie des inputs de la pêcherie > (j'ai essayé en prenant chacun de mes 3 stocks un à un, même > résultat). > > J'ai rajouté un port et vérifié qu'il y avait bien correspondance > entre zones de repro et zones de recrutement pour les 3 stocks que > j'ai conservés. > > Je t'envoie ma base de données et mon fichier d'erreur. Ci-dessous, > je te mets le fichier log de la simulation: > > " > INFO|11:33:34,514|SimulationHelper.java|402|localSimulateSameThread|6/24/08 > 11:33 AM Java version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: 3.1.3 > INFO|11:33:34,530|SimulationHelper.java|270|changeClassLoader|Classloader > used for simulation: > fr.ifremer.isisfish.aspect.AspectClassLoader@d85f3c > [file:/C:/Documents%20and%20Settings/MarchalP.FISHREG/isis-database-3/simulations/%202008-06-24-11-00%202008-06-24-11-33/] > INFO|11:33:34,561|SimulationStorage.java|106|setParameter|DEBUG: > store param: {libLogLevel=error, preScript=, usePreScript=false, > inQueue=false, onlyExport=false, numberOfYear=1, scriptLogLevel=info, > simulLogLevel=info, rules=GraviteCPUE,, useOptimization=true, > useStatistic=false, exportDirectory=C:\Documents and > Settings\MarchalP.FISHREG\isis-export, useAnalysePlan=false, > isisFishVersion=3.1.3, population.HokiEast.number=[[1.0E7, 1.0E7], > [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], > [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], > [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], > [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7], [1.0E7, 1.0E7]], > regionName=NZHOKI, local=true, populations=HokiEast, > description=First try using the eastern hoki stock only, > analysePlan=, plans=, simulatorName=DefaultSimulator.java, > strategies=FirstTry, analysePlanNumber=-1, exports=, > 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bien au svn. Donc tu peux recuperer le zip: >> >> http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-database-… >> >> Et mettre le contenu en plus de ce que tu as deja dans ton >> isis-database. Ce zip contient les scripts de simulation, et donc >> forcement sans eux ca ne peut pas fonctionner :). >> >> Pour ce qui est de la validite de ta region, il me semble qu'il y avait >> encore de petites erreurs (pas de port, et pas de correspondance zone >> repro/recu pour une population). >> >> Mais sinon, oui, tu n'as pas besoin de regle de gestion, tu peux meme >> simuler sans strategie pour simuler seulement la dynamique d'une >> population si tu le souhaites. >> >> Bon courage, et ne craque pas, on est presque ou bout :) >> >> -- >> Benjamin >> -------------------- >> tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 >> email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii >> http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii >> >> > > > >

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[Isis-fish-user] (sans objet)
by Paul.Marchal＠ifremer.fr June 20, 2008

June 20, 2008

Bonjour J'ai tenté l'installation d'ISIS-Fish 3, mais sans succès. Quand je lance l'application, j'ai le message: "Problème de connexion au serveur vcs, vérifier votre configuration, ou contactez-nous si le problème persiste" Quand je fais OK, la fenêtre "Premier démarrage type vcs SVN - version 3.1.1" s'affiche. Je rentre alors mes nom (Marchal), prénom (Paul) et courriel (paul.marchal(a)ifremer.fr) et je valide. Je reçois alors le message: "La configuration n'est pas valide. Modifier la configuration?" Si je fais "oui", je reviens à la fenêtre précedente, et si je fais "non", j'obtiens le message d'erreur attaché au corps de ce message. On m'a alors dit que le problème s'était déjà produit et que la solution était celle écrite ci-dessous: """ Sinon pour faire demarrer isis avec la version 3.1.3, il faudrait bouger les fichiers posant problemes: Dans le repertoire $HOME de l'utilisateur, renommer: .isis-config-3 en .isis-config-3.save isis-database-3 en isis-database-3.save ensuite vous lancez isis, il devrait demarrer sans probleme (je l'ai encore installer sur un serveur la semaine derniere sans probleme). Par contre vous n'avez pas du tout besoin de cle ssh, il faut vous mettre en anonyme et surtout avec une connexion internet qui permette de sortir sans proxy sur le web. Ensuite s'il y a des bases de la version 3 que vous souhaitez recuperer. Il faut arreter Isis. Puis copier les regions ou scripts souhaites depuis: isis-database-3.save dans le nouveau repertoire isis-database-3 a la meme place. """ J'ai essayé cette solution et voici le résultat des courses. Je rencontre déjà un problème quand j'essaye de changer .isis-config-3 en .isis-config-3.save, j'ai le message d'erreur suivant: "Vous devez spécifier un nom de fichier" Me disant que le but de l'opération est simplement de déplacer le fichier, je le renomme sans le point initial (i.e. isis-config-3.save). Je relance alors ISIS-Fish et je retrouve le même problème que décrit ci-dessus ("La configuration n'est pas valide. Modifier la configuration?"). Je vous remercie d'avance pour vos suggestions Bien cordialement Paul Marchal

