December 2014 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

paramètres d'AS qui impactent des simus (hors AS) ultérieures
by lgasche＠ifremer.fr 12 Dec '14

12 Dec '14

Bonjour, En testant mes nouvelles relations stock-recrutement, j'ai observé que ma biomasse de sole chutait extrêmement vite, à cause d'une mortalité naturelle très forte (simu réalisée sans pêche). Cette simu était issue d'une AS ou je testais plusieurs valeurs de mortalité naturelle. J'ai refait une AS sur un autre paramètre et ai rechargé une des simus de cette AS pour faire une nouvelle simu. Dans ce cas le taux de mortalité de mes soles était bien plus faible. Il me semble donc qu'en plus des choix des exports de résultats d'autres paramètres issus d'une AS se glissent dans des simus pour les modifier. Serait-il possible de vérifier si c'est effectivement le cas, et si oui de corriger ce problème ? Je ne sais pas comment font les autres mais moi je jongle en permanence entre AS et simu pour tester mes modifications de scripts et vérifier mes résultats, donc c'est plutôt gênant si on ne peut pas faire confiance à ses résultats de simu. Loïc

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Installation ISIS 4.3.1.1
by avigier 10 Dec '14

10 Dec '14

Bonjour, J'avais déjà signalé le problème pour une autre version, mais je ne retrouve pas de trace dans les archives. Je suis entrain d'installer ISIS sur un nouvel ordinateur, sous windows 7 avec une version récente de java (7 MàJ 67). Au moment de lancer le .bat, la fenêtre indiquant d'habitude "Isis starting..." s'ouvre et se referme immédiatement. Dans le debug, je récupère ça : " 'java' n'est pas reconnu en tant que commande interne ou externe, un programme ex‚cutable ou un fichier de commandes. " Pourtant, sur un autre ordinateur que j'utilisais hier encore, et où ISIS peut se lancer, j'ai la même version de Java, le fichier .sh est identique. Comment résoudre le problème? Audric

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Arrêt de simulations sous ISIS 4.3.1.1
by avigier 09 Dec '14

09 Dec '14

Bonjour, Très gros souci avec mes plans de simus. Tout d'abord, j'ai dû redémarrer mon PC cet après-midi suite à un bug très con (et complètement extérieur à ISIS) qui a complètement freezé mon PC. Une fois de retour sous ma session, je suis allé consulter les historiques de mes plans de simulations, et j'ai constaté que leur dernière MàJ date d'hier soir vers 18h, et non de l'heure du redémarrage du PC, ce qui veut dire que plus aucune simu ne se faisait depuis hier soir. Dans le debug, j'ai vu que, contrairement aux dernières fois où ce bug est survenu, il y avait des dizaines de milliers de lignes d'erreur à a fin (voir PJ). Une idée de ce qu'il s'est passé hier soir? Je relance mes simus ce soir ou demain matin sous la 4.4.0.0 Audric

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Erreur "cannot be resolved" dans scripts d'export d'AS
by lgasche＠ifremer.fr 09 Dec '14

09 Dec '14

Bonjour, J'essaye de tester des exports de résultats d'AS par zone, et j'observe une erreur étrange en vérifiant les scripts dans ISIS. Le message "cannot be resolved" ou "cannot be resolved to a type" apparait une dizaine de fois, en me disant que tel ou tel objet "cannot be resolved". Cette erreur n'apparait pas à chaque fois, et se produit autant pour de nouveaux scripts de mon VCS communauté (des en test comme des qui compilaient précédemment) que pour des scripts du VCS officiel. Une idée de la source de ce problème, et de comment le résoudre ? Loïc

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Pas de visualisation des résultats de simu dans ISIS (4.3.1.1 snapshot)
by lgasche＠ifremer.fr 09 Dec '14

09 Dec '14

Bonjour, Il est toujours impossible de visualiser les résultats d'une simu dans ISIS (quand on l'ouvre dans l'onglet "calculette"). On a bien le résumé mais aucun résultat n'est sélectionnable dans le menu déroulant en haut (que l'on soit en graphique ou matrice ne change rien), même quand on a bien pris soin de sélectionner les matrices de résultat que l'on veut avant de lancer la simu. J'ai bien les exports de résultats en .csv que j'ai sélectionnés par contre. Loïc

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impossible d'accéder aux librairies depuis le site ISIS
by lgasche＠ifremer.fr 08 Dec '14

08 Dec '14

Bonjour, Il est de nouveau impossible d'accéder aux librairies depuis le site ISIS (erreur 404). Est-il possible de mettre le lien à jour ? Loïc

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PB avec les exports de résultats aussi ?
by Loic GASCHE 05 Dec '14

05 Dec '14

Bonjour, Je me demande s'il n'y à pas également un problème avec les exports de résultats. J'ai fait une petite AS en ne demandant aucun export de résultats en .csv, et je me retrouve avec des exports de biomasse, de captures, etc. Se peut-il que ce soit encore un cas où des paramètres d'une ancienne simu que l'on charge persistent dans la nouvelle simu (et priment sur la sélection de la nouvelle simu puisque aucun export de résultat n'était sélectionné) ? Loïc

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Problème de démarrage d'As sur caparmor ?
by Loic GASCHE 05 Dec '14

05 Dec '14

Bonjour, J'ai lancé des AS pour tester les temps de simu avec la nouvelle version d'ISIS. En local sur le serveur pas de soucis, ça tourne (et plutôt pas mal : 12-13 minutes pour une simu complète). Par contre sur caparmor je reste bloqué à "attente du démarrage de la simulation", et l'AS n'apparait pas quand on fait un qstat. Ma config caparmor me semble correcte (peut-être des arguments qsub inutiles désormais mais je ne vois pas pourquoi cela bloquerait la simu), et je n'ai pour le moment pas réussi à trouver dans le debug la cause du non lancement de mon AS. Donc si quelqu'un a une idée je suis preneur ! Loïc

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Temps de simu qui augmente avec la taille de l'AS sur caparmor ?
by Loic GASCHE 04 Dec '14

04 Dec '14

Bonjour, Je reviens sur un problème déjà évoqué, et que j'observe à nouveau en faisant des tests d'AS sur caparmor : Plus l'AS est grosse et plus le temps de simulation pour chaque simu prise individuellement est élevé. Par exemple : AS de 6 simus en local : 12-13 minutes par simu AS de 8 simus sur caparmor : ~ 16 minutes par simu AS de 32 simus sur caparmor : ~ 20 minutes par simu Le problème est qu'on ne sait pas jusqu'où le temps de simu peut monter, ce qui est assez problématique quand on tente de prédire le temps nécessaire pour faire une (très) grosse AS. A-t-on une idée de la cause du problème ? Loïc

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Librairies JAva ISIS inaccessibles
by lgasche＠ifremer.fr 03 Dec '14

03 Dec '14

Bonjour, Sur le site ISIS on peut bien accéder à la "Documentation des APIs" mais impossible d'accéder aux "Librairies" (erreur 404), ce qui est plutôt embêtant quand on tente de modifier des scripts. Serait-il possible de mettre à jour les liens sur le site pour avoir à nouveau accès aux librairies ? Loïc

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