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échec de lancement simu ISIS sur datarmor
by Antoine Ricouard June 3, 2026

June 3, 2026

Bonjour, J'ai lancé sur datarmor (queue omp) une série de simulation qui ont échoué avec le debug ISIS ci-joint. Il semble que les simulations ISIS sur scratch n'aient pas correctement démarré pour une raison que je n'arrive pas à comprendre. Merci pour toute aide, -- *Antoine RICOUARD* (PhD) Attaché Temporaire Enseignement et Recherche Aix-Marseille Université, Université de Toulon Institut Méditerranéen d'Océanologie (MIO) Campus de Luminy 13288 Marseille Cedex 9 France

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MatrixFishingMortality
by Stephanie MAHEVAS June 1, 2026

June 1, 2026

Bonjour pour tester un export (FishingMortalityPopZoneMois) à partir de la matrice MatrixFishingMortality, j'ai fait une simu "toute simple" avec le nouvel export et en selectionnant MatrixFishingMortality. Mon export est vide. Je pense que cela vient du fait que je n'ai pas MatrixFishingMortality dans les résultats. Je ne comprends pas pourquoi je n'ai pas MatrixFishingMortality dans les résultats. Merci d'aance pour l'aide Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditerranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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detecter la chaine 10-12 dans le nom du métier
by Sigrid LEHUTA May 29, 2026

May 29, 2026

hello ds une regle, je ne rentre pas dans une condition car il ne reconnait pas la chaine de characteres : déclaration du pattern ligne 71 condition l 251 Qu est ce que je fais mal ? Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Erreur d'importation de shapefiles sur ISIS-Fish
by laura.weingott＠ifremer.fr May 19, 2026

May 19, 2026

Bonjour, J'utilise ISIS-Fish 4.5.0.0 et j'ai récemment changé de région (passage de WestMed_EMU1_25-11_OK à WestMed_EMU1_25-11_calib2024MAJ) et je n'arrive pas à réimporter mes shapefiles zones dans cette nouvelle région. Cela fonctionnait dans l'ancienne région mais maintenant une fois la manipulation faite (onglet livre -> clique sur zone -> nouveau -> import depuis shapefile) le nouveau shapefile créé est vide. Comment l'expliquer ? Merci d'avance, Laura Weingott

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Simulation sur datarmor avec 4.5.0.0 - Laura Weingott
by laura.weingott＠ifremer.fr May 7, 2026

May 7, 2026

Bonjour la liste ! Je souhaite lancer une simulation sur datarmor. La version du logitiel ISIS-Fish que j'appelle dans mon pbs est 4.4.8.1. Il semblerait qu'elle ne soit pas compatible avec mon fichier zip issue du logitiel 4.5.0.0 que j'utilise actuellement. En effet la simulation, qui marche en local, ne fonctionne pas avec le zip 4.5.0.0 sur datarmor. A l'inverse, elle fonctionne avec un zip 4.4.8.1. Quelle est la version la plus récente que l'on puisse utiliser sur datarmor ? Merci d'avance, Laura Weingott

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remove object d'une liste
by slehuta May 4, 2026

May 4, 2026

Bonjour, j'ai un doute sur un code qui compile mais fait il ce que je veux. Le but c'est de boucler sur une liste et de supprimer certains elements de la liste si une condition est remplie. *Actuellement c'est codé comme ci-dessous (l'iterator est effort, la liste est reallocMet): et si la condition est remplie, on fait effort.remove() ca ne devrait il pas être : reallocMet.remove(effort) ? le code : List<EffortDescription> reallocMet = MetiersPossibles; // liste des metiers encore autorisés for (Iterator<EffortDescription> effort = reallocMet.iterator(); effort.hasNext(); ) { Metier met = effort.next().getPossibleMetiers(); if (StratMonthInfo.getProportionMetier(met) == 0) { effort.remove(); } *Accessoirement pourquoi on utilise un iterator et pas une boucle simple for(EffortDescription effort : reallocMet){ Merci !