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[Isis-fish-user] [Fwd: RE: ISIS-Fish application]
by Stephanie MAHEVAS June 16, 2008

June 16, 2008

Bonjour Tony, Benjamin... est-ce le même problème que Marion et Chirine? Merci de voir ca le plus vite possible. Bonne journee stephanie -------- Message original -------- Sujet: RE: ISIS-Fish application Date: Mon, 16 Jun 2008 12:39:02 +1200 De: MARCHAL, Paul <Paul.Marchal(a)seafood.co.nz> Pour: 'Benjamin POUSSIN' <poussin(a)codelutin.com>, Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> Bonjour, J'ai retenté l'installation d'ISIS-Fish 3, mais sans succès. Quand je lance l'application, j'ai le message: "Problème de connexion au serveur vcs, vérifier votre configuration, ou contactez-nous si le problème persiste" Quand je fais OK, la fenêtre "Premier démarrage type vcs SVN - version 3.1.1" s'affiche. Je rentre alors mes nom (Marchal), prénom (Paul) et courriel (paul.marchal(a)ifremer.fr) et je valide. Je reçois alors le message: "La configuration n'est pas valide. Modifier la configuration?" Si je fais "oui", je reviens à la fenêtre précedente, et si je fais "non", j'obtiens le message d'erreur attaché au corps de ce message. Je vous remercie d'avance de me m'aider à trouver la solution à mon problème Bien cordialement Paul Marchal -----Message d'origine----- De : Benjamin POUSSIN [mailto:poussin@codelutin.com] Envoyé : Thursday, May 29, 2008 10:36 PM À : Stephanie MAHEVAS Cc : MARCHAL, Paul Objet : Re: ISIS-Fish application On Fri, 16 May 2008 18:51:48 +0200 Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> wrote: > > > Stephanie MAHEVAS a écrit : > > Salut Paul > > > > en fait dans ta base il te manquait les scripts de simulation.... donc > > pas facile de faire tourner une simu. > > je l'ai rajoute mais ca plante quand meme. Tu as des erreurs de > > syntaxe dans des equations. > > Donc je te propose > > 1/ de convertir ta base dans la V3 car c'est beaucoup plus facile de > > debugger la V3 (les messages sont plus explicites) et tu pourras > > benificier des scripts deja ecrits (en plus tout le monde a oublie > > comment debugger la V2 d'ISIS-Fish ;-) ) - Benjamin regarde ca au > > plus vite (passge en V3 et debugagge). Bonjour, Voici la base en version 3. Pour l'importer, ouvrir l'interface de saisie de region de IsisV3. Dans le menu fichier, faire importer et selectionner le zip joint. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... INFO [main] (Resource.java:322) getClassPathURLsFromJarManifest - class-path jar to scan /C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS Fish/isis-fish-3.1.3/lib/isis-fish-3.1.3.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\isis-fish-3.1.3.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xmlrpc-2.0.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-lang-2.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\asm-attrs-1.5.4-snapshot.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\openmap-4.6.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-collections-3.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\spring-beans-2.0.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\j2ssh-core-0.2.2.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\bsh-2.0b1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\junit-3.8.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\svnkit-1.1.2.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\ganymed-ssh2-build210.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - 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jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-math-1.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-discovery-0.2.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\commons-jxpath-1.2.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\xerces-1.2.3.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\ant-optional-1.5.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\lutinj2r-0.1.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - jar to search C:\Paul\DPS\Theme_4\P2_DEMOSTEM\TRANZEF\Work\Step_3\ISIS Fish\isis-fish-3.1.3\lib\JRclient-RF503.jar INFO [main] (Resource.java:296) getURLs - 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en_US to en_GB [jar:file:/C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS%20Fish/isis-fish-3.1.3/lib/lutincommandline-ui-0.4.jar!/i18n/lutincommandline-ui] WARN [main] (I18nBundleManager.java:321) promuteFull - en_US to en_GB [jar:file:/C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS%20Fish/isis-fish-3.1.3/lib/lutinutil-0.29-SNAPSHOT.jar!/i18n/lutinutil] WARN [main] (I18nBundleManager.java:321) promuteFull - en_US to en_GB [jar:file:/C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS%20Fish/isis-fish-3.1.3/lib/lutincommandline-0.4.jar!/i18n/lutincommandline] WARN [main] (I18nBundleManager.java:321) promuteFull - en_US to en_GB [jar:file:/C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS%20Fish/isis-fish-3.1.3/lib/lutinmatrix-0.15.jar!/i18n/lutinmatrix] WARN [main] (I18nBundleManager.java:321) promuteFull - en_US to en_GB [jar:file:/C:/Paul/DPS/Theme_4/P2_DEMOSTEM/TRANZEF/Work/Step_3/ISIS%20Fish/isis-fish-3.1.3/lib/lutinwidget-0.10-SNAPSHOT.jar!/i18n/lutinwidget] INFO [main] (I18nBundleManager.java:167) load - Language <locale: en_US, encoding: ISO-8859-1,nbStences:1176>, nbEntries: 6, nbSentences: 1176 in 13.809ms INFO [main] (IsisFish.java:104) main - Launching Isis-fish ... [] INFO [main] (IsisFish.java:109) main - 6/16/08 12:30 PM Java version: 1.6.0_06-b02 Isis-fish version: 3.1.3 INFO [main] (Config.java:105) init - [main] INFO [main] (Config.java:105) init - [vcs] INFO [main] (SVNHelper.java:191) findTypeRepo - try svn url svn://labs.libre-entreprise.org/svnroot/isis-fish-data/tags (3.1.3) WARN [main] (SVNHelper.java:197) findTypeRepo - org.codelutin.vcs.VCSException: org.tmatesoft.svn.core.SVNException: svn: Connection refused: connect INFO [main] (I18nLoader.java:102) close - nb languages loaded : 1 INFO [main] (Language.java:183) close - Language <locale: en_US, encoding: ISO-8859-1,nbStences:1176> INFO [main] (I18nBundleManager.java:167) load - Language <locale: fr_FR, encoding: UTF-8,nbStences:1176>, nbEntries: 6, nbSentences: 1176 in 27.607ms INFO [main] (IsisFish.java:182) init - connectionState : ERROR INFO [main] (IsisFish.java:182) init - hasPreviousConfig : true INFO [main] (IsisFish.java:182) init - isTypeChanged : false INFO [main] (IsisFish.java:182) init - needMigration : false INFO [main] (MatrixFactory.java:68) <clinit> - Converter XML pour MatrixND ajoute INFO [main] (MatrixFactory.java:85) <clinit> - librairie topia non presente. Import/Export JDBC impossible ERROR [main] (IsisVcsConfig.java:434) validate - errors founds in configuration : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous org.codelutin.vcs.VCSException: the property [remoteDatabase] is mandatory but missed. ERROR [main] (IsisVcsConfig.java:554) validateConfig - org.codelutin.vcs.VCSRuntimeException: errors founds in configuration : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous org.codelutin.vcs.VCSException: the property [remoteDatabase] is mandatory but missed. INFO [AWT-EventQueue-0] (VCSConfigUI.java:266) actionPerformed - after ok : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous ERROR [main] (IsisVcsConfig.java:434) validate - errors founds in configuration : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous org.codelutin.vcs.VCSException: the property [remoteDatabase] is mandatory but missed. ERROR [main] (IsisVcsConfig.java:579) validateConfig - org.codelutin.vcs.VCSRuntimeException: errors founds in configuration : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous org.codelutin.vcs.VCSException: the property [remoteDatabase] is mandatory but missed. org.codelutin.vcs.VCSRuntimeException: errors founds in configuration : fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig@3e97df[vcs]<size:10/12> source:C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.isis-config-3 [databaseVersion] = 3.1.3 [hostName] = labs.libre-entreprise.org [keyFile] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\.ssh\id_dsa [localDatabasePath] = C:\Documents and Settings\MarchalP.FISHREG\isis-database-3 [noPassPhrase] = true [remotePath] = svnroot/isis-fish-data [type] = SVN [typeRepo] = null [useSshConnexion] = false [userName] = anonymous org.codelutin.vcs.VCSException: the property [remoteDatabase] is mandatory but missed. at fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig.validate(IsisVcsConfig.java:435) at fr.ifremer.isisfish.versionning.IsisVcsConfig.validateConfig(IsisVcsConfig.java:577) at fr.ifremer.isisfish.IsisContext.validateVCS(IsisContext.java:274) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.init(IsisFish.java:197) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.main(IsisFish.java:116)