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Erreur dans la valeur des biomasses - Laura Weingott
by lweingot April 28, 2026

April 28, 2026

Bonjour, En voulant lancer une simulation complète (application d'une dizaine de règles sur 10ans) j'ai été confronté à un problème de biomasse (et abondance). Celle-ci devient nulle puis réaugmente à des valeurs "normales" au cours d'une année de la simulation. Selon les simulations tentées pour trouver le problème l'année où l'erreur s'effectue varie entre 1 et 2 et les mois qui valent 0 ne sont pas toujours les mêmes. Je sais que : - La simulation de l'ensemble des règles sans TAC sur 10ans est OK - La simulation de 2 TAC ensemble est OK - La simulation de TailleMin avec 2 TAC est OK - La simulation de 7 règles issues de la simulation de départ sur 3 ans (contient 4 TAC, 1 TailleMin, 1 SdF et 1 red d'effort) n'est pas OK - La simulation de 2 TAC avec 1 SdF n'est pas OK. ---> On peut donc supposer que le problème vient de l'interaction de la règle TAC avec la règle SdF. Mais je n'arrive pas à identifier la source du problème. Pourriez-vous m'aider ? Vous trouverez ci-joint les règles TAC et SdF. les informations de lancement de la dernière simulation (2TAC et 1 SdF) et le log associé sont récupérables à l'adresse : https://we.tl/t-Sfie6Htjyn7xUH4C. Merci d'avance, Laura Weingott PS : règle TAC se nomme MCL_GearCountry_GEMMBE règle SdF se nomme EffortReduction_GEMMBE_SortieDeFlotteChaluts

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Re: [Isis-fish-users] modification des noms des flottilles/stratégies/métiers
by Sophie LEFORESTIER April 23, 2026

April 23, 2026

Bonjour, Je joins à ce mail les deux tables de correspondance flottille <-> stratégie et métier <-> zone métier, avec à chaque fois deux colonnes : nom_actuel et nouveau_nom. Merci ! Sophie On Thu, Apr 23, 2026 at 10:58 AM Stephanie MAHEVAS < Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> wrote: > ce mail ci ;) > > > -------- Message transféré -------- > Sujet : Re: [Isis-fish-users] modification des noms des > flottilles/stratégies/métiers > Date : Wed, 22 Apr 2026 11:50:49 +0200 > De : Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> > <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> > Organisation : IFREMER > Pour : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > > Hello > > Il faut préparer une table pour chaque type d'objet ISIS-FIsh > (Zone,Metier, Strategie, Flottille) avec 2 colonnes Nom-Actuel et > Nom-Nouveau, que l'on validera ensemble. > > Eric, nous écrira le script java qui lira correctement la table et fera le > changement de nom pour chaque type d'objet. > > a+ > > Steph > > > Le 16/04/2026 à 17:23, Sophie LEFORESTIER a écrit : > > Bonjour, > > Pour homogénéiser la base ISIS sur laquelle je travaille, je souhaiterais > modifier les noms des flottilles françaises en ajoutant le préfixe « fr » > aux flottilles, ainsi qu’aux stratégies et métiers associés. > > Est-ce qu’il existe un moyen simple de faire cette modif sans avoir à > recréer les flottilles, stratégies et métiers ? > > Merci ! > Sophie > > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing listIsis-fish-users@list.isis-fish.orghttps://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users > Archives et moteur de recherche: http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/ > > -- > ...................................................................... > Stephanie MAHEVAShttps://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ > UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) > IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier > IFREMER/LMH (Laboratoire Méditerranée Halieutique) > > Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex > Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 > Salle de réunion personnelle ZOOMhttps://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M3G2h.1 > > o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o > /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ > / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ > ...................................................................... > >

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urgent - question matResult
by Stephanie MAHEVAS April 23, 2026

April 23, 2026

Bonjour Eric j'ai une petite question urgente. On fait une simulation avec une regle MCL_GearCountry_GEMMBE, appelée 2 fois avec des parametres différentes regle MCL_GearCountry_GEMMBE(param_pop,listMetNames1) et MCL_GearCountry_GEMMBE(param_pop,listMetNames2) Dans cette règle, on cree une matrice TacPopMatrix qu'on la nomme avec un nom particulier TacPopMatrix.setName(MatrixTacPerPop.NAME+listMetNames) qu'on l'ajoute à matResult matResult.addResult(true,step,param_pop,TacPopMatrix); dans matResult à step, a t-on 2 matrices TacPopMatrix avec 2 noms différents ou la deuxieme matrice TacPopMatrix ecrase la première ? merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditerranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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modification des noms des flottilles/stratégies/métiers
by Sophie LEFORESTIER April 22, 2026

April 22, 2026

Bonjour, Pour homogénéiser la base ISIS sur laquelle je travaille, je souhaiterais modifier les noms des flottilles françaises en ajoutant le préfixe « fr » aux flottilles, ainsi qu’aux stratégies et métiers associés. Est-ce qu’il existe un moyen simple de faire cette modif sans avoir à recréer les flottilles, stratégies et métiers ? Merci ! Sophie

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