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[Isis-fish-user] Presentation Isis-fish au RMLL 2008
by Benjamin POUSSIN June 15, 2008

June 15, 2008

Bonjour, Nous avons enfin officiellement notre presence au RMLL 2008 :) http://2008.rmll.info/Isis-FISH-Gesi.html Si vous passez par la cette ete, vous serez les bienvenus. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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[Isis-fish-user] mail resté sans reponse
by marion jarraya June 5, 2008

June 5, 2008

Bonjour à tous, Ce mail est une relance : nous n'avons pas eu de réponse à notre mail du 7 mai relatif à notre probleme d'ouverture de isis version 3.1.3. Pourriez vous nous aider s'il vous plait nous sommes bloquées par ce probleme. Merci beaucoup Marion Ci dessous le message du 7 mai : Bonjour à tous, Comme Chirine, j'ai essayé d'installer la version 3.1.3 sur mon ordi, et ISIS ne s'ouvre pas. Je telecharge le .zip sur mon disque dur et j'extrais les fichiers du zip egalement sur mon disque dur. Quand on double clique sur le fichier .bat, on a le message suivant : "Probleme de connection au serveur vcs, verifiez votre configuration, ou contactez nous si le probleme persiste". je clique sur OK, une autre fenetre apparaît intitulée : "premier démarrage type vcs SVN version 3.1.3" nos info perso apparaissent : nom prenom courriel et on a 3 boutons : "appliquer" "resert" et "annuler". -------------------------------- -quand on clique sur "appliquer", on a une fenetre intitulee : "erreur de chargement de la configuration" qui contient le message suivant : "la configuration n'est pas valide, modifier la configuration" avec 2 boutons "oui" et "non" En cliquant sur "oui" on retombe sur la fenetre de tout a l heure : premier demmarage type vcs SVN version 3.1.3 en cliquant sur "non", il ferme tout ------------------------------------------- - quand on clique sur "reset" après 1/2 heure rien ne se passe ---------------- j'ai jeté un oeil au site suivant : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/addSshKey.html pour tenter de créer la clef ssh, mais ce n est pas assez detaille pour qu on puise le faire tout seul : "Pour ce faire, lancer la commande <pre>isisfish --create-ssh-key</pre> ou <pre>isisfish -c</pre>. TODO Revoir ..." pas comprehensible pour nous ----------------------- je joins le fichier d'erreur Merci de votre aide Marion -- Ce message a été vérifié par MailScanner pour des virus ou des polluriels et rien de suspect n'a été trouvé. CRI UPVD http://www.univ-perp.fr

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[Isis-fish-user] probleme ouverture isis version 3.1.3
by marion jarraya May 13, 2008

May 13, 2008

Bonjour à tous, Comme Chirine, j'ai essayé d'installer la version 3.1.3 sur mon ordi, et ISIS ne s'ouvre pas. Je telecharge le .zip sur mon disque dur et j'extrais les fichiers du zip egalement sur mon disque dur. Quand on double clique sur le fichier .bat, on a le message suivant : "Probleme de connection au serveur vcs, verifiez votre configuration, ou contactez nous si le probleme persiste". je clique sur OK, une autre fenetre apparaît intitulée : "premier démarrage type vcs SVN version 3.1.3" nos info perso apparaissent : nom prenom courriel et on a 3 boutons : "appliquer" "resert" et "annuler". -------------------------------- -quand on clique sur "appliquer", on a une fenetre intitulee : "erreur de chargement de la configuration" qui contient le message suivant : "la configuration n'est pas valide, modifier la configuration" avec 2 boutons "oui" et "non" En cliquant sur "oui" on retombe sur la fenetre de tout a l heure : premier demmarage type vcs SVN version 3.1.3 en cliquant sur "non", il ferme tout ------------------------------------------- - quand on clique sur "reset" après 1/2 heure rien ne se passe ---------------- j'ai jeté un oeil au site suivant : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/addSshKey.html pour tenter de créer la clef ssh, mais ce n est pas assez detaille pour qu on puise le faire tout seul : "Pour ce faire, lancer la commande <pre>isisfish --create-ssh-key</pre> ou <pre>isisfish -c</pre>. TODO Revoir ..." pas comprehensible pour nous ----------------------- je joins le fichier d'erreur Merci de votre aide Marion ----------------------------------------------------- Marion VERDOIT-JARRAYA Maître de Conférences UMR 5244 CNRS-EPHE-UPVD Biologie et Ecologie tropicale et méditerranéenne CBETM, Université de Perpignan 52, avenue Paul Alduy 66860 Perpignan Cedex, France Tél. 33 (0) 4 68 66 20 55 (standard) Tél. 33 (0) 4 30 19 23 18 (direct) Fax : 33 (0)4 68 50 36 86 E-mail : marion.jarraya(a)univ-perp.fr http://cbetm.univ-perp.fr -- Ce message a été vérifié par MailScanner pour des virus ou des polluriels et rien de suspect n'a été trouvé. CRI UPVD http://www.univ-perp.fr

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[Isis-fish-user] Re : problème de lancement
by chirine HUSSEIN May 6, 2008

May 6, 2008

Bonjour, Jai téléchargé la nouvelle version 3.1.3, mais ça nest pas marché, le problème persiste et le ficher d'erreur dit "Unable to access jarfile lib/isis-fish-3.1.3.jar"? Merci pour votre aide. Cordialement, Chirine ----- Message d'origine ---- De : Tony Chemit <chemit(a)codelutin.com> À : Liste pour les utilisateurs du simulateur <isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org> Envoyé le : Vendredi, 25 Avril 2008, 14h54mn 15s Objet : Re: [Isis-fish-user] problème de lancement chirine HUSSEIN a écrit : > > Bonjour, > > Jai de nouveau un problème, je narrive pas à ouvrir ISIS FISH > (version 3.1.2). Il me demande de faire la configuration à nouveau > (premier démarrage), je le fais mais le problème continue. > > Pourrez vous contrôler le ficher derreur joint ? > > Merci pour votre aide. > > Chirine. > > > ------------------------------------------------------------------------ > Envoyé avec Yahoo! Mail > <http://us.rd.yahoo.com/mailuk/taglines/isp/control/*http://us.rd.yahoo.com/…>. > Une boite mail plus intelligente. > ------------------------------------------------------------------------ > > _______________________________________________ > Isis-fish-user mailing list > Isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org > http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-user Bonjour, Tout d'abord mes excuses pour la lenteur de cette réponse... Une nouvelle version 3.1.3 est en cours de test chez nous. Même si cette version n'est pas encore officiell, elle est d'ors et déjà disponible sur le site d'IsisFish. Voici l'adresse de téléchargement : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-fish-3.1.… Je vous invite à utiliser cette version plutôt que la version 3.1.2 car elle corrige un certain nombre de problèmes liés au démarrage de l'application. Si vous n'avez pas de données présentes dans votre base locale, je vous invite à supprimer ce répertoire pour éviter tout nouveau conflit... La version finale 3.1.3 devrait être annoncée prochainement. Cordialement, Tony. _______________________________________________ Isis-fish-user mailing list Isis-fish-user(a)lists.labs.libre-entreprise.org http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-user __________________________________________________ Do You Yahoo!? En finir avec le spam? Yahoo! Mail vous offre la meilleure protection possible contre les messages non sollicités http://mail.yahoo.fr Yahoo! Mail

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[Isis-fish-user] Une jolie page sur le wiki pour savoir ou se trouve les utilisateurs d'isis-fish
by Benjamin POUSSIN April 29, 2008

April 29, 2008

Salut, Vu que je ne sais jamais ou sont les utilisateurs d'isis-fish, je me suis amusé a faire une page pour avoir une vision cartographique de la chose :) http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki/isis_user_map Les gens qui ont un acces au wiki peuvent s'ajouter, il faut juste respecter la syntaxe (le mieux est de copier/coller une ligne existante et de la modifier. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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